RBM39 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2JRS, 2MHN, 4OO6, 4OZ0, 4OZ1, 4YUD | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RBM39, CAPER, CAPERalpha, FSAP59, HCC1, RNPC2, RNA binding motif protein 39 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604739 MGI: 2157953 HomoloGene: 136465 GeneCards: RBM39 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • microtubule cytoskeleton • клітинне ядро • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • nuclear speck • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001242599 NM_001242600 NM_004902 NM_184234 NM_184237
| NM_184241 NM_184244 NM_001323422 NM_001323423 NM_001323424 |
| NM_001291114 NM_001291115 NM_133242 NM_001362763 NM_001362764
| NM_001362765 NM_001362766 NM_001362767 NM_001362768 NM_001362769 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001229528 NP_001229529 NP_001310351 NP_001310352 NP_001310353
| NP_004893 NP_909122 |
| NP_001278043 NP_001278044 NP_573505 NP_001349692 NP_001349693
| NP_001349694 NP_001349695 NP_001349696 NP_001349697 NP_001349698 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 35.7 – 35.74 Mb | Хр. 2: 156.15 – 156.18 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RBM39 (англ. RNA binding motif protein 39) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот, а молекулярна маса — 59 380[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADDIDIEAM | | LEAPYKKDEN | | KLSSANGHEE | | RSKKRKKSKS | | RSRSHERKRS |
KSKERKRSRD | | RERKKSKSRE | | RKRSRSKERR | | RSRSRSRDRR | | FRGRYRSPYS |
GPKFNSAIRG | | KIGLPHSIKL | | SRRRSRSKSP | | FRKDKSPVRE | | PIDNLTPEER |
DARTVFCMQL | | AARIRPRDLE | | EFFSTVGKVR | | DVRMISDRNS | | RRSKGIAYVE |
FVDVSSVPLA | | IGLTGQRVLG | | VPIIVQASQA | | EKNRAAAMAN | | NLQKGSAGPM |
RLYVGSLHFN | | ITEDMLRGIF | | EPFGRIESIQ | | LMMDSETGRS | | KGYGFITFSD |
SECAKKALEQ | | LNGFELAGRP | | MKVGHVTERT | | DASSASSFLD | | SDELERTGID |
LGTTGRLQLM | | ARLAEGTGLQ | | IPPAAQQALQ | | MSGSLAFGAV | | AEFSFVIDLQ |
TRLSQQTEAS | | ALAAAASVQP | | LATQCFQLSN | | MFNPQTEEEV | | GWDTEIKDDV |
IEECNKHGGV | | IHIYVDKNSA | | QGNVYVKCPS | | IAAAIAAVNA | | LHGRWFAGKM |
ITAAYVPLPT | | YHNLFPDSMT | | ATQLLVPSRR |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Imai H., Chan E.K.L., Kiyosawa K., Fu X.-D., Tan E.M. (1993). Novel nuclear autoantigen with splicing factor motifs identified with antibody from hepatocellular carcinoma. J. Clin. Invest. 92: 2419—2426. PMID 8227358 DOI:10.1172/JCI116848
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cazalla D., Newton K., Caceres J.F. (2005). A novel SR-related protein is required for the second step of pre-mRNA splicing. Mol. Cell. Biol. 25: 2969—2980. PMID 15798186 DOI:10.1128/MCB.25.8.2969-2980.2005
- Loerch S., Maucuer A., Manceau V., Green M.R., Kielkopf C.L. (2014). Cancer-relevant splicing factor CAPERalpha engages the essential splicing factor SF3b155 in a specific ternary complex. J. Biol. Chem. 289: 17325—17337. PMID 24795046 DOI:10.1074/jbc.M114.558825
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15923 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q14498 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |