PTPRN2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2QEP, 4HTI, 4HTJ

Ідентифікатори

Символи

PTPRN2, IA-2beta, IAR, ICAAR, PTPRP, R-PTP-N2, protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, protein tyrosine phosphatase receptor type N2

Зовнішні ІД

OMIM: 601698 MGI: 107418 HomoloGene: 2134 GeneCards: PTPRN2

Пов'язані генетичні захворювання

ожиріння, короткозорість, шизофренія, біполярний афективний розлад^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum lumen • secretory granule membrane • мембрана • receptor complex • transport vesicle membrane • синапс • integral component of plasma membrane • synaptic vesicle membrane • secretory granule • міжклітинні контакти • terminal bouton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane • integral component of synaptic vesicle membrane
Біологічний процес	• GO:0016576 protein dephosphorylation • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0010554 neurotransmitter secretion • lipid metabolism • neutrophil degranulation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5799


19276

Ensembl


ENSG00000155093 ENSG00000282185


ENSMUSG00000056553

UniProt


Q92932


P80560

RefSeq (мРНК)


NM_001308267 NM_001308268 NM_002847 NM_130842 NM_130843


NM_011215

RefSeq (білок)


NP_001295196 NP_001295197 NP_002838 NP_570857 NP_570858


NP_035345

Локус (UCSC)

Хр. 7: 157.54 – 158.59 Mb

Хр. 12: 116.45 – 117.24 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPRN2 (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type N2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 015 амінокислот, а молекулярна маса — 111 271^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPPLPLLLL	LLLLLPPRVL	PAAPSSVPRG	RQLPGRLGCL	LEEGLCGASE
ACVNDGVFGR	CQKVPAMDFY	RYEVSPVALQ	RLRVALQKLS	GTGFTWQDDY
TQYVMDQELA	DLPKTYLRRP	EASSPARPSK	HSVGSERRYS	REGGAALANA
LRRHLPFLEA	LSQAPASDVL	ARTHTAQDRP	PAEGDDRFSE	SILTYVAHTS
ALTYPPGSRT	QLREDLLPRT	LGQLQPDELS	PKVDSGVDRH	HLMAALSAYA
AQRPPAPPGE	GSLEPQYLLR	APSRMPRPLL	APAAPQKWPS	PLGDSEDPSS
TGDGARIHTL	LKDLQRQPAE	VRGLSGLELD	GMAELMAGLM	QGVDHGVARG
SPGRAALGES	GEQADGPKAT	LRGDSFPDDG	VQDDDDRLYQ	EVHRLSATLG
GLLQDHGSRL	LPGALPFARP	LDMERKKSEH	PESSLSSEEE	TAGVENVKSQ
TYSKDLLGQQ	PHSEPGAAAF	GELQNQMPGP	SKEEQSLPAG	AQEALSDGLQ
LEVQPSEEEA	RGYIVTDRDP	LRPEEGRRLV	EDVARLLQVP	SSAFADVEVL
GPAVTFKVSA	NVQNVTTEDV	EKATVDNKDK	LEETSGLKIL	QTGVGSKSKL
KFLPPQAEQE	DSTKFIALTL	VSLACILGVL	LASGLIYCLR	HSSQHRLKEK
LSGLGGDPGA	DATAAYQELC	RQRMATRPPD	RPEGPHTSRI	SSVSSQFSDG
PIPSPSARSS	ASSWSEEPVQ	SNMDISTGHM	ILSYMEDHLK	NKNRLEKEWE
ALCAYQAEPN	SSFVAQREEN	VPKNRSLAVL	TYDHSRVLLK	AENSHSHSDY
INASPIMDHD	PRNPAYIATQ	GPLPATVADF	WQMVWESGCV	VIVMLTPLAE
NGVRQCYHYW	PDEGSNLYHI	YEVNLVSEHI	WCEDFLVRSF	YLKNLQTNET
RTVTQFHFLS	WYDRGVPSSS	RSLLDFRRKV	NKCYRGRSCP	IIVHCSDGAG
RSGTYVLIDM	VLNKMAKGAK	EIDIAATLEH	LRDQRPGMVQ	TKEQFEFALT
AVAEEVNAIL	KALPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Kawasaki E., Hutton J.C., Eisenbarth G.S. (1996). Molecular cloning and characterization of the human transmembrane protein tyrosine phosphatase homologue, phogrin, an autoantigen of type 1 diabetes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 440—447. PMID 8878534 DOI:10.1006/bbrc.1996.1526
Cui L., Yu W.-P., de Aizpurua H.J., Schmidli R.S., Pallen C.J. (1996). Cloning and characterization of islet cell antigen-related protein-tyrosine phosphatase (PTP), a novel receptor-like PTP and autoantigen in insulin-dependent diabetes. J. Biol. Chem. 271: 24817—24823. PMID 8798755 DOI:10.1074/jbc.271.40.24817
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Sengelaub C.A., Navrazhina K., Ross J.B., Halberg N., Tavazoie S.F. (2016). PTPRN2 and PLCbeta1 promote metastatic breast cancer cell migration through PI(4,5)P2-dependent actin remodeling. EMBO J. 35: 62—76. PMID 26620550 DOI:10.15252/embj.201591973

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRN2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9677 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92932 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.