PNN

Ідентифікатори

Символи

PNN, DRS, DRSP, SDK3, memA, Pinin, pinin, desmosome associated protein

Зовнішні ІД

OMIM: 603154 MGI: 1100514 HomoloGene: 37656 GeneCards: PNN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity • DNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• Проміжні філаменти • міжклітинні контакти • клітинне ядро • cell-cell junction • мембрана • Десмосома • exon-exon junction complex • клітинна мембрана • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • адгезія клітин
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5411


18949

Ensembl


ENSG00000100941


ENSMUSG00000020994

UniProt


Q9H307


O35691

RefSeq (мРНК)


NM_002687


NM_008891

RefSeq (білок)


NP_002678


NP_032917

Локус (UCSC)

Хр. 14: 39.18 – 39.18 Mb

Хр. 12: 59.11 – 59.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PNN (англ. Pinin, desmosome associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 717 амінокислот, а молекулярна маса — 81 614^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVAVRTLQE	QLEKAKESLK	NVDENIRKLT	GRDPNDVRPI	QARLLALSGP
GGGRGRGSLL	LRRGFSDSGG	GPPAKQRDLE	GAVSRLGGER	RTRRESRQES
DPEDDDVKKP	ALQSSVVATS	KERTRRDLIQ	DQNMDEKGKQ	RNRRIFGLLM
GTLQKFKQES	TVATERQKRR	QEIEQKLEVQ	AEEERKQVEN	ERRELFEERR
AKQTELRLLE	QKVELAQLQE	EWNEHNAKII	KYIRTKTKPH	LFYIPGRMCP
ATQKLIEESQ	RKMNALFEGR	RIEFAEQINK	MEARPRRQSM	KEKEHQVVRN
EEQKAEQEEG	KVAQREEELE	ETGNQHNDVE	IEEAGEEEEK	EIAIVHSDAE
KEQEEEEQKQ	EMEVKMEEET	EVRESEKQQD	SQPEEVMDVL	EMVENVKHVI
ADQEVMETNR	VESVEPSENE	ASKELEPEME	FEIEPDKECK	SLSPGKENVS
ALDMEKESEE	KEEKESEPQP	EPVAQPQPQS	QPQLQLQSQS	QPVLQSQPPS
QPEDLSLAVL	QPTPQVTQEQ	GHLLPERKDF	PVESVKLTEV	PVEPVLTVHP
ESKSKTKTRS	RSRGRARNKT	SKSRSRSSSS	SSSSSSSTSS	SSGSSSSSGS
SSSRSSSSSS	SSTSGSSSRD	SSSSTSSSSE	SRSRSRGRGH	NRDRKHRRSV
DRKRRDTSGL	ERSHKSSKGG	SSRDTKGSKD	KNSRSDRKRS	ISESSRSGKR
SSRSERDRKS	DRKDKRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, клітинних контактах.

Література

Ouyang P., Sugrue S.P. (1996). Characterization of pinin, a novel protein associated with the desmosome-intermediate filament complex. J. Cell Biol. 135: 1027—1042. PMID 8922384 DOI:10.1083/jcb.135.4.1027
Degen W.G.J., Agterbos M.A., Muyrers J.P.P., Bloemers H.P.J., Swart G.W.M. (1999). memA/DRS, a putative mediator of multiprotein complexes, is overexpressed in the metastasizing human melanoma cell lines BLM and MV3. Biochim. Biophys. Acta. 1444: 384—394. PMID 10095061 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00012-3
Shi Y., Ouyang P., Sugrue S.P. (2000). Characterization of the gene encoding pinin/DRS/memA and evidence for its potential tumor suppressor function. Oncogene. 19: 289—297. PMID 10645008 DOI:10.1038/sj.onc.1203328
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brandner J., Reidenbach S., Franke W.W. (1997). Evidence that 'pinin', reportedly a differentiation-specific desmosomal protein, is actually a widespread nuclear protein. Differentiation. 62: 119—127. PMID 9447706 DOI:10.1046/j.1432-0436.1997.6230119.x
Ouyang P. (1999). Antibodies differentiate desmosome-form and nucleus-form pinin: evidence that pinin is a moonlighting protein with dual location at the desmosome and within the nucleus. Biochem. Biophys. Res. Commun. 263: 192—200. PMID 10486276 DOI:10.1006/bbrc.1999.1353

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9162 (англ.) . Архів оригіналу за 3 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H307 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.