PTPRU |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | PTPRU, FMI, PCP-2, PTP, PTP-J, PTP-PI, PTP-RO, PTPPSI, PTPRO, PTPU2, R-PTP-PSI, R-PTP-U, hPTP-J, protein tyrosine phosphatase, receptor type U, protein tyrosine phosphatase receptor type U |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602454 MGI: 1321151 HomoloGene: 4168 GeneCards: PTPRU |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • beta-catenin binding • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine phosphatase activity • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • integral component of plasma membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • response to glucocorticoid • homotypic cell-cell adhesion • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway • negative regulation of cell migration • protein localization to cell surface • animal organ regeneration • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • адгезія клітин • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0016576 protein dephosphorylation • cell-cell adhesion • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6f/PBB_GE_PTPRU_211320_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_PTPRU_211320_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001195001 NM_005704 NM_133177 NM_133178 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001181930 NP_005695 NP_573438 NP_573439 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 29.24 – 29.33 Mb | Хр. 4: 131.77 – 131.84 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
PTPRU (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type U) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 446 амінокислот, а молекулярна маса — 162 423[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MARAQALVLA | | LTFQLCAPET | | ETPAAGCTFE | | EASDPAVPCE | | YSQAQYDDFQ |
WEQVRIHPGT | | RAPADLPHGS | | YLMVNTSQHA | | PGQRAHVIFQ | | SLSENDTHCV |
QFSYFLYSRD | | GHSPGTLGVY | | VRVNGGPLGS | | AVWNMTGSHG | | RQWHQAELAV |
STFWPNEYQV | | LFEALISPDR | | RGYMGLDDIL | | LLSYPCAKAP | | HFSRLGDVEV |
NAGQNASFQC | | MAAGRAAEAE | | RFLLQRQSGA | | LVPAAGVRHI | | SHRRFLATFP |
LAAVSRAEQD | | LYRCVSQAPR | | GAGVSNFAEL | | IVKEPPTPIA | | PPQLLRAGPT |
YLIIQLNTNS | | IIGDGPIVRK | | EIEYRMARGP | | WAEVHAVSLQ | | TYKLWHLDPD |
TEYEISVLLT | | RPGDGGTGRP | | GPPLISRTKC | | AEPMRAPKGL | | AFAEIQARQL |
TLQWEPLGYN | | VTRCHTYTVS | | LCYHYTLGSS | | HNQTIRECVK | | TEQGVSRYTI |
KNLLPYRNVH | | VRLVLTNPEG | | RKEGKEVTFQ | | TDEDVPSGIA | | AESLTFTPLE |
DMIFLKWEEP | | QEPNGLITQY | | EISYQSIESS | | DPAVNVPGPR | | RTISKLRNET |
YHVFSNLHPG | | TTYLFSVRAR | | TGKGFGQAAL | | TEITTNISAP | | SFDYADMPSP |
LGESENTITV | | LLRPAQGRGA | | PISVYQVIVE | | EERARRLRRE | | PGGQDCFPVP |
LTFEAALARG | | LVHYFGAELA | | ASSLPEAMPF | | TVGDNQTYRG | | FWNPPLEPRK |
AYLIYFQAAS | | HLKGETRLNC | | IRIARKAACK | | ESKRPLEVSQ | | RSEEMGLILG |
ICAGGLAVLI | | LLLGAIIVII | | RKGRDHYAYS | | YYPKPVNMTK | | ATVNYRQEKT |
HMMSAVDRSF | | TDQSTLQEDE | | RLGLSFMDTH | | GYSTRGDQRS | | GGVTEASSLL |
GGSPRRPCGR | | KGSPYHTGQL | | HPAVRVADLL | | QHINQMKTAE | | GYGFKQEYES |
FFEGWDATKK | | KDKVKGSRQE | | PMPAYDRHRV | | KLHPMLGDPN | | ADYINANYID |
GYHRSNHFIA | | TQGPKPEMVY | | DFWRMVWQEH | | CSSIVMITKL | | VEVGRVKCSR |
YWPEDSDTYG | | DIKIMLVKTE | | TLAEYVVRTF | | ALERRGYSAR | | HEVRQFHFTA |
WPEHGVPYHA | | TGLLAFIRRV | | KASTPPDAGP | | IVIHCSAGTG | | RTGCYIVLDV |
MLDMAECEGV | | VDIYNCVKTL | | CSRRVNMIQT | | EEQYIFIHDA | | ILEACLCGET |
TIPVSEFKAT | | YKEMIRIDPQ | | SNSSQLREEF | | QTLNSVTPPL | | DVEECSIALL |
PRNRDKNRSM | | DVLPPDRCLP | | FLISTDGDSN | | NYINAALTDS | | YTRSAAFIVT |
LHPLQSTTPD | | FWRLVYDYGC | | TSIVMLNQLN | | QSNSAWPCLQ | | YWPEPGRQQY |
GLMEVEFMSG | | TADEDLVARV | | FRVQNISRLQ | | EGHLLVRHFQ | | FLRWSAYRDT |
PDSKKAFLHL | | LAEVDKWQAE | | SGDGRTIVHC | | LNGGGRSGTF | | CACATVLEMI |
RCHNLVDVFF | | AAKTLRNYKP | | NMVETMDQYH | | FCYDVALEYL | | EGLESR |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, диференціація, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Crossland S., Smith P.D., Crompton M.R. (1996). Molecular cloning and characterization of PTP pi, a novel receptor-like protein-tyrosine phosphatase. Biochem. J. 319: 249—254. PMID 8870675 DOI:10.1042/bj3190249
- Wang B., Kishihara K., Zhang D., Hara H., Nomoto K. (1997). Molecular cloning and characterization of a novel human receptor protein tyrosine phosphatase gene, hPTP-J: down-regulation of gene expression by PMA and calcium ionophore in Jurkat T lymphoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 231: 77—81. PMID 9070223 DOI:10.1006/bbrc.1997.6004
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Wang B., Kishihara K., Zhang D., Sakamoto T., Nomoto K. (1999). Transcriptional regulation of a receptor protein tyrosine phosphatase gene hPTP-J by PKC-mediated signaling pathways in Jurkat and Molt-4 T lymphoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1450: 331—340. PMID 10395944 DOI:10.1016/S0167-4889(99)00064-6
- Taniguchi Y., London R., Schinkmann K., Jiang S., Avraham H. (1999). The receptor protein tyrosine phosphatase, PTP-RO, is upregulated during megakaryocyte differentiation and is associated with the c-Kit receptor. Blood. 94: 539—549. PMID 10397721
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9683 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q92729 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |