RBM15

Ідентифікатори

Символи

RBM15, OTT, OTT1, SPEN, RNA binding motif protein 15, Putative RNA-binding protein 15

Зовнішні ІД

OMIM: 606077 MGI: 2443205 HomoloGene: 23383 GeneCards: RBM15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding
Клітинна компонента	• nuclear speck • ядерна мембрана • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear envelope • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex
Біологічний процес	• branching involved in blood vessel morphogenesis • ventricular septum morphogenesis • mRNA splicing, via spliceosome • placenta blood vessel development • GO:0022415 viral process • negative regulation of myeloid cell differentiation • spleen development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription of Notch receptor target • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • RNA methylation • dosage compensation by inactivation of X chromosome • thrombopoietin-mediated signaling pathway • regulation of megakaryocyte differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64783


229700

Ensembl


ENSG00000162775


ENSMUSG00000048109

UniProt


Q96T37


Q0VBL3

RefSeq (мРНК)


NM_001201545 NM_022768 NM_014092


NM_001045807

RefSeq (білок)


NP_001188474 NP_073605


NP_001039272

Локус (UCSC)

Хр. 1: 110.34 – 110.35 Mb

Хр. 3: 107.23 – 107.24 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM15 (англ. RNA binding motif protein 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 107 189^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRTAGRDPVP	RRSPRWRRAV	PLCETSAGRR	VTQLRGDDLR	RPATMKGKER
SPVKAKRSRG	GEDSTSRGER	SKKLGGSGGS	NGSSSGKTDS	GGGSRRSLHL
DKSSSRGGSR	EYDTGGGSSS	SRLHSYSSPS	TKNSSGGGES	RSSSRGGGGE
SRSSGAASSA	PGGGDGAEYK	TLKISELGSQ	LSDEAVEDGL	FHEFKRFGDV
SVKISHLSGS	GSGDERVAFV	NFRRPEDARA	AKHARGRLVL	YDRPLKIEAV
YVSRRRSRSP	LDKDTYPPSA	SVVGASVGGH	RHPPGGGGGQ	RSLSPGGAAL
GYRDYRLQQL	ALGRLPPPPP	PPLPRDLERE	RDYPFYERVR	PAYSLEPRVG
AGAGAAPFRE	VDEISPEDDQ	RANRTLFLGN	LDITVTESDL	RRAFDRFGVI
TEVDIKRPSR	GQTSTYGFLK	FENLDMSHRA	KLAMSGKIII	RNPIKIGYGK
ATPTTRLWVG	GLGPWVPLAA	LAREFDRFGT	IRTIDYRKGD	SWAYIQYESL
DAAHAAWTHM	RGFPLGGPDR	RLRVDFADTE	HRYQQQYLQP	LPLTHYELVT
DAFGHRAPDP	LRGARDRTPP	LLYRDRDRDL	YPDSDWVPPP	PPVRERSTRT
AATSVPAYEP	LDSLDRRRDG	WSLDRDRGDR	DLPSSRDQPR	KRRLPEESGG
RHLDRSPESD	RPRKRHCAPS	PDRSPELSSS	RDRYNSDNDR	SSRLLLERPS
PIRDRRGSLE	KSQGDKRDRK	NSASAERDRK	HRTTAPTEGK	SPLKKEDRSD
GSAPSTSTAS	SKLKSPSQKQ	DGGTAPVASA	SPKLCLAWQG	MLLLKNSNFP
SNMHLLQGDL	QVASSLLVEG	STGGKVAQLK	ITQRLRLDQP	KLDEVTRRIK
VAGPNGYAIL	LAVPGSSDSR	SSSSSAASDT	ATSTQRPLRN	LVSYLKQKQA
AGVISLPVGG	NKDKENTGVL	HAFPPCEFSQ	QFLDSPAKAL	AKSEEDYLVM
IIVRGFGFQI	GVRYENKKRE	NLALTLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Lee J.H., Skalnik D.G. (2012). Rbm15-Mkl1 interacts with the Setd1b histone H3-Lys4 methyltransferase via a SPOC domain that is required for cytokine-independent proliferation. PLoS ONE. 7: E42965—E42965. PMID 22927943 DOI:10.1371/journal.pone.0042965

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14959 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96T37 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.