POLK

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1T94, 2LSI, 2OH2, 2W7O, 2W7P, 3IN5, 3PZP, 4BA9, 4GK5, 4U6P, 4U7C

Ідентифікатори

Символи

POLK, DINB1, DINP, POLQ, polymerase (DNA) kappa, DNA polymerase kappa

Зовнішні ІД

OMIM: 605650 MGI: 1349767 HomoloGene: 32140 GeneCards: POLK

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • damaged DNA binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • site of DNA damage
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair, DNA gap filling • реплікація ДНК • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • DNA biosynthetic process • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to UV • error-prone translesion synthesis • error-free translesion synthesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


51426


27015

Ensembl


ENSG00000122008


ENSMUSG00000021668

UniProt


Q9UBT6


Q9QUG2

RefSeq (мРНК)


NM_016218 NM_001345921 NM_001345922


NM_012048

RefSeq (білок)


NP_001332850 NP_001332851 NP_057302 NP_057302.1


NP_001334531 NP_001334532 NP_001334533 NP_001334535 NP_036178

Локус (UCSC)

Хр. 5: 75.51 – 75.6 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

POLK (англ. DNA polymerase kappa) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 870 амінокислот, а молекулярна маса — 98 809^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDSTKEKCDS	YKDDLLLRMG	LNDNKAGMEG	LDKEKINKII	MEATKGSRFY
GNELKKEKQV	NQRIENMMQQ	KAQITSQQLR	KAQLQVDRFA	MELEQSRNLS
NTIVHIDMDA	FYAAVEMRDN	PELKDKPIAV	GSMSMLSTSN	YHARRFGVRA
AMPGFIAKRL	CPQLIIVPPN	FDKYRAVSKE	VKEILADYDP	NFMAMSLDEA
YLNITKHLEE	RQNWPEDKRR	YFIKMGSSVE	NDNPGKEVNK	LSEHERSISP
LLFEESPSDV	QPPGDPFQVN	FEEQNNPQIL	QNSVVFGTSA	QEVVKEIRFR
IEQKTTLTAS	AGIAPNTMLA	KVCSDKNKPN	GQYQILPNRQ	AVMDFIKDLP
IRKVSGIGKV	TEKMLKALGI	ITCTELYQQR	ALLSLLFSET	SWHYFLHISL
GLGSTHLTRD	GERKSMSVER	TFSEINKAEE	QYSLCQELCS	ELAQDLQKER
LKGRTVTIKL	KNVNFEVKTR	ASTVSSVVST	AEEIFAIAKE	LLKTEIDADF
PHPLRLRLMG	VRISSFPNEE	DRKHQQRSII	GFLQAGNQAL	SATECTLEKT
DKDKFVKPLE	MSHKKSFFDK	KRSERKWSHQ	DTFKCEAVNK	QSFQTSQPFQ
VLKKKMNENL	EISENSDDCQ	ILTCPVCFRA	QGCISLEALN	KHVDECLDGP
SISENFKMFS	CSHVSATKVN	KKENVPASSL	CEKQDYEAHP	KIKEISSVDC
IALVDTIDNS	SKAESIDALS	NKHSKEECSS	LPSKSFNIEH	CHQNSSSTVS
LENEDVGSFR	QEYRQPYLCE	VKTGQALVCP	VCNVEQKTSD	LTLFNVHVDV
CLNKSFIQEL	RKDKFNPVNQ	PKESSRSTGS	SSGVQKAVTR	TKRPGLMTKY
STSKKIKPNN	PKHTLDIFFK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію, Шиффовими основами. Локалізований у ядрі.

Література

Ogi T., Kato T. Jr., Kato R., Ohmori H. (1999). Mutation enhancement by DINB1, a mammalian homologue of the Escherichia coli mutagenesis protein dinB. Genes Cells. 4: 607—618. PMID 10620008 DOI:10.1046/j.1365-2443.1999.00289.x
Guo C., Gao T., Confer N., Velasco-Miguel S., Friedberg E.C. (2005). Multiple PolK (POLK) transcripts in mammalian testis. DNA Repair. 4: 397—402. PMID 15661663 DOI:10.1016/j.dnarep.2004.10.006
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gerlach V.L., Feaver W.J., Fischhaber P.L., Friedberg E.C. (2001). Purification and characterization of pol kappa, a DNA polymerase encoded by the human DINB1 gene. J. Biol. Chem. 276: 92—98. PMID 11024016 DOI:10.1074/jbc.M004413200
Bergoglio V., Bavoux C., Verbiest V., Hoffmann J.-S., Cazaux C. (2002). Localisation of human DNA polymerase kappa to replication foci. J. Cell Sci. 115: 4413—4418. PMID 12414988 DOI:10.1242/jcs.00162
Haracska L., Prakash L., Prakash S. (2002). Role of human DNA polymerase kappa as an extender in translesion synthesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 16000—16005. PMID 12444249 DOI:10.1073/pnas.252524999

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9183 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UBT6 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.