POLI

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1T3N, 1ZET, 2ALZ, 2DPI, 2DPJ, 2FLL, 2FLN, 2FLP, 2KHU, 2KHW, 2KTF, 2L0G, 2MBB, 3EPG, 3EPI, 3G6X, 3G6Y, 3GV5, 3GV7, 3GV8, 3H40, 3H4B, 3H4D, 3NGD, 3OSN, 3Q8P, 3Q8Q, 3Q8R, 3Q8S, 4EBC, 4EBD, 4EBE, 4EYH, 4EYI, 4FS1, 4FS2

Ідентифікатори

Символи

POLI, RAD30B, RAD3OB, polymerase (DNA) iota, DNA polymerase iota

Зовнішні ІД

OMIM: 605252 MGI: 1347081 HomoloGene: 5209 GeneCards: POLI

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • damaged DNA binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • cytoplasmic ribonucleoprotein granule
Біологічний процес	• реплікація ДНК • translesion synthesis • DNA biosynthetic process • GO:0100026 Репарація ДНК • error-prone translesion synthesis • cellular response to DNA damage stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11201


26447

Ensembl


ENSG00000101751


ENSMUSG00000038425

UniProt


Q9UNA4


Q6R3M4

RefSeq (мРНК)


NM_007195


NM_001136090 NM_001289515 NM_001289516 NM_011972

RefSeq (білок)

NP_009126 NP_001338539 NP_001338540 NP_001338541 NP_001338542
NP_001338543 NP_001338544 NP_001338545 NP_001338546 NP_001338547 NP_001338548 NP_001338549 NP_001338550 NP_001338561

NP_001129562 NP_001276444 NP_001276445 NP_036102 NP_001390096
NP_001390097 NP_001390098 NP_001390102 NP_001390103 NP_001390104 NP_001390106 NP_001390108 NP_001390112 NP_001390118

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 18: 70.64 – 70.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLI (англ. DNA polymerase iota) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 83 006^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEKLGVEPEE	EGGGDDDEED	AEAWAMELAD	VGAAASSQGV	HDQVLPTPNA
SSRVIVHVDL	DCFYAQVEMI	SNPELKDKPL	GVQQKYLVVT	CNYEARKLGV
KKLMNVRDAK	EKCPQLVLVN	GEDLTRYREM	SYKVTELLEE	FSPVVERLGF
DENFVDLTEM	VEKRLQQLQS	DELSAVTVSG	HVYNNQSINL	LDVLHIRLLV
GSQIAAEMRE	AMYNQLGLTG	CAGVASNKLL	AKLVSGVFKP	NQQTVLLPES
CQHLIHSLNH	IKEIPGIGYK	TAKCLEALGI	NSVRDLQTFS	PKILEKELGI
SVAQRIQKLS	FGEDNSPVIL	SGPPQSFSEE	DSFKKCSSEV	EAKNKIEELL
ASLLNRVCQD	GRKPHTVRLI	IRRYSSEKHY	GRESRQCPIP	SHVIQKLGTG
NYDVMTPMVD	ILMKLFRNMV	NVKMPFHLTL	LSVCFCNLKA	LNTAKKGLID
YYLMPSLSTT	SRSGKHSFKM	KDTHMEDFPK	DKETNRDFLP	SGRIESTRTR
ESPLDTTNFS	KEKDINEFPL	CSLPEGVDQE	VFKQLPVDIQ	EEILSGKSRE
KFQGKGSVSC	PLHASRGVLS	FFSKKQMQDI	PINPRDHLSS	SKQVSSVSPC
EPGTSGFNSS	SSSYMSSQKD	YSYYLDNRLK	DERISQGPKE	PQGFHFTNSN
PAVSAFHSFP	NLQSEQLFSR	NHTTDSHKQT	VATDSHEGLT	ENREPDSVDE
KITFPSDIDP	QVFYELPEAV	QKELLAEWKR	AGSDFHIGHK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, Шиффовими основами. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Haracska L., Prakash L., Prakash S. (2003). A mechanism for the exclusion of low-fidelity human Y-family DNA polymerases from base excision repair. Genes Dev. 17: 2777—2785. PMID 14630940 DOI:10.1101/gad.1146103
Nair D.T., Johnson R.E., Prakash S., Prakash L., Aggarwal A.K. (2004). Replication by human DNA polymerase-iota occurs by Hoogsteen base-pairing. Nature. 430: 377—380. PMID 15254543 DOI:10.1038/nature02692

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9182 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UNA4 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.