PPFIA4

Ідентифікатори

Символи

PPFIA4, PTPRF interacting protein alpha 4

Зовнішні ІД

OMIM: 603145 GeneCards: PPFIA4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • presynaptic active zone • cell surface • гіалоплазма • синапс • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• glutamate secretion • GO:0010554 neurotransmitter secretion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8497


181255

Ensembl


ENSG00000143847


WBGene00006364

UniProt


O75335


Q21049

RefSeq (мРНК)

NM_001304331 NM_001304332 NM_015053 NM_001393950 NM_001393951
NM_001393952 NM_001393953 NM_001393954 NM_001393955 NM_001393956 NM_001393957


NM_077367

RefSeq (білок)


NP_001291260 NP_001291261


NP_509768

Локус (UCSC)

Хр. 1: 203.03 – 203.08 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PPFIA4 (англ. PTPRF interacting protein alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 185 амінокислот, а молекулярна маса — 134 404^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCEVMPTINE	GDRLGPPHGA	DADANFEQLM	VNMLDEREKL	LESLRESQET
LAATQSRLQD	AIHERDQLQR	HLNSALPQEF	ATLTRELSMC	REQLLEREEE
ISELKAERNN	TRLLLEHLEC	LVSRHERSLR	MTVVKRQAQS	PSGVSSEVEV
LKALKSLFEH	HKALDEKVRE	RLRAALERVT	TLEEQLAGAH	QQVSALQQGA
GVRDGAAEEE	GTVELGPKRL	WKEDTGRVEE	LQELLEKQNF	ELSQARERLV
TLTTTVTELE	EDLGTARRDL	IKSEELSSKH	QRDLREALAQ	KEDMEERITT
LEKRYLAAQR	EATSIHDLND	KLENELANKE	SLHRQCEEKA	RHLQELLEVA
EQKLQQTMRK	AETLPEVEAE	LAQRIAALTK	AEERHGNIEE	HLRQLEGQLE
EKNQELARTA	VQVRQREKMN	EDHNKRLSDT	VDRLLSESNE	RLQLHLKERM
AALEEKNTLI	QELESSQRQI	EEQHHHKGRL	SEEIEKLRQE	VDQLKGRGGP
FVDGVHSRSH	MGSAADVRFS	LGTTTHAPPG	VHRRYSALRE	ESAKLALPLT
VTLRSPTWMR	MSQGVCCNLE	YHSSGTLCGS	SGPLPVPEMI	QEEKESTELR
AEEIETRVTS	GSMEALNLKQ	LRKRGSIPTS	LTALSLASAS	PPLSGRSTPK
LTSRSAAQDL	DRMGVMTLPS	DLRKHRRKLL	SPVSREENRE	DKATIKCETS
PPSSPRTLRL	EKLGHPALSQ	EEGKSALEDQ	GSNPSSSNSS	QDSLHKGAKR
KGIKSSIGRL	FGKKEKGRLI	QLSRDGATGH	VLLTDSEFSM	QEPMVPAKLG
TQAEKDRRLK	KKHQLLEDAR	RKGMPFAQWD	GPTVVSWLEL	WVGMPAWYVA
ACRANVKSGA	IMSALSDTEI	QREIGISNAL	HRLKLRLAIQ	EMVSLTSPSA
PPTSRTSSGN	VWVTHEEMET	LETSTKTDSE	EGSWAQTLAY	GDMNHEWIGN
EWLPSLGLPQ	YRSYFMECLV	DARMLDHLTK	KDLRVHLKMV	DSFHRTSLQY
GIMCLKRLNY	DRKELEKRRE	ESQHEIKDVL	VWTNDQVVHW	VQSIGLRDYA
GNLHESGVHG	ALLALDENFD	HNTLALILQI	PTQNTQARQV	MEREFNNLLA
LGTDRKLDDG	DDKVFRRAPS	WRKRFRPREH	HGRGGMLSAS	AETLPAGFRV
STLGTLQPPP	APPKKIMPEA	HSHYLYGHML	SAFRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
Katoh M., Katoh M. (2003). Identification and characterization of human PPFIA4 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 12: 1009—1014. PMID 14612982

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9248 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O75335 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.