PTGIS

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3B6H, 2IAG

Ідентифікатори

Символи

PTGIS, CYP8, CYP8A1, PGIS, PTGI, prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, prostaglandin I2 synthase

Зовнішні ІД

OMIM: 601699 MGI: 1097156 HomoloGene: 37374 GeneCards: PTGIS

Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • monooxygenase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • heme binding • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen • prostaglandin-I synthase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • caveola • клітинне ядро • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process • positive regulation of execution phase of apoptosis • cellular response to interleukin-6 • lipid metabolism • icosanoid metabolic process • cyclooxygenase pathway • fatty acid metabolic process • positive regulation of angiogenesis • fatty acid biosynthetic process • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process • decidualization • cellular response to interleukin-1 • positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • apoptotic signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of inflammatory response • cellular response to hypoxia • embryo implantation • prostaglandin biosynthetic process • NAD biosynthesis via nicotinamide riboside salvage pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5740


19223

Ensembl


ENSG00000124212


н/д

UniProt


Q16647


O35074

RefSeq (мРНК)


NM_000961


NM_008968

RefSeq (білок)


NP_000952


NP_032994

Локус (UCSC)

Хр. 20: 49.5 – 49.57 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTGIS (англ. Prostaglandin I2 synthase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 500 амінокислот, а молекулярна маса — 57 104^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAWAALLGLL	AALLLLLLLS	RRRTRRPGEP	PLDLGSIPWL	GYALDFGKDA
ASFLTRMKEK	HGDIFTILVG	GRYVTVLLDP	HSYDAVVWEP	RTRLDFHAYA
IFLMERIFDV	QLPHYSPSDE	KARMKLTLLH	RELQALTEAM	YTNLHAVLLG
DATEAGSGWH	EMGLLDFSYS	FLLRAGYLTL	YGIEALPRTH	ESQAQDRVHS
ADVFHTFRQL	DRLLPKLARG	SLSVGDKDHM	CSVKSRLWKL	LSPARLARRA
HRSKWLESYL	LHLEEMGVSE	EMQARALVLQ	LWATQGNMGP	AAFWLLLFLL
KNPEALAAVR	GELESILWQA	EQPVSQTTTL	PQKVLDSTPV	LDSVLSESLR
LTAAPFITRE	VVVDLAMPMA	DGREFNLRRG	DRLLLFPFLS	PQRDPEIYTD
PEVFKYNRFL	NPDGSEKKDF	YKDGKRLKNY	NMPWGAGHNH	CLGRSYAVNS
IKQFVFLVLV	HLDLELINAD	VEIPEFDLSR	YGFGLMQPEH	DVPVRYRIRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chiang C.W., Yeh H.C., Wang L.H., Chan N.L. (2006). Crystal structure of the human prostacyclin synthase. J. Mol. Biol. 364: 266—274. PMID 17020766 DOI:10.1016/j.jmb.2006.09.039

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9603 (англ.) . Архів оригіналу за 13 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q16647 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.