NUP214

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2OIT, 3FHC, 3FMO, 3FMP, 5DIS

Ідентифікатори

Символи

NUP214, CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, nucleoporin 214kDa, nucleoporin 214, IIAE9

Зовнішні ІД

OMIM: 114350 MGI: 1095411 HomoloGene: 38008 GeneCards: NUP214

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclear export signal receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear localization sequence binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore
Клітинна компонента	• гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • focal adhesion • нуклеоплазма • клітинне ядро • cytoplasmic side of nuclear pore • nuclear pore nuclear basket • nuclear pore central transport channel • ядерна пора • nuclear envelope • host cell
Біологічний процес	• mRNA transport • regulation of mRNA stability • regulation of cell cycle • protein export from nucleus • protein transport • GO:0022415 viral process • protein import into nucleus • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • regulation of nucleocytoplasmic transport • GO:0007067 мітоз • regulation of glycolytic process • tRNA export from nucleus • protein sumoylation • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8021


227720

Ensembl


ENSG00000126883


ENSMUSG00000001855

UniProt


P35658


Q80U93

RefSeq (мРНК)


NM_005085 NM_001318324 NM_001318325


NM_172268

RefSeq (білок)


NP_001305253 NP_001305254 NP_005076


NP_758472 NP_001395026

Локус (UCSC)

