OGDH |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f4/PDB_3ery_EBI.png/250px-PDB_3ery_EBI.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | OGDH, AKGDH, E1k, OGDC, oxoglutarate dehydrogenase, KGD1, OGDH2, OGDHD |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 613022 MGI: 1098267 HomoloGene: 55662 GeneCards: OGDH |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • oxoglutarate dehydrogenase (NAD+) activity • зв'язування з іоном металу • oxidoreductase activity • oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor • oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity • thiamine pyrophosphate binding • heat shock protein binding • chaperone binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • мітохондріальна мембрана • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • oxoglutarate dehydrogenase complex • клітинне ядро |
---|
Біологічний процес | • гліколіз • olfactory bulb mitral cell layer development • thalamus development • generation of precursor metabolites and energy • tangential migration from the subventricular zone to the olfactory bulb • NADH metabolic process • cerebellar cortex development • pyramidal neuron development • обмін речовин • hippocampus development • striatum development • 2-oxoglutarate metabolic process • succinyl-CoA metabolic process • histone succinylation • цикл трикарбонових кислот • lysine catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001003941 NM_001165036 NM_002541 NM_001363523 |
| NM_001252282 NM_001252283 NM_001252287 NM_001252288 NM_010956
| NM_001361902 NM_001361903 NM_001361904 NM_001361905 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001003941 NP_001158508 NP_002532 NP_001350452 |
| NP_001239211 NP_001239212 NP_001239216 NP_001239217 NP_035086
| NP_001348831 NP_001348832 NP_001348833 NP_001348834 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 44.61 – 44.71 Mb | Хр. 11: 6.24 – 6.31 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
OGDH (англ. Oxoglutarate dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 023 амінокислот, а молекулярна маса — 115 935[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MFHLRTCAAK | | LRPLTASQTV | | KTFSQNRPAA | | ARTFQQIRCY | | SAPVAAEPFL |
SGTSSNYVEE | | MYCAWLENPK | | SVHKSWDIFF | | RNTNAGAPPG | | TAYQSPLPLS |
RGSLAAVAHA | | QSLVEAQPNV | | DKLVEDHLAV | | QSLIRAYQIR | | GHHVAQLDPL |
GILDADLDSS | | VPADIISSTD | | KLGFYGLDES | | DLDKVFHLPT | | TTFIGGQESA |
LPLREIIRRL | | EMAYCQHIGV | | EFMFINDLEQ | | CQWIRQKFET | | PGIMQFTNEE |
KRTLLARLVR | | STRFEEFLQR | | KWSSEKRFGL | | EGCEVLIPAL | | KTIIDKSSEN |
GVDYVIMGMP | | HRGRLNVLAN | | VIRKELEQIF | | CQFDSKLEAA | | DEGSGDVKYH |
LGMYHRRINR | | VTDRNITLSL | | VANPSHLEAA | | DPVVMGKTKA | | EQFYCGDTEG |
KKVMSILLHG | | DAAFAGQGIV | | YETFHLSDLP | | SYTTHGTVHV | | VVNNQIGFTT |
DPRMARSSPY | | PTDVARVVNA | | PIFHVNSDDP | | EAVMYVCKVA | | AEWRSTFHKD |
VVVDLVCYRR | | NGHNEMDEPM | | FTQPLMYKQI | | RKQKPVLQKY | | AELLVSQGVV |
NQPEYEEEIS | | KYDKICEEAF | | ARSKDEKILH | | IKHWLDSPWP | | GFFTLDGQPR |
SMSCPSTGLT | | EDILTHIGNV | | ASSVPVENFT | | IHGGLSRILK | | TRGEMVKNRT |
VDWALAEYMA | | FGSLLKEGIH | | IRLSGQDVER | | GTFSHRHHVL | | HDQNVDKRTC |
IPMNHLWPNQ | | APYTVCNSSL | | SEYGVLGFEL | | GFAMASPNAL | | VLWEAQFGDF |
HNTAQCIIDQ | | FICPGQAKWV | | RQNGIVLLLP | | HGMEGMGPEH | | SSARPERFLQ |
MCNDDPDVLP | | DLKEANFDIN | | QLYDCNWVVV | | NCSTPGNFFH | | VLRRQILLPF |
RKPLIIFTPK | | SLLRHPEARS | | SFDEMLPGTH | | FQRVIPEDGP | | AAQNPENVKR |
LLFCTGKVYY | | DLTRERKARD | | MVGQVAITRI | | EQLSPFPFDL | | LLKEVQKYPN |
AELAWCQEEH | | KNQGYYDYVK | | PRLRTTISRA | | KPVWYAGRDP | | AAAPATGNKK |
THLTELQRLL | | DTAFDLDVFK | | NFS |
Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як гліколіз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, тіамін-пірофосфатом. Локалізований у мітохондрії.
Література
- Koike K., Urata Y., Goto S. (1992). Cloning and nucleotide sequence of the cDNA encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1963—1967. PMID 1542694 DOI:10.1073/pnas.89.5.1963
- Koike K. (1995). The gene encoding human 2-oxoglutarate dehydrogenase: structural organization and mapping to chromosome 7p13-p14. Gene. 159: 261—266. PMID 7622061 DOI:10.1016/0378-1119(95)00086-L
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry. Proteomics. 7: 868—874. PMID 17370265 DOI:10.1002/pmic.200600410
- Armstrong C.T., Anderson J.L., Denton R.M. (2014). Studies on the regulation of the human E1 subunit of the 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, including the identification of a novel calcium-binding site. Biochem. J. 459: 369—381. PMID 24495017 DOI:10.1042/BJ20131664
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8124 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q02218 (англ.) . Архів оригіналу за 16 січня 2018. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |