POLK |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/28/Protein_POLK_PDB_1t94.png/250px-Protein_POLK_PDB_1t94.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1T94, 2LSI, 2OH2, 2W7O, 2W7P, 3IN5, 3PZP, 4BA9, 4GK5, 4U6P, 4U7C | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | POLK, DINB1, DINP, POLQ, polymerase (DNA) kappa, DNA polymerase kappa |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605650 MGI: 1349767 HomoloGene: 32140 GeneCards: POLK |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • damaged DNA binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • site of DNA damage |
---|
Біологічний процес | • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • DNA biosynthetic process • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to UV • error-prone translesion synthesis • error-free translesion synthesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_016218 NM_001345921 NM_001345922 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001332850 NP_001332851 NP_057302 NP_057302.1 |
| | NP_001334531 NP_001334532 NP_001334533 NP_001334535 NP_036178 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 75.51 – 75.6 Mb | н/д |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
POLK (англ. DNA polymerase kappa) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 98 809[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSTKEKCDS | | YKDDLLLRMG | | LNDNKAGMEG | | LDKEKINKII | | MEATKGSRFY |
GNELKKEKQV | | NQRIENMMQQ | | KAQITSQQLR | | KAQLQVDRFA | | MELEQSRNLS |
NTIVHIDMDA | | FYAAVEMRDN | | PELKDKPIAV | | GSMSMLSTSN | | YHARRFGVRA |
AMPGFIAKRL | | CPQLIIVPPN | | FDKYRAVSKE | | VKEILADYDP | | NFMAMSLDEA |
YLNITKHLEE | | RQNWPEDKRR | | YFIKMGSSVE | | NDNPGKEVNK | | LSEHERSISP |
LLFEESPSDV | | QPPGDPFQVN | | FEEQNNPQIL | | QNSVVFGTSA | | QEVVKEIRFR |
IEQKTTLTAS | | AGIAPNTMLA | | KVCSDKNKPN | | GQYQILPNRQ | | AVMDFIKDLP |
IRKVSGIGKV | | TEKMLKALGI | | ITCTELYQQR | | ALLSLLFSET | | SWHYFLHISL |
GLGSTHLTRD | | GERKSMSVER | | TFSEINKAEE | | QYSLCQELCS | | ELAQDLQKER |
LKGRTVTIKL | | KNVNFEVKTR | | ASTVSSVVST | | AEEIFAIAKE | | LLKTEIDADF |
PHPLRLRLMG | | VRISSFPNEE | | DRKHQQRSII | | GFLQAGNQAL | | SATECTLEKT |
DKDKFVKPLE | | MSHKKSFFDK | | KRSERKWSHQ | | DTFKCEAVNK | | QSFQTSQPFQ |
VLKKKMNENL | | EISENSDDCQ | | ILTCPVCFRA | | QGCISLEALN | | KHVDECLDGP |
SISENFKMFS | | CSHVSATKVN | | KKENVPASSL | | CEKQDYEAHP | | KIKEISSVDC |
IALVDTIDNS | | SKAESIDALS | | NKHSKEECSS | | LPSKSFNIEH | | CHQNSSSTVS |
LENEDVGSFR | | QEYRQPYLCE | | VKTGQALVCP | | VCNVEQKTSD | | LTLFNVHVDV |
CLNKSFIQEL | | RKDKFNPVNQ | | PKESSRSTGS | | SSGVQKAVTR | | TKRPGLMTKY |
STSKKIKPNN | | PKHTLDIFFK |
Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію, Шиффовими основами. Локалізований у ядрі.
Література
- Ogi T., Kato T. Jr., Kato R., Ohmori H. (1999). Mutation enhancement by DINB1, a mammalian homologue of the Escherichia coli mutagenesis protein dinB. Genes Cells. 4: 607—618. PMID 10620008 DOI:10.1046/j.1365-2443.1999.00289.x
- Guo C., Gao T., Confer N., Velasco-Miguel S., Friedberg E.C. (2005). Multiple PolK (POLK) transcripts in mammalian testis. DNA Repair. 4: 397—402. PMID 15661663 DOI:10.1016/j.dnarep.2004.10.006
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gerlach V.L., Feaver W.J., Fischhaber P.L., Friedberg E.C. (2001). Purification and characterization of pol kappa, a DNA polymerase encoded by the human DINB1 gene. J. Biol. Chem. 276: 92—98. PMID 11024016 DOI:10.1074/jbc.M004413200
- Bergoglio V., Bavoux C., Verbiest V., Hoffmann J.-S., Cazaux C. (2002). Localisation of human DNA polymerase kappa to replication foci. J. Cell Sci. 115: 4413—4418. PMID 12414988 DOI:10.1242/jcs.00162
- Haracska L., Prakash L., Prakash S. (2002). Role of human DNA polymerase kappa as an extender in translesion synthesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 16000—16005. PMID 12444249 DOI:10.1073/pnas.252524999
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9183 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UBT6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |