SLC35C2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SLC35C2, BA394O2.1, C20orf5, CGI-15, OVCOV1, solute carrier family 35 member C2 |
---|
Зовнішні ІД | MGI: 2385166 HomoloGene: 6581 GeneCards: SLC35C2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • antiporter activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • cis-Golgi network • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • мембрана • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі |
---|
Біологічний процес | • protein O-linked fucosylation • fucosylation • negative regulation of gene expression • positive regulation of Notch signaling pathway • UDP-glucose transmembrane transport |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/fc/PBB_GE_SLC35C2_219447_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SLC35C2_219447_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001281457 NM_001281458 NM_001281459 NM_001281460 NM_015945
| NM_173073 NM_173179 |
| NM_001252573 NM_001252574 NM_001252575 NM_144893 NM_001363015
| NM_001363016 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_001268386 NP_001268387 NP_001268388 NP_001268389 NP_057029
| NP_775096 NP_775271 |
| NP_001239502 NP_001239503 NP_001239504 NP_659142 NP_001349944
| NP_001349945 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 46.35 – 46.36 Mb | Хр. 2: 165.12 – 165.13 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SLC35C2 (англ. Solute carrier family 35 member C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 432[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGRWALDVAF | | LWKAVLTLGL | | VLLYYCFSIG | | ITFYNKWLTK | | SFHFPLFMTM |
LHLAVIFLFS | | ALSRALVQCS | | SHRARVVLSW | | ADYLRRVAPT | | ALATALDVGL |
SNWSFLYVTV | | SLYTMTKSSA | | VLFILIFSLI | | FKLEELRAAL | | VLVVLLIAGG |
LFMFTYKSTQ | | FNVEGFALVL | | GASFIGGIRW | | TLTQMLLQKA | | ELGLQNPIDT |
MFHLQPLMFL | | GLFPLFAVFE | | GLHLSTSEKI | | FRFQDTGLLL | | RVLGSLFLGG |
ILAFGLGFSE | | FLLVSRTSSL | | TLSIAGIFKE | | VCTLLLAAHL | | LGDQISLLNW |
LGFALCLSGI | | SLHVALKALH | | SRGDGGPKAL | | KGLGSSPDLE | | LLLRSSQREE |
GDNEEEEYFV | | AQGQQ |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.
Література
- Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lu L., Hou X., Shi S., Korner C., Stanley P. (2010). Slc35c2 promotes Notch1 fucosylation and is required for optimal Notch signaling in mammalian cells. J. Biol. Chem. 285: 36245—36254. PMID 20837470 DOI:10.1074/jbc.M110.126003
- Leach R.E., Duniec-Dmuchowski Z.M., Tanaka T.S., Ko M.S.H., Krawetz S.A. (2001). Assignment of OVCOV1 (alias CGI-15) to human chromosome 20 band q13.1-->q13.2 by fluorescent in situ hybridization. Cytogenet. Cell Genet. 94: 252—253. PMID 11856893
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17117 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q9NQQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |