RBBP8 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2L4Z, 4D2H | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBBP8, COM1, CTIP, JWDS, RIM, SAE2, SCKL2, retinoblastoma binding protein 8, RB binding protein 8, endonuclease |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604124 MGI: 2442995 HomoloGene: 28546 GeneCards: RBBP8 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Seckel syndrome 2, Jawad syndrome[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nuclease activity • hydrolase activity • endonuclease activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • damaged DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity • identical protein binding • Y-form DNA binding • double-strand/single-strand DNA junction binding • double-stranded DNA binding • single-stranded DNA binding • flap-structured DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • transcription repressor complex • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • site of double-strand break |
---|
Біологічний процес | • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleotide-excision repair • поділ клітини • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • response to estradiol • GO:0007126 мейоз • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to DNA damage stimulus • blastocyst hatching • DNA double-strand break processing • реплікація ДНК • DNA double-strand break processing involved in repair via single-strand annealing • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • double-strand break repair via homologous recombination • negative regulation of G0 to G1 transition • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • G1/S transition of mitotic cell cycle • regulation of signal transduction by p53 class mediator |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_002894 NM_203291 NM_203292 |
| | NM_001081223 NM_001252495 NM_175458 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_002885 NP_976036 NP_976037 NP_002885.1 NP_976036.1 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 18: 22.8 – 23.03 Mb | Хр. 18: 11.77 – 11.88 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBBP8 (англ. RB binding protein 8, endonuclease) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 897 амінокислот, а молекулярна маса — 101 942[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNISGSSCGS | | PNSADTSSDF | | KDLWTKLKEC | | HDREVQGLQV | | KVTKLKQERI |
LDAQRLEEFF | | TKNQQLREQQ | | KVLHETIKVL | | EDRLRAGLCD | | RCAVTEEHMR |
KKQQEFENIR | | QQNLKLITEL | | MNERNTLQEE | | NKKLSEQLQQ | | KIENDQQHQA |
AELECEEDVI | | PDSPITAFSF | | SGVNRLRRKE | | NPHVRYIEQT | | HTKLEHSVCA |
NEMRKVSKSS | | THPQHNPNEN | | EILVADTYDQ | | SQSPMAKAHG | | TSSYTPDKSS |
FNLATVVAET | | LGLGVQEESE | | TQGPMSPLGD | | ELYHCLEGNH | | KKQPFEESTR |
NTEDSLRFSD | | STSKTPPQEE | | LPTRVSSPVF | | GATSSIKSGL | | DLNTSLSPSL |
LQPGKKKHLK | | TLPFSNTCIS | | RLEKTRSKSE | | DSALFTHHSL | | GSEVNKIIIQ |
SSNKQILINK | | NISESLGEQN | | RTEYGKDSNT | | DKHLEPLKSL | | GGRTSKRKKT |
EEESEHEVSC | | PQASFDKENA | | FPFPMDNQFS | | MNGDCVMDKP | | LDLSDRFSAI |
QRQEKSQGSE | | TSKNKFRQVT | | LYEALKTIPK | | GFSSSRKASD | | GNCTLPKDSP |
GEPCSQECII | | LQPLNKCSPD | | NKPSLQIKEE | | NAVFKIPLRP | | RESLETENVL |
DDIKSAGSHE | | PIKIQTRSDH | | GGCELASVLQ | | LNPCRTGKIK | | SLQNNQDVSF |
ENIQWSIDPG | | ADLSQYKMDV | | TVIDTKDGSQ | | SKLGGETVDM | | DCTLVSETVL |
LKMKKQEQKG | | EKSSNEERKM | | NDSLEDMFDR | | TTHEEYESCL | | ADSFSQAADE |
EEELSTATKK | | LHTHGDKQDK | | VKQKAFVEPY | | FKGDERETSL | | QNFPHIEVVR |
KKEERRKLLG | | HTCKECEIYY | | ADMPAEEREK | | KLASCSRHRF | | RYIPPNTPEN |
FWEVGFPSTQ | | TCMERGYIKE | | DLDPCPRPKR | | RQPYNAIFSP | | KGKEQKT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, мейоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Fusco C., Reymond A., Zervos A.S. (1998). Molecular cloning and characterization of a novel retinoblastoma-binding protein. Genomics. 51: 351—358. PMID 9721205 DOI:10.1006/geno.1998.5368
- Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd J.M., Chinnadurai G. (1998). Interaction between a cellular protein that binds to the C-terminal region of adenovirus E1A (CtBP) and a novel cellular protein is disrupted by E1A through a conserved PLDLS motif. J. Biol. Chem. 273: 8549—8552. PMID 9535825 DOI:10.1074/jbc.273.15.8549
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yu X., Baer R. (2000). Nuclear localization and cell cycle-specific expression of CtIP, a protein that associates with the BRCA1 tumor suppressor. J. Biol. Chem. 275: 18541—18549. PMID 10764811 DOI:10.1074/jbc.M909494199
- Yu X., Chen J. (2004). DNA damage-induced cell cycle checkpoint control requires CtIP, a phosphorylation-dependent binding partner of BRCA1 C-terminal domains. Mol. Cell. Biol. 24: 9478—9486. PMID 15485915 DOI:10.1128/MCB.24.21.9478-9486.2004
- Yu X., Fu S., Lai M., Baer R., Chen J. (2006). BRCA1 ubiquitinates its phosphorylation-dependent binding partner CtIP. Genes Dev. 20: 1721—1726. PMID 16818604 DOI:10.1101/gad.1431006
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RBBP8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9891 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q99708 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |