PTPRM |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1RPM, 2C9A, 2V5Y | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPRM, PTPRL1, R-PTP-MU, RPTPM, RPTPU, hR-PTPu, protein tyrosine phosphatase, receptor type M, protein tyrosine phosphatase receptor type M |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 176888 MGI: 102694 HomoloGene: 37694 GeneCards: PTPRM |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • integral component of plasma membrane • perinuclear region of cytoplasm • lamellipodium • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • retina layer formation • GO:0016576 protein dephosphorylation • negative regulation of endothelial cell migration • negative regulation of endothelial cell proliferation • адгезія клітин • negative regulation of angiogenesis • neuron projection development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • retinal ganglion cell axon guidance • peptidyl-tyrosine dephosphorylation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001105244 NM_002845 NM_001378142 NM_001378143 NM_001378144
| NM_001378145 NM_001378146 NM_001378147 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001098714 NP_002836 NP_001365071 NP_001365072 NP_001365073
| NP_001365074 NP_001365075 NP_001365076 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 7.57 – 8.41 Mb | Хр. 17: 66.97 – 67.66 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRM (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 452 амінокислот, а молекулярна маса — 163 682[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRGLGTCLAT | | LAGLLLTAAG | | ETFSGGCLFD | | EPYSTCGYSQ | | SEGDDFNWEQ |
VNTLTKPTSD | | PWMPSGSFML | | VNASGRPEGQ | | RAHLLLPQLK | | ENDTHCIDFH |
YFVSSKSNSP | | PGLLNVYVKV | | NNGPLGNPIW | | NISGDPTRTW | | NRAELAISTF |
WPNFYQVIFE | | VITSGHQGYL | | AIDEVKVLGH | | PCTRTPHFLR | | IQNVEVNAGQ |
FATFQCSAIG | | RTVAGDRLWL | | QGIDVRDAPL | | KEIKVTSSRR | | FIASFNVVNT |
TKRDAGKYRC | | MIRTEGGVGI | | SNYAELVVKE | | PPVPIAPPQL | | ASVGATYLWI |
QLNANSINGD | | GPIVAREVEY | | CTASGSWNDR | | QPVDSTSYKI | | GHLDPDTEYE |
ISVLLTRPGE | | GGTGSPGPAL | | RTRTKCADPM | | RGPRKLEVVE | | VKSRQITIRW |
EPFGYNVTRC | | HSYNLTVHYC | | YQVGGQEQVR | | EEVSWDTENS | | HPQHTITNLS |
PYTNVSVKLI | | LMNPEGRKES | | QELIVQTDED | | LPGAVPTESI | | QGSTFEEKIF |
LQWREPTQTY | | GVITLYEITY | | KAVSSFDPEI | | DLSNQSGRVS | | KLGNETHFLF |
FGLYPGTTYS | | FTIRASTAKG | | FGPPATNQFT | | TKISAPSMPA | | YELETPLNQT |
DNTVTVMLKP | | AHSRGAPVSV | | YQIVVEEERP | | RRTKKTTEIL | | KCYPVPIHFQ |
NASLLNSQYY | | FAAEFPADSL | | QAAQPFTIGD | | NKTYNGYWNT | | PLLPYKSYRI |
YFQAASRANG | | ETKIDCVQVA | | TKGAATPKPV | | PEPEKQTDHT | | VKIAGVIAGI |
LLFVIIFLGV | | VLVMKKRKLA | | KKRKETMSST | | RQEMTVMVNS | | MDKSYAEQGT |
NCDEAFSFMD | | THNLNGRSVS | | SPSSFTMKTN | | TLSTSVPNSY | | YPDETHTMAS |
DTSSLVQSHT | | YKKREPADVP | | YQTGQLHPAI | | RVADLLQHIT | | QMKCAEGYGF |
KEEYESFFEG | | QSAPWDSAKK | | DENRMKNRYG | | NIIAYDHSRV | | RLQTIEGDTN |
SDYINGNYID | | GYHRPNHYIA | | TQGPMQETIY | | DFWRMVWHEN | | TASIIMVTNL |
VEVGRVKCCK | | YWPDDTEIYK | | DIKVTLIETE | | LLAEYVIRTF | | AVEKRGVHEI |
REIRQFHFTG | | WPDHGVPYHA | | TGLLGFVRQV | | KSKSPPSAGP | | LVVHCSAGAG |
RTGCFIVIDI | | MLDMAEREGV | | VDIYNCVREL | | RSRRVNMVQT | | EEQYVFIHDA |
ILEACLCGDT | | SVPASQVRSL | | YYDMNKLDPQ | | TNSSQIKEEF | | RTLNMVTPTL |
RVEDCSIALL | | PRNHEKNRCM | | DILPPDRCLP | | FLITIDGESS | | NYINAALMDS |
YKQPSAFIVT | | QHPLPNTVKD | | FWRLVLDYHC | | TSVVMLNDVD | | PAQLCPQYWP |
ENGVHRHGPI | | QVEFVSADLE | | EDIISRIFRI | | YNAARPQDGY | | RMVQQFQFLG |
WPMYRDTPVS | | KRSFLKLIRQ | | VDKWQEEYNG | | GEGRTVVHCL | | NGGGRSGTFC |
AISIVCEMLR | | HQRTVDVFHA | | VKTLRNNKPN | | MVDLLDQYKF | | CYEVALEYLN |
SG |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hoffmann K.M., Tonks N.K., Barford D. (1997). The crystal structure of domain 1 of receptor protein-tyrosine phosphatase mu. J. Biol. Chem. 272: 27505—27508. PMID 9346878 DOI:10.1074/jbc.272.44.27505
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9675 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P28827 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |