PRKDC |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PRKDC, DNA-PKcs, DNAPK, DNPK1, HYRC, HYRC1, XRCC7, p350, IMD26, protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide, DNA-PKC, protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit, DNAPKc |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600899 MGI: 104779 HomoloGene: 5037 GeneCards: PRKDC |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
immunodeficiency 26[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transferase activity • nucleotide binding • DNA binding • DNA-dependent protein kinase activity • transcription factor binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • ATP binding • RNA binding • double-stranded DNA binding • protein kinase activity • protein domain specific binding |
---|
Клітинна компонента | • гіалоплазма • мембрана • transcription regulator complex • нуклеоплазма • DNA-dependent protein kinase-DNA ligase 4 complex • nonhomologous end joining complex • GO:0005578 Позаклітинна матриця • клітинне ядро • protein-DNA complex • ядерце • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • somitogenesis • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • response to ionizing radiation • negative regulation of response to gamma radiation • positive regulation of immune system process • DNA recombination • positive regulation of developmental growth • T cell differentiation in thymus • telomere capping • фосфорилювання • ритмічний процес • thymus development • positive regulation of fibroblast proliferation • lymphocyte differentiation • T cell receptor V(D)J recombination • negative regulation of apoptotic process • double-strand break repair via alternative nonhomologous end joining • spleen development • negative regulation of immunoglobulin production • response to activity • regulation of smooth muscle cell proliferation • cellular response to DNA damage stimulus • heart development • pro-B cell differentiation • brain development • B cell lineage commitment • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • protein destabilization • regulation of circadian rhythm • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • V(D)J-рекомбінація • cellular response to insulin stimulus • positive regulation of apoptotic process • ectopic germ cell programmed cell death • immunoglobulin V(D)J recombination • проліферація • double-strand break repair via nonhomologous end joining • telomere maintenance • response to gamma radiation • positive regulation of type I interferon production • T cell lineage commitment • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cellular senescence • immunoglobulin production • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз • protein phosphorylation • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет • regulation of epithelial cell proliferation • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 8: 47.77 – 47.96 Mb | Хр. 16: 15.46 – 15.66 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PRKDC (англ. Protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 128 амінокислот, а молекулярна маса — 469 089[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGSGAGVRC | | SLLRLQETLS | | AADRCGAALA | | GHQLIRGLGQ | | ECVLSSSPAV |
LALQTSLVFS | | RDFGLLVFVR | | KSLNSIEFRE | | CREEILKFLC | | IFLEKMGQKI |
APYSVEIKNT | | CTSVYTKDRA | | AKCKIPALDL | | LIKLLQTFRS | | SRLMDEFKIG |
ELFSKFYGEL | | ALKKKIPDTV | | LEKVYELLGL | | LGEVHPSEMI | | NNAENLFRAF |
LGELKTQMTS | | AVREPKLPVL | | AGCLKGLSSL | | LCNFTKSMEE | | DPQTSREIFN |
FVLKAIRPQI | | DLKRYAVPSA | | GLRLFALHAS | | QFSTCLLDNY | | VSLFEVLLKW |
CAHTNVELKK | | AALSALESFL | | KQVSNMVAKN | | AEMHKNKLQY | | FMEQFYGIIR |
NVDSNNKELS | | IAIRGYGLFA | | GPCKVINAKD | | VDFMYVELIQ | | RCKQMFLTQT |
DTGDDRVYQM | | PSFLQSVASV | | LLYLDTVPEV | | YTPVLEHLVV | | MQIDSFPQYS |
PKMQLVCCRA | | IVKVFLALAA | | KGPVLRNCIS | | TVVHQGLIRI | | CSKPVVLPKG |
PESESEDHRA | | SGEVRTGKWK | | VPTYKDYVDL | | FRHLLSSDQM | | MDSILADEAF |
FSVNSSSESL | | NHLLYDEFVK | | SVLKIVEKLD | | LTLEIQTVGE | | QENGDEAPGV |
WMIPTSDPAA | | NLHPAKPKDF | | SAFINLVEFC | | REILPEKQAE | | FFEPWVYSFS |
YELILQSTRL | | PLISGFYKLL | | SITVRNAKKI | | KYFEGVSPKS | | LKHSPEDPEK |
YSCFALFVKF | | GKEVAVKMKQ | | YKDELLASCL | | TFLLSLPHNI | | IELDVRAYVP |
ALQMAFKLGL | | SYTPLAEVGL | | NALEEWSIYI | | DRHVMQPYYK | | DILPCLDGYL |
KTSALSDETK | | NNWEVSALSR | | AAQKGFNKVV | | LKHLKKTKNL | | SSNEAISLEE |
IRIRVVQMLG | | SLGGQINKNL | | LTVTSSDEMM | | KSYVAWDREK | | RLSFAVPFRE |
MKPVIFLDVF | | LPRVTELALT | | ASDRQTKVAA | | CELLHSMVMF | | MLGKATQMPE |
GGQGAPPMYQ | | LYKRTFPVLL | | RLACDVDQVT | | RQLYEPLVMQ | | LIHWFTNNKK |
FESQDTVALL | | EAILDGIVDP | | VDSTLRDFCG | | RCIREFLKWS | | IKQITPQQQE |
KSPVNTKSLF | | KRLYSLALHP | | NAFKRLGASL | | AFNNIYREFR | | EEESLVEQFV |
FEALVIYMES | | LALAHADEKS | | LGTIQQCCDA | | IDHLCRIIEK | | KHVSLNKAKK |
RRLPRGFPPS | | ASLCLLDLVK | | WLLAHCGRPQ | | TECRHKSIEL | | FYKFVPLLPG |
NRSPNLWLKD | | VLKEEGVSFL | | INTFEGGGCG | | QPSGILAQPT | | LLYLRGPFSL |
QATLCWLDLL | | LAALECYNTF | | IGERTVGALQ | | VLGTEAQSSL | | LKAVAFFLES |
IAMHDIIAAE | | KCFGTGAAGN | | RTSPQEGERY | | NYSKCTVVVR | | IMEFTTTLLN |
TSPEGWKLLK | | KDLCNTHLMR | | VLVQTLCEPA | | SIGFNIGDVQ | | VMAHLPDVCV |
NLMKALKMSP | | YKDILETHLR | | EKITAQSIEE | | LCAVNLYGPD | | AQVDRSRLAA |
VVSACKQLHR | | AGLLHNILPS | | QSTDLHHSVG | | TELLSLVYKG | | IAPGDERQCL |
PSLDLSCKQL | | ASGLLELAFA | | FGGLCERLVS | | LLLNPAVLST | | ASLGSSQGSV |
IHFSHGEYFY | | SLFSETINTE | | LLKNLDLAVL | | ELMQSSVDNT | | KMVSAVLNGM |
LDQSFRERAN | | QKHQGLKLAT | | TILQHWKKCD | | SWWAKDSPLE | | TKMAVLALLA |
KILQIDSSVS | | FNTSHGSFPE | | VFTTYISLLA | | DTKLDLHLKG | | QAVTLLPFFT |
SLTGGSLEEL | | RRVLEQLIVA | | HFPMQSREFP | | PGTPRFNNYV | | DCMKKFLDAL |
ELSQSPMLLE | | LMTEVLCREQ | | QHVMEELFQS | | SFRRIARRGS | | CVTQVGLLES |
VYEMFRKDDP | | RLSFTRQSFV | | DRSLLTLLWH | | CSLDALREFF | | STIVVDAIDV |
LKSRFTKLNE | | STFDTQITKK | | MGYYKILDVM | | YSRLPKDDVH | | AKESKINQVF |
HGSCITEGNE | | LTKTLIKLCY | | DAFTENMAGE | | NQLLERRRLY | | HCAAYNCAIS |
VICCVFNELK | | FYQGFLFSEK | | PEKNLLIFEN | | LIDLKRRYNF | | PVEVEVPMER |
KKKYIEIRKE | | AREAANGDSD | | GPSYMSSLSY | | LADSTLSEEM | | SQFDFSTGVQ |
SYSYSSQDPR | | PATGRFRRRE | | QRDPTVHDDV | | LELEMDELNR | | HECMAPLTAL |
VKHMHRSLGP | | PQGEEDSVPR | | DLPSWMKFLH | | GKLGNPIVPL | | NIRLFLAKLV |
INTEEVFRPY | | AKHWLSPLLQ | | LAASENNGGE | | GIHYMVVEIV | | ATILSWTGLA |
TPTGVPKDEV | | LANRLLNFLM | | KHVFHPKRAV | | FRHNLEIIKT | | LVECWKDCLS |
IPYRLIFEKF | | SGKDPNSKDN | | SVGIQLLGIV | | MANDLPPYDP | | QCGIQSSEYF |
QALVNNMSFV | | RYKEVYAAAA | | EVLGLILRYV | | MERKNILEES | | LCELVAKQLK |
QHQNTMEDKF | | IVCLNKVTKS | | FPPLADRFMN | | AVFFLLPKFH | | GVLKTLCLEV |
VLCRVEGMTE | | LYFQLKSKDF | | VQVMRHRDDE | | RQKVCLDIIY | | KMMPKLKPVE |
LRELLNPVVE | | FVSHPSTTCR | | EQMYNILMWI | | HDNYRDPESE | | TDNDSQEIFK |
LAKDVLIQGL | | IDENPGLQLI | | IRNFWSHETR | | LPSNTLDRLL | | ALNSLYSPKI |
EVHFLSLATN | | FLLEMTSMSP | | DYPNPMFEHP | | LSECEFQEYT | | IDSDWRFRST |
VLTPMFVETQ | | ASQGTLQTRT | | QEGSLSARWP | | VAGQIRATQQ | | QHDFTLTQTA |
DGRSSFDWLT | | GSSTDPLVDH | | TSPSSDSLLF | | AHKRSERLQR | | APLKSVGPDF |
GKKRLGLPGD | | EVDNKVKGAA | | GRTDLLRLRR | | RFMRDQEKLS | | LMYARKGVAE |
QKREKEIKSE | | LKMKQDAQVV | | LYRSYRHGDL | | PDIQIKHSSL | | ITPLQAVAQR |
DPIIAKQLFS | | SLFSGILKEM | | DKFKTLSEKN | | NITQKLLQDF | | NRFLNTTFSF |
FPPFVSCIQD | | ISCQHAALLS | | LDPAAVSAGC | | LASLQQPVGI | | RLLEEALLRL |
LPAELPAKRV | | RGKARLPPDV | | LRWVELAKLY | | RSIGEYDVLR | | GIFTSEIGTK |
QITQSALLAE | | ARSDYSEAAK | | QYDEALNKQD | | WVDGEPTEAE | | KDFWELASLD |
CYNHLAEWKS | | LEYCSTASID | | SENPPDLNKI | | WSEPFYQETY | | LPYMIRSKLK |
LLLQGEADQS | | LLTFIDKAMH | | GELQKAILEL | | HYSQELSLLY | | LLQDDVDRAK |
YYIQNGIQSF | | MQNYSSIDVL | | LHQSRLTKLQ | | SVQALTEIQE | | FISFISKQGN |
LSSQVPLKRL | | LNTWTNRYPD | | AKMDPMNIWD | | DIITNRCFFL | | SKIEEKLTPL |
PEDNSMNVDQ | | DGDPSDRMEV | | QEQEEDISSL | | IRSCKFSMKM | | KMIDSARKQN |
NFSLAMKLLK | | ELHKESKTRD | | DWLVSWVQSY | | CRLSHCRSRS | | QGCSEQVLTV |
LKTVSLLDEN | | NVSSYLSKNI | | LAFRDQNILL | | GTTYRIIANA | | LSSEPACLAE |
IEEDKARRIL | | ELSGSSSEDS | | EKVIAGLYQR | | AFQHLSEAVQ | | AAEEEAQPPS |
WSCGPAAGVI | | DAYMTLADFC | | DQQLRKEEEN | | ASVIDSAELQ | | AYPALVVEKM |
LKALKLNSNE | | ARLKFPRLLQ | | IIERYPEETL | | SLMTKEISSV | | PCWQFISWIS |
HMVALLDKDQ | | AVAVQHSVEE | | ITDNYPQAIV | | YPFIISSESY | | SFKDTSTGHK |
NKEFVARIKS | | KLDQGGVIQD | | FINALDQLSN | | PELLFKDWSN | | DVRAELAKTP |
VNKKNIEKMY | | ERMYAALGDP | | KAPGLGAFRR | | KFIQTFGKEF | | DKHFGKGGSK |
LLRMKLSDFN | | DITNMLLLKM | | NKDSKPPGNL | | KECSPWMSDF | | KVEFLRNELE |
IPGQYDGRGK | | PLPEYHVRIA | | GFDERVTVMA | | SLRRPKRIII | | RGHDEREHPF |
LVKGGEDLRQ | | DQRVEQLFQV | | MNGILAQDSA | | CSQRALQLRT | | YSVVPMTSRL |
GLIEWLENTV | | TLKDLLLNTM | | SQEEKAAYLS | | DPRAPPCEYK | | DWLTKMSGKH |
DVGAYMLMYK | | GANRTETVTS | | FRKRESKVPA | | DLLKRAFVRM | | STSPEAFLAL |
RSHFASSHAL | | ICISHWILGI | | GDRHLNNFMV | | AMETGGVIGI | | DFGHAFGSAT |
QFLPVPELMP | | FRLTRQFINL | | MLPMKETGLM | | YSIMVHALRA | | FRSDPGLLTN |
TMDVFVKEPS | | FDWKNFEQKM | | LKKGGSWIQE | | INVAEKNWYP | | RQKICYAKRK |
LAGANPAVIT | | CDELLLGHEK | | APAFRDYVAV | | ARGSKDHNIR | | AQEPESGLSE |
ETQVKCLMDQ | | ATDPNILGRT | | WEGWEPWM |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, біологічні ритми, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Anderson C.W., Dunn J.J., Freimuth P.I., Galloway A.M., Allalunis-Turner M.J. (2001). Frameshift mutation in PRKDC, the gene for DNA-PKcs, in the DNA repair-defective, human, glioma-derived cell line M059J. Radiat. Res. 156: 2—9. PMID 11418067 DOI:10.1667/0033-7587(2001)156[0002:FMIPTG]2.0.CO;2
- Carter T., Vancurova I., Sun I., Lou W., DeLeon S. (1990). A DNA-activated protein kinase from HeLa cell nuclei. Mol. Cell. Biol. 10: 6460—6471. PMID 2247066 DOI:10.1128/MCB.10.12.6460
- Iijima S., Teraoka H., Date T., Tsukada K. (1992). DNA-activated protein kinase in Raji Burkitt's lymphoma cells. Phosphorylation of c-Myc oncoprotein. Eur. J. Biochem. 206: 595—603. PMID 1597196 DOI:10.1111/j.1432-1033.1992.tb16964.x
- Bannister A.J., Gottlieb T.M., Kouzarides T., Jackson S.P. (1993). c-Jun is phosphorylated by the DNA-dependent protein kinase in vitro; definition of the minimal kinase recognition motif. Nucleic Acids Res. 21: 1289—1295. PMID 8464713 DOI:10.1093/nar/21.5.1289
- Connelly M.A., Zhang H., Kieleczawa J., Anderson C.W. (1996). Alternate splice-site utilization in the gene for the catalytic subunit of the DNA-activated protein kinase, DNA-PKcs. Gene. 175: 271—273. PMID 8917110 DOI:10.1016/0378-1119(96)00135-7
- Shieh S.-Y., Ikeda M., Taya Y., Prives C. (1997). DNA damage-induced phosphorylation of p53 alleviates inhibition by MDM2. Cell. 91: 325—334. PMID 9363941 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80416-X
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRKDC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9413 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P78527 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |