PTPRU

Ідентифікатори

Символи

PTPRU, FMI, PCP-2, PTP, PTP-J, PTP-PI, PTP-RO, PTPPSI, PTPRO, PTPU2, R-PTP-PSI, R-PTP-U, hPTP-J, protein tyrosine phosphatase, receptor type U, protein tyrosine phosphatase receptor type U

Зовнішні ІД

OMIM: 602454 MGI: 1321151 HomoloGene: 4168 GeneCards: PTPRU

Онтологія гена
Молекулярна функція	• beta-catenin binding • phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine phosphatase activity • identical protein binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • integral component of plasma membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана
Біологічний процес	• диференціація клітин • response to glucocorticoid • homotypic cell-cell adhesion • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway • negative regulation of cell migration • protein localization to cell surface • animal organ regeneration • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • адгезія клітин • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • GO:0016576 protein dephosphorylation • cell-cell adhesion • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10076


19273

Ensembl


ENSG00000060656


ENSMUSG00000028909

UniProt


Q92729


B1AUH1

RefSeq (мРНК)


NM_001195001 NM_005704 NM_133177 NM_133178


NM_001083119 NM_011214

RefSeq (білок)


NP_001181930 NP_005695 NP_573438 NP_573439


NP_001076588 NP_035344

Локус (UCSC)

Хр. 1: 29.24 – 29.33 Mb

Хр. 4: 131.77 – 131.84 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTPRU (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type U) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 446 амінокислот, а молекулярна маса — 162 423^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARAQALVLA	LTFQLCAPET	ETPAAGCTFE	EASDPAVPCE	YSQAQYDDFQ
WEQVRIHPGT	RAPADLPHGS	YLMVNTSQHA	PGQRAHVIFQ	SLSENDTHCV
QFSYFLYSRD	GHSPGTLGVY	VRVNGGPLGS	AVWNMTGSHG	RQWHQAELAV
STFWPNEYQV	LFEALISPDR	RGYMGLDDIL	LLSYPCAKAP	HFSRLGDVEV
NAGQNASFQC	MAAGRAAEAE	RFLLQRQSGA	LVPAAGVRHI	SHRRFLATFP
LAAVSRAEQD	LYRCVSQAPR	GAGVSNFAEL	IVKEPPTPIA	PPQLLRAGPT
YLIIQLNTNS	IIGDGPIVRK	EIEYRMARGP	WAEVHAVSLQ	TYKLWHLDPD
TEYEISVLLT	RPGDGGTGRP	GPPLISRTKC	AEPMRAPKGL	AFAEIQARQL
TLQWEPLGYN	VTRCHTYTVS	LCYHYTLGSS	HNQTIRECVK	TEQGVSRYTI
KNLLPYRNVH	VRLVLTNPEG	RKEGKEVTFQ	TDEDVPSGIA	AESLTFTPLE
DMIFLKWEEP	QEPNGLITQY	EISYQSIESS	DPAVNVPGPR	RTISKLRNET
YHVFSNLHPG	TTYLFSVRAR	TGKGFGQAAL	TEITTNISAP	SFDYADMPSP
LGESENTITV	LLRPAQGRGA	PISVYQVIVE	EERARRLRRE	PGGQDCFPVP
LTFEAALARG	LVHYFGAELA	ASSLPEAMPF	TVGDNQTYRG	FWNPPLEPRK
AYLIYFQAAS	HLKGETRLNC	IRIARKAACK	ESKRPLEVSQ	RSEEMGLILG
ICAGGLAVLI	LLLGAIIVII	RKGRDHYAYS	YYPKPVNMTK	ATVNYRQEKT
HMMSAVDRSF	TDQSTLQEDE	RLGLSFMDTH	GYSTRGDQRS	GGVTEASSLL
GGSPRRPCGR	KGSPYHTGQL	HPAVRVADLL	QHINQMKTAE	GYGFKQEYES
FFEGWDATKK	KDKVKGSRQE	PMPAYDRHRV	KLHPMLGDPN	ADYINANYID
GYHRSNHFIA	TQGPKPEMVY	DFWRMVWQEH	CSSIVMITKL	VEVGRVKCSR
YWPEDSDTYG	DIKIMLVKTE	TLAEYVVRTF	ALERRGYSAR	HEVRQFHFTA
WPEHGVPYHA	TGLLAFIRRV	KASTPPDAGP	IVIHCSAGTG	RTGCYIVLDV
MLDMAECEGV	VDIYNCVKTL	CSRRVNMIQT	EEQYIFIHDA	ILEACLCGET
TIPVSEFKAT	YKEMIRIDPQ	SNSSQLREEF	QTLNSVTPPL	DVEECSIALL
PRNRDKNRSM	DVLPPDRCLP	FLISTDGDSN	NYINAALTDS	YTRSAAFIVT
LHPLQSTTPD	FWRLVYDYGC	TSIVMLNQLN	QSNSAWPCLQ	YWPEPGRQQY
GLMEVEFMSG	TADEDLVARV	FRVQNISRLQ	EGHLLVRHFQ	FLRWSAYRDT
PDSKKAFLHL	LAEVDKWQAE	SGDGRTIVHC	LNGGGRSGTF	CACATVLEMI
RCHNLVDVFF	AAKTLRNYKP	NMVETMDQYH	FCYDVALEYL	EGLESR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, диференціація, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

Crossland S., Smith P.D., Crompton M.R. (1996). Molecular cloning and characterization of PTP pi, a novel receptor-like protein-tyrosine phosphatase. Biochem. J. 319: 249—254. PMID 8870675 DOI:10.1042/bj3190249
Wang B., Kishihara K., Zhang D., Hara H., Nomoto K. (1997). Molecular cloning and characterization of a novel human receptor protein tyrosine phosphatase gene, hPTP-J: down-regulation of gene expression by PMA and calcium ionophore in Jurkat T lymphoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 231: 77—81. PMID 9070223 DOI:10.1006/bbrc.1997.6004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang B., Kishihara K., Zhang D., Sakamoto T., Nomoto K. (1999). Transcriptional regulation of a receptor protein tyrosine phosphatase gene hPTP-J by PKC-mediated signaling pathways in Jurkat and Molt-4 T lymphoma cells. Biochim. Biophys. Acta. 1450: 331—340. PMID 10395944 DOI:10.1016/S0167-4889(99)00064-6
Taniguchi Y., London R., Schinkmann K., Jiang S., Avraham H. (1999). The receptor protein tyrosine phosphatase, PTP-RO, is upregulated during megakaryocyte differentiation and is associated with the c-Kit receptor. Blood. 94: 539—549. PMID 10397721

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9683 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q92729 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.