PHC2

Ідентифікатори

Символи

PHC2, EDR2, HPH2, PH2, polyhomeotic homolog 2

Зовнішні ІД

OMIM: 602979 MGI: 1860454 HomoloGene: 75090 GeneCards: PHC2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding
Клітинна компонента	• GO:0035328 Гетерохроматин • PRC1 complex • PcG protein complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• Сперматогенез • multicellular organism development
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1912


54383

Ensembl


ENSG00000134686


ENSMUSG00000028796

UniProt


Q8IXK0


Q9QWH1

RefSeq (мРНК)


NM_004427 NM_198040 NM_001330488


NM_001195083 NM_001195130 NM_018774

RefSeq (білок)


NP_001317417 NP_004418 NP_932157


NP_001182012 NP_001182059 NP_061244

Локус (UCSC)

Хр. 1: 33.32 – 33.43 Mb

Хр. 4: 128.55 – 128.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PHC2 (англ. Polyhomeotic homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 90 713^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MENELPVPHT	SSSACATSST	SGASSSSGCN	NSSSGGSGRP	TGPQISVYSG
IPDRQTVQVI	QQALHRQPST	AAQYLQQMYA	AQQQHLMLQT	AALQQQHLSS
AQLQSLAAVQ	QASLVSNRQG	STSGSNVSAQ	APAQSSSINL	AASPAAAQLL
NRAQSVNSAA	ASGIAQQAVL	LGNTSSPALT	ASQAQMYLRA	QMLIFTPTAT
VATVQPELGT	GSPARPPTPA	QVQNLTLRTQ	QTPAAAASGP	TPTQPVLPSL
ALKPTPGGSQ	PLPTPAQSRN	TAQASPAGAK	PGIADSVMEP	HKKGDGNSSV
PGSMEGRAGL	SRTVPAVAAH	PLIAPAYAQL	QPHQLLPQPS	SKHLQPQFVI
QQQPQPQQQQ	PPPQQSRPVL	QAEPHPQLAS	VSPSVALQPS	SEAHAMPLGP
VTPALPLQCP	TANLHKPGGS	QQCHPPTPDT	GPQNGHPEGV	PHTPQRRFQH
TSAVILQLQP	ASPPQQCVPD	DWKEVAPGEK	SVPETRSGPS	PHQQAIVTAM
PGGLPVPTSP	NIQPSPAHET	GQGIVHALTD	LSSPGMTSGN	GNSASSIAGT
APQNGENKPP	QAIVKPQILT	HVIEGFVIQE	GAEPFPVGRS	SLLVGNLKKK
YAQGFLPEKL	PQQDHTTTTD	SEMEEPYLQE	SKEEGAPLKL	KCELCGRVDF
AYKFKRSKRF	CSMACAKRYN	VGCTKRVGLF	HSDRSKLQKA	GAATHNRRRA
SKASLPPLTK	DTKKQPTGTV	PLSVTAALQL	THSQEDSSRC	SDNSSYEEPL
SPISASSSTS	RRRQGQRDLE	LPDMHMRDLV	GMGHHFLPSE	PTKWNVEDVY
EFIRSLPGCQ	EIAEEFRAQE	IDGQALLLLK	EDHLMSAMNI	KLGPALKIYA
RISMLKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Tonkin E., Hagan D.-M., Li W., Strachan T. (2002). Identification and characterisation of novel mammalian homologues of Drosophila polyhomeotic permits new insights into relationships between members of the polyhomeotic family. Hum. Genet. 111: 435—442. PMID 12384788 DOI:10.1007/s00439-002-0814-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening. Mol. Cell. Biochem. 210: 131—142. PMID 10976766 DOI:10.1023/A:1007177623283
Yannoni Y.M., Gaestel M., Lin L.L. (2004). P66(ShcA) interacts with MAPKAP kinase 2 and regulates its activity. FEBS Lett. 564: 205—211. PMID 15094067 DOI:10.1016/S0014-5793(04)00351-5
Vandamme J., Volkel P., Rosnoblet C., Le Faou P., Angrand P.O. (2011). Interaction proteomics analysis of polycomb proteins defines distinct PRC1 Complexes in mammalian cells. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 21282530 DOI:10.1074/mcp.M110.002642

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3183 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8IXK0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.