Хр. 9: 131.13 – 131.23 Mb

Хр. 2: 31.86 – 31.94 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NUP214 (англ. Nucleoporin 214) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 213 620^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDEMDAMIP	EREMKDFQFR	ALKKVRIFDS	PEELPKERSS	LLAVSNKYGL
VFAGGASGLQ	IFPTKNLLIQ	NKPGDDPNKI	VDKVQGLLVP	MKFPIHHLAL
SCDNLTLSAC	MMSSEYGSII	AFFDVRTFSN	EAKQQKRPFA	YHKLLKDAGG
MVIDMKWNPT	VPSMVAVCLA	DGSIAVLQVT	ETVKVCATLP	STVAVTSVCW
SPKGKQLAVG	KQNGTVVQYL	PTLQEKKVIP	CPPFYESDHP	VRVLDVLWIG
TYVFAIVYAA	ADGTLETSPD	VVMALLPKKE	EKHPEIFVNF	MEPCYGSCTE
RQHHYYLSYI	EEWDLVLAAS	AASTEVSILA	RQSDQINWES	WLLEDSSRAE
LPVTDKSDDS	LPMGVVVDYT	NQVEITISDE	KTLPPAPVLM	LLSTDGVLCP
FYMINQNPGV	KSLIKTPERL	SLEGERQPKS	PGSTPTTPTS	SQAPQKLDAS
AAAAPASLPP	SSPAAPIATF	SLLPAGGAPT	VFSFGSSSLK	SSATVTGEPP
SYSSGSDSSK	AAPGPGPSTF	SFVPPSKASL	APTPAASPVA	PSAASFSFGS
SGFKPTLEST	PVPSVSAPNI	AMKPSFPPST	SAVKVNLSEK	FTAAATSTPV
SSSQSAPPMS	PFSSASKPAA	SGPLSHPTPL	SAPPSSVPLK	SSVLPSPSGR
SAQGSSSPVP	SMVQKSPRIT	PPAAKPGSPQ	AKSLQPAVAE	KQGHQWKDSD
PVMAGIGEEI	AHFQKELEEL	KARTSKACFQ	VGTSEEMKML	RTESDDLHTF
LLEIKETTES	LHGDISSLKT	TLLEGFAGVE	EAREQNERNR	DSGYLHLLYK
RPLDPKSEAQ	LQEIRRLHQY	VKFAVQDVND	VLDLEWDQHL	EQKKKQRHLL
VPERETLFNT	LANNREIINQ	QRKRLNHLVD	SLQQLRLYKQ	TSLWSLSSAV
PSQSSIHSFD	SDLESLCNAL	LKTTIESHTK	SLPKVPAKLS	PMKQAQLRNF
LAKRKTPPVR	STAPASLSRS	AFLSQRYYED	LDEVSSTSSV	SQSLESEDAR
TSCKDDEAVV	QAPRHAPVVR	TPSIQPSLLP	HAAPFAKSHL	VHGSSPGVMG
TSVATSASKI	IPQGADSTML	ATKTVKHGAP	SPSHPISAPQ	AAAAAALRRQ
MASQAPAVNT	LTESTLKNVP	QVVNVQELKN	NPATPSTAMG	SSVPYSTAKT
PHPVLTPVAA	NQAKQGSLIN	SLKPSGPTPA	SGQLSSGDKA	SGTAKIETAV
TSTPSASGQF	SKPFSFSPSG	TGFNFGIITP	TPSSNFTAAQ	GATPSTKESS
QPDAFSSGGG	SKPSYEAIPE	SSPPSGITSA	SNTTPGEPAA	SSSRPVAPSG
TALSTTSSKL	ETPPSKLGEL	LFPSSLAGET	LGSFSGLRVG	QADDSTKPTN
KASSTSLTST	QPTKTSGVPS	GFNFTAPPVL	GKHTEPPVTS	SATTTSVAPP
AATSTSSTAV	FGSLPVTSAG	SSGVISFGGT	SLSAGKTSFS	FGSQQTNSTV
PPSAPPPTTA	ATPLPTSFPT	LSFGSLLSSA	TTPSLPMSAG	RSTEEATSSA
LPEKPGDSEV	SASAASLLEE	QQSAQLPQAP	PQTSDSVKKE	PVLAQPAVSN
SGTAASSTSL	VALSAEATPA	TTGVPDARTE	AVPPASSFSV	PGQTAVTAAA
ISSAGPVAVE	TSSTPIASST	TSIVAPGPSA	EAAAFGTVTS	GSSVFAQPPA
ASSSSAFNQL	TNNTATAPSA	TPVFGQVAAS	TAPSLFGQQT	GSTASTAAAT
PQVSSSGFSS	PAFGTTAPGV	FGQTTFGQAS	VFGQSASSAA	SVFSFSQPGF
SSVPAFGQPA	SSTPTSTSGS	VFGAASSTSS	SSSFSFGQSS	PNTGGGLFGQ
SNAPAFGQSP	GFGQGGSVFG	GTSAATTTAA	TSGFSFCQAS	GFGSSNTGSV
FGQAASTGGI	VFGQQSSSSS	GSVFGSGNTG	RGGGFFSGLG	GKPSQDAANK
NPFSSASGGF	GSTATSNTSN	LFGNSGAKTF	GGFASSSFGE	QKPTGTFSSG
GGSVASQGFG	FSSPNKTGGF	GAAPVFGSPP	TFGGSPGFGG	VPAFGSAPAF
TSPLGSTGGK	VFGEGTAAAS	AGGFGFGSSS	NTTSFGTLAS	QNAPTFGSLS
QQTSGFGTQS	SGFSGFGSGT	GGFSFGSNNS	SVQGFGGWRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, комплексі ядерної пори.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kraemer D., Wozniak R.W., Blobel G., Radu A. (1994). The human CAN protein, a putative oncogene product associated with myeloid leukemogenesis, is a nuclear pore complex protein that faces the cytoplasm. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 1519—1523. PMID 8108440 DOI:10.1073/pnas.91.4.1519
Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
Carman J.A., Nadler S.G. (2004). Direct association of tristetraprolin with the nucleoporin CAN/Nup214. Biochem. Biophys. Res. Commun. 315: 445—449. PMID 14766228 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.01.080
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Pasdeloup D., Blondel D., Isidro A.L., Rixon F.J. (2009). Herpesvirus capsid association with the nuclear pore complex and viral DNA release involve the nucleoporin CAN/Nup214 and the capsid protein pUL25. J. Virol. 83: 6610—6623. PMID 19386703 DOI:10.1128/JVI.02655-08

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Nucleoporin 214 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8064 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35658 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.