SDC3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SDC3, SDCN, SYND3, syndecan 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 186357 MGI: 1349163 HomoloGene: 7965 GeneCards: SDC3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal lumen • Golgi lumen • cell surface • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • microspike |
---|
Біологічний процес | • glycosaminoglycan metabolic process • retinoid metabolic process • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • leukocyte migration • cell migration |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 30.87 – 30.91 Mb | Хр. 4: 130.52 – 130.55 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SDC3 (англ. Syndecan 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот, а молекулярна маса — 45 497[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MKPGPPHRAG | | AAHGAGAGAG | | AAAGPGARGL | | LLPPLLLLLL | | AGRAAGAQRW |
RSENFERPVD | | LEGSGDDDSF | | PDDELDDLYS | | GSGSGYFEQE | | SGIETAMRFS |
PDVALAVSTT | | PAVLPTTNIQ | | PVGTPFEELP | | SERPTLEPAT | | SPLVVTEVPE |
EPSQRATTVS | | TTMATTAATS | | TGDPTVATVP | | ATVATATPST | | PAAPPFTATT |
AVIRTTGVRR | | LLPLPLTTVA | | TARATTPEAP | | SPPTTAAVLD | | TEAPTPRLVS |
TATSRPRALP | | RPATTQEPDI | | PERSTLPLGT | | TAPGPTEVAQ | | TPTPETFLTT |
IRDEPEVPVS | | GGPSGDFELP | | EEETTQPDTA | | NEVVAVGGAA | | AKASSPPGTL |
PKGARPGPGL | | LDNAIDSGSS | | AAQLPQKSIL | | ERKEVLVAVI | | VGGVVGALFA |
AFLVTLLIYR | | MKKKDEGSYT | | LEEPKQASVT | | YQKPDKQEEF | | YA |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.
Література
- Berndt C., Casaroli-Marano R.P., Vilaro S., Reina M. (2001). Cloning and characterization of human syndecan-3. J. Cell. Biochem. 82: 246—259. PMID 11527150 DOI:10.1002/jcb.1119
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Asundi V.K., Carey D.J. (1997). Phosphorylation of recombinant N-syndecan (syndecan 3) core protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 240: 502—506. PMID 9388509 DOI:10.1006/bbrc.1997.7684
- Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10660 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O75056 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |