RNGTT |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e2/Protein_RNGTT_PDB_1i9s.png/250px-Protein_RNGTT_PDB_1i9s.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2C46, 3S24 | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | RNGTT, CAP1A, HCE, HCE1, hCAP, RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603512 MGI: 1329041 HomoloGene: 37851 GeneCards: RNGTT |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • polynucleotide 5'-phosphatase activity • RNA guanylyltransferase activity • triphosphatase activity • nucleotidyltransferase activity • mRNA guanylyltransferase activity • каталітична активність • hydrolase activity • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0016576 protein dephosphorylation • transcription by RNA polymerase II • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • 7-methylguanosine mRNA capping • обмін речовин • peptidyl-tyrosine dephosphorylation • polynucleotide 5' dephosphorylation • GO:0022415 viral process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/37/PBB_GE_RNGTT_204208_at_fs.png/250px-PBB_GE_RNGTT_204208_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/14/PBB_GE_RNGTT_211849_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RNGTT_211849_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/d4/PBB_GE_RNGTT_204207_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_RNGTT_204207_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001286426 NM_001286428 NM_003800 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001273355 NP_001273357 NP_003791 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 6: 88.61 – 88.96 Mb | Хр. 4: 33.31 – 33.5 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
RNGTT (англ. RNA guanylyltransferase and 5'-phosphatase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 557[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAHNKIPPRW | | LNCPRRGQPV | | AGRFLPLKTM | | LGPRYDSQVA | | EENRFHPSML |
SNYLKSLKVK | | MGLLVDLTNT | | SRFYDRNDIE | | KEGIKYIKLQ | | CKGHGECPTT |
ENTETFIRLC | | ERFNERNPPE | | LIGVHCTHGF | | NRTGFLICAF | | LVEKMDWSIE |
AAVATFAQAR | | PPGIYKGDYL | | KELFRRYGDI | | EEAPPPPLLP | | DWCFEDDEDE |
DEDEDGKKES | | EPGSSASFGK | | RRKERLKLGA | | IFLEGVTVKG | | VTQVTTQPKL |
GEVQQKCHQF | | CGWEGSGFPG | | AQPVSMDKQN | | IKLLDLKPYK | | VSWKADGTRY |
MMLIDGTNEV | | FMIDRDNSVF | | HVSNLEFPFR | | KDLRMHLSNT | | LLDGEMIIDR |
VNGQAVPRYL | | IYDIIKFNSQ | | PVGDCDFNVR | | LQCIEREIIS | | PRHEKMKTGL |
IDKTQEPFSV | | RNKPFFDICT | | SRKLLEGNFA | | KEVSHEMDGL | | IFQPTGKYKP |
GRCDDILKWK | | PPSLNSVDFR | | LKITRMGGEG | | LLPQNVGLLY | | VGGYERPFAQ |
IKVTKELKQY | | DNKIIECKFE | | NNSWVFMRQR | | TDKSFPNAYN | | TAMAVCNSIS |
NPVTKEMLFE | | FIDRCTAASQ | | GQKRKHHLDP | | DTELMPPPPP | | KRPRPLT |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.
Література
- Yamada-Okabe T., Doi R., Shimmi O., Arisawa M., Yamada-Okabe H. (1998). Isolation and characterization of a human cDNA for mRNA 5'-capping enzyme. Nucleic Acids Res. 26: 1700—1706. PMID 9512541 DOI:10.1093/nar/26.7.1700
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pillutla R.C., Yue Z., Maldonado E., Shatkin A.J. (1998). Recombinant human mRNA cap methyltransferase binds capping enzyme/RNA polymerase IIo complexes. J. Biol. Chem. 273: 21443—21446. PMID 9705270 DOI:10.1074/jbc.273.34.21443
- Wen Y., Shatkin A.J. (1999). Transcription elongation factor hSPT5 stimulates mRNA capping. Genes Dev. 13: 1774—1779. PMID 10421630 DOI:10.1101/gad.13.14.1774
- Chiu Y.-L., Coronel E., Ho C.K., Shuman S., Rana T.M. (2001). HIV-1 Tat protein interacts with mammalian capping enzyme and stimulates capping of TAR RNA. J. Biol. Chem. 276: 12959—12966. PMID 11278368 DOI:10.1074/jbc.M007901200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10073 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O60942 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |