PABPC4

Ідентифікатори

Символи

PABPC4, APP-1, APP1, PABP4, iPABP, poly(A) binding protein cytoplasmic 4

Зовнішні ІД

OMIM: 603407 MGI: 2385206 HomoloGene: 37855 GeneCards: PABPC4

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• poly(C) RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • nucleic acid binding • poly(U) RNA binding • RNA binding • mRNA binding • mRNA 3'-UTR binding
Клітинна компонента	• cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Деградація РНК • зсідання крові • Біосинтез білків • regulation of mRNA stability • myeloid cell development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8761


230721

Ensembl


ENSG00000090621


ENSMUSG00000011257

UniProt


Q13310


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_003819 NM_001135653 NM_001135654


NM_130881 NM_148917 NM_001356377

RefSeq (білок)


NP_001129125 NP_001129126 NP_003810


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 1: 39.56 – 39.58 Mb

Хр. 4: 123.16 – 123.19 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PABPC4 (англ. Poly(A) binding protein cytoplasmic 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 644 амінокислот, а молекулярна маса — 70 783^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNAAASSYPM	ASLYVGDLHS	DVTEAMLYEK	FSPAGPVLSI	RVCRDMITRR
SLGYAYVNFQ	QPADAERALD	TMNFDVIKGK	PIRIMWSQRD	PSLRKSGVGN
VFIKNLDKSI	DNKALYDTFS	AFGNILSCKV	VCDENGSKGY	AFVHFETQEA
ADKAIEKMNG	MLLNDRKVFV	GRFKSRKERE	AELGAKAKEF	TNVYIKNFGE
EVDDESLKEL	FSQFGKTLSV	KVMRDPNGKS	KGFGFVSYEK	HEDANKAVEE
MNGKEISGKI	IFVGRAQKKV	ERQAELKRKF	EQLKQERISR	YQGVNLYIKN
LDDTIDDEKL	RKEFSPFGSI	TSAKVMLEDG	RSKGFGFVCF	SSPEEATKAV
TEMNGRIVGS	KPLYVALAQR	KEERKAHLTN	QYMQRVAGMR	ALPANAILNQ
FQPAAGGYFV	PAVPQAQGRP	PYYTPNQLAQ	MRPNPRWQQG	GRPQGFQGMP
SAIRQSGPRP	TLRHLAPTGS	ECPDRLAMDF	GGAGAAQQGL	TDSCQSGGVP
TAVQNLAPRA	AVAAAAPRAV	APYKYASSVR	SPHPAIQPLQ	APQPAVHVQG
QEPLTASMLA	AAPPQEQKQM	LGERLFPLIQ	TMHSNLAGKI	TGMLLEIDNS
ELLHMLESPE	SLRSKVDEAV	AVLQAHHAKK	EAAQKVGAVA	AATS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Yang H., Duckett C.S., Lindsten T. (1995). iPABP, an inducible poly(A)-binding protein detected in activated human T cells. Mol. Cell. Biol. 15: 6770—6776. PMID 8524242 DOI:10.1128/MCB.15.12.6770
Houng A.K., Maggini L., Clement C.Y., Reed G.L. (1997). Identification and structure of activated-platelet protein-1, a protein with RNA-binding domain motifs that is expressed by activated platelets. Eur. J. Biochem. 243: 209—218. PMID 9030741 DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.0209a.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Poly(A) binding protein cytoplasmic 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8557 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13310 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.