PCDHB12 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PCDHB12, PCDH-BETA12, protocadherin beta 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606338 MGI: 2136757 HomoloGene: 128411 GeneCards: PCDHB12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • адгезія клітин • нейробіологія розвитку • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • chemical synaptic transmission • synapse assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 141.21 – 141.21 Mb | Хр. 18: 37.63 – 37.64 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PCDHB12 (англ. Protocadherin beta 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 795 амінокислот, а молекулярна маса — 86 770[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MENGGAGTLQ | | IRQVLLFFVL | | LGMSQAGSET | | GNFLVMEELQ | | SGSFVGNLAK |
TLGLEVSELS | | SRGARVVSND | | NKECLQLDTN | | TGDLLLREML | | DREELCGSNE |
PCVLYFQVLM | | KNPTQFLQIE | | LQVRDINDHS | | PVFLEKEMLL | | EIPENSPVGA |
VFLLESAKDL | | DVGINAVKSY | | TINPNSHFHV | | KIRVNPDNRK | | YPELVLDKAL |
DYEERPELSF | | ILTALDGGSP | | PRSGTALVRV | | VVVDINDNSP | | EFEQAFYEVK |
ILENSILGSL | | VVTVSAWDLD | | SGTNSELSYT | | FSHASEDIRK | | TFEINQKSGD |
ITLTAPLDFE | | AIESYSIIIQ | | ATDGGGLFGK | | STVRIQVMDV | | NDNAPEITVS |
SITSPIPENT | | PETVVMVFRI | | RDRDSGDNGK | | MVCSIPEDIP | | FVLKSSVNNY |
YTLETERPLD | | RESRAEYNIT | | ITVTDLGTPR | | LKTEHNITVL | | VSDVNDNAPA |
FTQTSYALFV | | RENNSPALHI | | GSISATDRDS | | GTNAQVNYSL | | LPSQDPHLPL |
ASLVSINADN | | GHLFALRSLD | | YEALQGFQFR | | VGATDHGSPA | | LSSEALVRVL |
VLDANDNSPF | | VLYPLQNGSA | | PCTELVPWAA | | EPGYLVTKVV | | AVDGDSGQNA |
WLSYQLLKAT | | EPGLFGVWAH | | NGEVRTARLL | | SERDAAKHRL | | VVLVKDNGEP |
PRSATATLHV | | LLVDGFSQPY | | LPLPEAAPAQ | | AQADSLTVYL | | VVALASVSSL |
FLFSVLLFVA | | VRLCRRSRAA | | PVGRCSVPEG | | PFPGHLVDVS | | GTGTLSQSYH |
YEVCVTGGSR | | SNKFKFLKPI | | IPNFLPQSTG | | SEVEENPPFQ | | NNLGF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Wu Q., Maniatis T. (1999). A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes. Cell. 97: 779—790. PMID 10380929 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8
- Vanhalst K., Kools P., Vanden Eynde E., van Roy F. (2001). The human and murine protocadherin-beta one-exon gene families show high evolutionary conservation, despite the difference in gene number. FEBS Lett. 495: 120—125. PMID 11322959 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02372-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8683 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9Y5F1 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |