RNF220 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

RNF220

Ідентифікатори

Символи

RNF220, C1orf164, ring finger protein 220, HLD23

Зовнішні ІД

OMIM: 616136 MGI: 1913993 HomoloGene: 10036 GeneCards: RNF220

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма
Біологічний процес	• protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55182


66743

Ensembl


ENSG00000187147


ENSMUSG00000028677

UniProt


Q5VTB9


Q6PDX6

RefSeq (мРНК)

NM_018150 NM_001319956 NM_001319957 NM_001376486 NM_001376487
NM_001376488 NM_001376489 NM_016501


NM_025739 NM_001310729 NM_001310730 NM_001310731

RefSeq (білок)

NP_001306885 NP_001306886 NP_060620 NP_001363415 NP_001363416
NP_001363417 NP_001363418


NP_001297658 NP_001297659 NP_001297660 NP_080015

Локус (UCSC)

Хр. 1: 44.41 – 44.65 Mb

Хр. 4: 117.13 – 117.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNF220 (англ. Ring finger protein 220) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 62 765^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLHRAAFKM	ENSSYLPNPL	ASPALMVLAS	TAEASRDASI	PCQQPRPFGV
PVSVDKDVHI	PFTNGSYTFA	SMYHRQGGVP	GTFANRDFPP	SLLHLHPQFA
PPNLDCTPIS	MLNHSGVGAF	RPFASTEDRE	SYQSAFTPAK	RLKNCHDTES
PHLRFSDADG	KEYDFGTQLP	SSSPGSLKVD	DTGKKIFAVS	GLISDREASS
SPEDRNDRCK	KKAAALFDSQ	APICPICQVL	LRPSELQEHM	EQELEQLAQL
PSSKNSLLKD	AMAPGTPKSL	LLSASIKREG	ESPTASPHSS	ATDDLHHSDR
YQTFLRVRAN	RQTRLNARIG	KMKRRKQDEG	QREGSCMAED	DAVDIEHENN
NRFEEYEWCG	QKRIRATTLL	EGGFRGSGFI	MCSGKENPDS	DADLDVDGDD
TLEYGKPQYT	EADVIPCTGE	EPGEAKEREA	LRGAVLNGGP	PSTRITPEFS
KWASDEMPST	SNGESSKQEA	MQKTCKNSDI	EKITEDSAVT	TFEALKARVR
ELERQLSRGD	RYKCLICMDS	YSMPLTSIQC	WHVHCEECWL	RTLGAKKLCP
QCNTITAPGD	LRRIYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25552 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5VTB9 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.