PTPRN2 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2QEP, 4HTI, 4HTJ | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPRN2, IA-2beta, IAR, ICAAR, PTPRP, R-PTP-N2, protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, protein tyrosine phosphatase receptor type N2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601698 MGI: 107418 HomoloGene: 2134 GeneCards: PTPRN2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
ожиріння, короткозорість, шизофренія, біполярний афективний розлад[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • integral component of membrane • endoplasmic reticulum lumen • secretory granule membrane • мембрана • receptor complex • transport vesicle membrane • синапс • integral component of plasma membrane • synaptic vesicle membrane • secretory granule • міжклітинні контакти • terminal bouton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • ficolin-1-rich granule membrane • integral component of synaptic vesicle membrane |
---|
Біологічний процес | • GO:0016576 protein dephosphorylation • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0010554 neurotransmitter secretion • lipid metabolism • neutrophil degranulation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/dd/PBB_GE_PTPRN2_203029_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRN2_203029_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a9/PBB_GE_PTPRN2_203030_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRN2_203030_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/01/PBB_GE_PTPRN2_211534_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRN2_211534_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000155093 ENSG00000282185 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001308267 NM_001308268 NM_002847 NM_130842 NM_130843 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001295196 NP_001295197 NP_002838 NP_570857 NP_570858 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 157.54 – 158.59 Mb | Хр. 12: 116.45 – 117.24 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRN2 (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type N2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 015 амінокислот, а молекулярна маса — 111 271[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGPPLPLLLL | | LLLLLPPRVL | | PAAPSSVPRG | | RQLPGRLGCL | | LEEGLCGASE |
ACVNDGVFGR | | CQKVPAMDFY | | RYEVSPVALQ | | RLRVALQKLS | | GTGFTWQDDY |
TQYVMDQELA | | DLPKTYLRRP | | EASSPARPSK | | HSVGSERRYS | | REGGAALANA |
LRRHLPFLEA | | LSQAPASDVL | | ARTHTAQDRP | | PAEGDDRFSE | | SILTYVAHTS |
ALTYPPGSRT | | QLREDLLPRT | | LGQLQPDELS | | PKVDSGVDRH | | HLMAALSAYA |
AQRPPAPPGE | | GSLEPQYLLR | | APSRMPRPLL | | APAAPQKWPS | | PLGDSEDPSS |
TGDGARIHTL | | LKDLQRQPAE | | VRGLSGLELD | | GMAELMAGLM | | QGVDHGVARG |
SPGRAALGES | | GEQADGPKAT | | LRGDSFPDDG | | VQDDDDRLYQ | | EVHRLSATLG |
GLLQDHGSRL | | LPGALPFARP | | LDMERKKSEH | | PESSLSSEEE | | TAGVENVKSQ |
TYSKDLLGQQ | | PHSEPGAAAF | | GELQNQMPGP | | SKEEQSLPAG | | AQEALSDGLQ |
LEVQPSEEEA | | RGYIVTDRDP | | LRPEEGRRLV | | EDVARLLQVP | | SSAFADVEVL |
GPAVTFKVSA | | NVQNVTTEDV | | EKATVDNKDK | | LEETSGLKIL | | QTGVGSKSKL |
KFLPPQAEQE | | DSTKFIALTL | | VSLACILGVL | | LASGLIYCLR | | HSSQHRLKEK |
LSGLGGDPGA | | DATAAYQELC | | RQRMATRPPD | | RPEGPHTSRI | | SSVSSQFSDG |
PIPSPSARSS | | ASSWSEEPVQ | | SNMDISTGHM | | ILSYMEDHLK | | NKNRLEKEWE |
ALCAYQAEPN | | SSFVAQREEN | | VPKNRSLAVL | | TYDHSRVLLK | | AENSHSHSDY |
INASPIMDHD | | PRNPAYIATQ | | GPLPATVADF | | WQMVWESGCV | | VIVMLTPLAE |
NGVRQCYHYW | | PDEGSNLYHI | | YEVNLVSEHI | | WCEDFLVRSF | | YLKNLQTNET |
RTVTQFHFLS | | WYDRGVPSSS | | RSLLDFRRKV | | NKCYRGRSCP | | IIVHCSDGAG |
RSGTYVLIDM | | VLNKMAKGAK | | EIDIAATLEH | | LRDQRPGMVQ | | TKEQFEFALT |
AVAEEVNAIL | | KALPQ |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.
Література
- Kawasaki E., Hutton J.C., Eisenbarth G.S. (1996). Molecular cloning and characterization of the human transmembrane protein tyrosine phosphatase homologue, phogrin, an autoantigen of type 1 diabetes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227: 440—447. PMID 8878534 DOI:10.1006/bbrc.1996.1526
- Cui L., Yu W.-P., de Aizpurua H.J., Schmidli R.S., Pallen C.J. (1996). Cloning and characterization of islet cell antigen-related protein-tyrosine phosphatase (PTP), a novel receptor-like PTP and autoantigen in insulin-dependent diabetes. J. Biol. Chem. 271: 24817—24823. PMID 8798755 DOI:10.1074/jbc.271.40.24817
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Sengelaub C.A., Navrazhina K., Ross J.B., Halberg N., Tavazoie S.F. (2016). PTPRN2 and PLCbeta1 promote metastatic breast cancer cell migration through PI(4,5)P2-dependent actin remodeling. EMBO J. 35: 62—76. PMID 26620550 DOI:10.15252/embj.201591973
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRN2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9677 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92932 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |