PATJ |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1VF6, 2D92, 2DAZ, 2DB5, 2DLU, 2DM8, 2DMZ, 2EHR, 4Q2N | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PATJ, Cipp, InaD-like, hINADL, INADL, crumbs cell polarity complex component, PATJ crumbs cell polarity complex component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603199 MGI: 1277960 HomoloGene: 72199 GeneCards: PATJ |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • клітинна мембрана • apical part of cell • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction • центросома • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • міжклітинні контакти • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0007243 intracellular signal transduction • bicellular tight junction assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_005799 NM_176877 NM_176878 NM_001350145 |
| | NM_001005784 NM_001005787 NM_007704 NM_172696 NM_001355177 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001005784 NP_001005787 NP_031730 NP_766284 NP_001342106 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 61.74 – 62.18 Mb | Хр. 4: 98.28 – 98.61 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PATJ (англ. PATJ, crumbs cell polarity complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 801 амінокислот, а молекулярна маса — 196 368[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPENPATDKL | | QVLQVLDRLK | | MKLQEKGDTS | | QNEKLSMFYE | | TLKSPLFNQI |
LTLQQSIKQL | | KGQLNHIPSD | | CSANFDFSRK | | GLLVFTDGSI | | TNGNVHRPSN |
NSTVSGLFPW | | TPKLGNEDFN | | SVIQQMAQGR | | QIEYIDIERP | | STGGLGFSVV |
ALRSQNLGKV | | DIFVKDVQPG | | SVADRDQRLK | | ENDQILAINH | | TPLDQNISHQ |
QAIALLQQTT | | GSLRLIVARE | | PVHTKSSTSS | | SLNDTTLPET | | VCWGHVEEVE |
LINDGSGLGF | | GIVGGKTSGV | | VVRTIVPGGL | | ADRDGRLQTG | | DHILKIGGTN |
VQGMTSEQVA | | QVLRNCGNSV | | RMLVARDPAG | | DISVTPPAPA | | ALPVALPTVA |
SKGPGSDSSL | | FETYNVELVR | | KDGQSLGIRI | | VGYVGTSHTG | | EASGIYVKSI |
IPGSAAYHNG | | HIQVNDKIVA | | VDGVNIQGFA | | NHDVVEVLRN | | AGQVVHLTLV |
RRKTSSSTSP | | LEPPSDRGTV | | VEPLKPPALF | | LTGAVETETN | | VDGEDEEIKE |
RIDTLKNDNI | | QALEKLEKVP | | DSPENELKSR | | WENLLGPDYE | | VMVATLDTQI |
ADDAELQKYS | | KLLPIHTLRL | | GVEVDSFDGH | | HYISSIVSGG | | PVDTLGLLQP |
EDELLEVNGM | | QLYGKSRREA | | VSFLKEVPPP | | FTLVCCRRLF | | DDEASVDEPR |
RTETSLPETE | | VDHNMDVNTE | | EDDDGELALW | | SPEVKIVELV | | KDCKGLGFSI |
LDYQDPLDPT | | RSVIVIRSLV | | ADGVAERSGG | | LLPGDRLVSV | | NEYCLDNTSL |
AEAVEILKAV | | PPGLVHLGIC | | KPLVEDNEEE | | SCYILHSSSN | | EDKTEFSGTI |
HDINSSLILE | | APKGFRDEPY | | FKEELVDEPF | | LDLGKSFHSQ | | QKEIEQSKEA |
WEMHEFLTPR | | LQEMDEEREI | | LVDEEYELYQ | | DPSPSMELYP | | LSHIQEATPV |
PSVNELHFGT | | QWLHDNEPSE | | SQEARTGRTV | | YSQEAQPYGY | | CPENVMKENF |
VMESLPSVPS | | TEGNSQQGRF | | DDLENLNSLA | | KTSLDLGMIP | | NDVQGPSLLI |
DLPVVAQRRE | | QEDLPLYQHQ | | ATRVISKASA | | YTGMLSSRYA | | TDTCELPERE |
EGEGEETPNF | | SHWGPPRIVE | | IFREPNVSLG | | ISIVGGQTVI | | KRLKNGEELK |
GIFIKQVLED | | SPAGKTNALK | | TGDKILEVSG | | VDLQNASHSE | | AVEAIKNAGN |
PVVFIVQSLS | | STPRVIPNVH | | NKANKITGNQ | | NQDTQEKKEK | | RQGTAPPPMK |
LPPPYKALTD | | DSDENEEEDA | | FTDQKIRQRY | | ADLPGELHII | | ELEKDKNGLG |
LSLAGNKDRS | | RMSIFVVGIN | | PEGPAAADGR | | MRIGDELLEI | | NNQILYGRSH |
QNASAIIKTA | | PSKVKLVFIR | | NEDAVNQMAV | | TPFPVPSSSP | | SSIEDQSGTE |
PISSEEDGSV | | EVGIKQLPES | | ESFKLAVSQM | | KQQKYPTKVS | | FSSQEIPLAP |
ASSYHSTDAD | | FTGYGGFQAP | | LSVDPATCPI | | VPGQEMIIEI | | SKGRSGLGLS |
IVGGKDTPLN | | AIVIHEVYEE | | GAAARDGRLW | | AGDQILEVNG | | VDLRNSSHEE |
AITALRQTPQ | | KVRLVVYRDE | | AHYRDEENLE | | IFPVDLQKKA | | GRGLGLSIVG |
KRNGSGVFIS | | DIVKGGAADL | | DGRLIQGDQI | | LSVNGEDMRN | | ASQETVATIL |
KCAQGLVQLE | | IGRLRAGSWT | | SARTTSQNSQ | | GSQQSAHSSC | | HPSFAPVITG |
LQNLVGTKRV | | SDPSQKNSGT | | DMEPRTVEIN | | RELSDALGIS | | IAGGRGSPLG |
DIPVFIAMIQ | | ASGVAARTQK | | LKVGDRIVSI | | NGQPLDGLSH | | ADVVNLLKNA |
YGRIILQVVA | | DTNISAIAAQ | | LENMSTGYHL | | GSPTAEHHPE | | DTEEQLQMTA |
D |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.
Література
- Philipp S., Flockerzi V. (1997). Molecular characterization of a novel PDZ domain protein with homology to INAD from Drosophila melanogaster. FEBS Lett. 413: 243—248. PMID 9280290 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00877-6
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Roh M.H., Liu C.-J., Laurinec S., Margolis B. (2002). The carboxyl terminus of zona occludens-3 binds and recruits a mammalian homologue of discs lost to tight junctions. J. Biol. Chem. 277: 27501—27509. PMID 12021270 DOI:10.1074/jbc.M201177200
- Nakajima H., Tanoue T. (2011). Lulu2 regulates the circumferential actomyosin tensile system in epithelial cells through p114RhoGEF. J. Cell Biol. 195: 245—261. PMID 22006950 DOI:10.1083/jcb.201104118
- Li Y., Karnak D., Demeler B., Margolis B., Lavie A. (2004). Structural basis for L27 domain-mediated assembly of signaling and cell polarity complexes. EMBO J. 23: 2723—2733. PMID 15241471 DOI:10.1038/sj.emboj.7600294
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PATJ переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28881 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NI35 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |