OGDH

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3ERY

Ідентифікатори

Символи

OGDH, AKGDH, E1k, OGDC, oxoglutarate dehydrogenase, KGD1, OGDH2, OGDHD

Зовнішні ІД

OMIM: 613022 MGI: 1098267 HomoloGene: 55662 GeneCards: OGDH

Онтологія гена
Молекулярна функція	• oxoglutarate dehydrogenase (NAD+) activity • зв'язування з іоном металу • oxidoreductase activity • oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor • oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity • thiamine pyrophosphate binding • heat shock protein binding • chaperone binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • мітохондріальна мембрана • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • oxoglutarate dehydrogenase complex • клітинне ядро
Біологічний процес	• гліколіз • olfactory bulb mitral cell layer development • thalamus development • generation of precursor metabolites and energy • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • NADH metabolic process • cerebellar cortex development • pyramidal neuron development • обмін речовин • hippocampus development • striatum development • 2-oxoglutarate metabolic process • succinyl-CoA metabolic process • histone succinylation • цикл трикарбонових кислот • lysine catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4967


18293

Ensembl


ENSG00000105953


ENSMUSG00000020456

UniProt


Q02218


Q60597

RefSeq (мРНК)


NM_001003941 NM_001165036 NM_002541 NM_001363523

NM_001252282 NM_001252283 NM_001252287 NM_001252288 NM_010956
NM_001361902 NM_001361903 NM_001361904 NM_001361905

RefSeq (білок)


NP_001003941 NP_001158508 NP_002532 NP_001350452

NP_001239211 NP_001239212 NP_001239216 NP_001239217 NP_035086
NP_001348831 NP_001348832 NP_001348833 NP_001348834

Локус (UCSC)

Хр. 7: 44.61 – 44.71 Mb

Хр. 11: 6.24 – 6.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OGDH (англ. Oxoglutarate dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 023 амінокислот, а молекулярна маса — 115 935^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFHLRTCAAK	LRPLTASQTV	KTFSQNRPAA	ARTFQQIRCY	SAPVAAEPFL
SGTSSNYVEE	MYCAWLENPK	SVHKSWDIFF	RNTNAGAPPG	TAYQSPLPLS
RGSLAAVAHA	QSLVEAQPNV	DKLVEDHLAV	QSLIRAYQIR	GHHVAQLDPL
GILDADLDSS	VPADIISSTD	KLGFYGLDES	DLDKVFHLPT	TTFIGGQESA
LPLREIIRRL	EMAYCQHIGV	EFMFINDLEQ	CQWIRQKFET	PGIMQFTNEE
KRTLLARLVR	STRFEEFLQR	KWSSEKRFGL	EGCEVLIPAL	KTIIDKSSEN
GVDYVIMGMP	HRGRLNVLAN	VIRKELEQIF	CQFDSKLEAA	DEGSGDVKYH
LGMYHRRINR	VTDRNITLSL	VANPSHLEAA	DPVVMGKTKA	EQFYCGDTEG
KKVMSILLHG	DAAFAGQGIV	YETFHLSDLP	SYTTHGTVHV	VVNNQIGFTT
DPRMARSSPY	PTDVARVVNA	PIFHVNSDDP	EAVMYVCKVA	AEWRSTFHKD
VVVDLVCYRR	NGHNEMDEPM	FTQPLMYKQI	RKQKPVLQKY	AELLVSQGVV
NQPEYEEEIS	KYDKICEEAF	ARSKDEKILH	IKHWLDSPWP	GFFTLDGQPR
SMSCPSTGLT	EDILTHIGNV	ASSVPVENFT	IHGGLSRILK	TRGEMVKNRT
VDWALAEYMA	FGSLLKEGIH	IRLSGQDVER	GTFSHRHHVL	HDQNVDKRTC
IPMNHLWPNQ	APYTVCNSSL	SEYGVLGFEL	GFAMASPNAL	VLWEAQFGDF
HNTAQCIIDQ	FICPGQAKWV	RQNGIVLLLP	HGMEGMGPEH	SSARPERFLQ
MCNDDPDVLP	DLKEANFDIN	QLYDCNWVVV	NCSTPGNFFH	VLRRQILLPF
RKPLIIFTPK	SLLRHPEARS	SFDEMLPGTH	FQRVIPEDGP	AAQNPENVKR
LLFCTGKVYY	DLTRERKARD	MVGQVAITRI	EQLSPFPFDL	LLKEVQKYPN
AELAWCQEEH	KNQGYYDYVK	PRLRTTISRA	KPVWYAGRDP	AAAPATGNKK
THLTELQRLL	DTAFDLDVFK	NFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як гліколіз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, тіамін-пірофосфатом. Локалізований у мітохондрії.

Література

Koike K., Urata Y., Goto S. (1992). Cloning and nucleotide sequence of the cDNA encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1963—1967. PMID 1542694 DOI:10.1073/pnas.89.5.1963
Koike K. (1995). The gene encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase: structural organization and mapping to chromosome 7p13-p14. Gene. 159: 261—266. PMID 7622061 DOI:10.1016/0378-1119(95)00086-L
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry. Proteomics. 7: 868—874. PMID 17370265 DOI:10.1002/pmic.200600410
Armstrong C.T., Anderson J.L., Denton R.M. (2014). Studies on the regulation of the human E1 subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, including the identification of a novel calcium-binding site. Biochem. J. 459: 369—381. PMID 24495017 DOI:10.1042/BJ20131664

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8124 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q02218 (англ.) . Архів оригіналу за 16 січня 2018. Процитовано 22 серпня 2017.