PIK3C3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3IHY, 3LS8, 4OYS, 4PH4, 4UWF, 4UWG, 4UWH, 4UWL, 5ANL

Ідентифікатори

Символи

PIK3C3, VPS34, hVps34, phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3

Зовнішні ІД

OMIM: 602609 MGI: 2445019 HomoloGene: 1986 GeneCards: PIK3C3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol 3-kinase activity • ATP binding • kinase activity
Клітинна компонента	• гіалоплазма • ендосома • late endosome • phagocytic vesicle membrane • мембрана • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III • autophagosome • midbody • phagocytic vesicle • GO:0035085 Аксонема • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • autolysosome • phagophore assembly site • пероксисома • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type I • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II • цитоплазма • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• cellular response to glucose starvation • regulation of cytokinesis • фосфорилювання • protein processing • response to leucine • Цитокінез • endosome organization • поділ клітини • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process • early endosome to late endosome transport • phosphatidylinositol biosynthetic process • клітинний цикл • toll-like receptor 9 signaling pathway • macroautophagy • regulation of protein secretion • protein localization to phagophore assembly site • cellular response to starvation • protein lipidation • автофагія • autophagosome assembly • protein phosphorylation • ендоцитоз • autophagy of peroxisome • phosphatidylinositol-mediated signaling • interleukin-7-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5289


225326

Ensembl


ENSG00000078142


ENSMUSG00000033628

UniProt


Q8NEB9


Q6PF93

RefSeq (мРНК)


NM_001308020 NM_002647


NM_181414

RefSeq (білок)


NP_001294949 NP_002638


NP_852079

Локус (UCSC)

Хр. 18: 41.96 – 42.09 Mb

Хр. 18: 30.41 – 30.48 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PIK3C3 (англ. Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 887 амінокислот, а молекулярна маса — 101 549^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEAEKFHYI	YSCDLDINVQ	LKIGSLEGKR	EQKSYKAVLE	DPMLKFSGLY
QETCSDLYVT	CQVFAEGKPL	ALPVRTSYKA	FSTRWNWNEW	LKLPVKYPDL
PRNAQVALTI	WDVYGPGKAV	PVGGTTVSLF	GKYGMFRQGM	HDLKVWPNVE
ADGSEPTKTP	GRTSSTLSED	QMSRLAKLTK	AHRQGHMVKV	DWLDRLTFRE
IEMINESEKR	SSNFMYLMVE	FRCVKCDDKE	YGIVYYEKDG	DESSPILTSF
ELVKVPDPQM	SMENLVESKH	HKLARSLRSG	PSDHDLKPNA	ATRDQLNIIV
SYPPTKQLTY	EEQDLVWKFR	YYLTNQEKAL	TKFLKCVNWD	LPQEAKQALE
LLGKWKPMDV	EDSLELLSSH	YTNPTVRRYA	VARLRQADDE	DLLMYLLQLV
QALKYENFDD	IKNGLEPTKK	DSQSSVSENV	SNSGINSAEI	DSSQIITSPL
PSVSSPPPAS	KTKEVPDGEN	LEQDLCTFLI	SRACKNSTLA	NYLYWYVIVE
CEDQDTQQRD	PKTHEMYLNV	MRRFSQALLK	GDKSVRVMRS	LLAAQQTFVD
RLVHLMKAVQ	RESGNRKKKN	ERLQALLGDN	EKMNLSDVEL	IPLPLEPQVK
IRGIIPETAT	LFKSALMPAQ	LFFKTEDGGK	YPVIFKHGDD	LRQDQLILQI
ISLMDKLLRK	ENLDLKLTPY	KVLATSTKHG	FMQFIQSVPV	AEVLDTEGSI
QNFFRKYAPS	ENGPNGISAE	VMDTYVKSCA	GYCVITYILG	VGDRHLDNLL
LTKTGKLFHI	DFGYILGRDP	KPLPPPMKLN	KEMVEGMGGT	QSEQYQEFRK
QCYTAFLHLR	RYSNLILNLF	SLMVDANIPD	IALEPDKTVK	KVQDKFRLDL
SDEEAVHYMQ	SLIDESVHAL	FAAVVEQIHK	FAQYWRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Stein M.P., Feng Y., Cooper K.L., Welford A.M., Wandinger-Ness A. (2003). Human VPS34 and p150 are Rab7 interacting partners. Traffic. 4: 754—771. PMID 14617358 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00133.x
Thoresen S.B., Pedersen N.M., Liestol K., Stenmark H. (2010). A phosphatidylinositol 3-kinase class III sub-complex containing VPS15, VPS34, Beclin 1, UVRAG and BIF-1 regulates cytokinesis and degradative endocytic traffic. Exp. Cell Res. 316: 3368—3378. PMID 20643123 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.07.008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8974 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NEB9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.