SNAI1

SNAI1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2Y48, 3W5K, 4QLI

Ідентифікатори
Символи SNAI1, SLUGH2, SNA, SNAH, SNAIL, SNAIL1, dJ710H13.1, snail family zinc finger 1, snail family transcriptional repressor 1
Зовнішні ІД OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
kinase binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
E-box binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
цитоплазма
нуклеоплазма
pericentric heterochromatin
гіалоплазма

Біологічний процес

trophoblast giant cell differentiation
roof of mouth development
regulation of bicellular tight junction assembly
positive regulation of cell migration
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation
negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage
multicellular organism development
negative regulation of vitamin D biosynthetic process
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
osteoblast differentiation
negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development
cartilage morphogenesis
hair follicle morphogenesis
left/right pattern formation
mesoderm development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
cell migration
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Notch signaling involved in heart development
mesoderm formation
Епітеліально-мезенхімальний перехід
positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
heterochromatin organization
aortic valve morphogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6615
20613
Ensembl
ENSG00000124216
ENSMUSG00000042821
UniProt
O95863
Q02085
RefSeq (мРНК)
NM_005985
NM_011427
RefSeq (білок)
NP_005976
NP_035557
Локус (UCSC) Хр. 20: 49.98 – 49.99 Mb Хр. 2: 167.38 – 167.38 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SNAI1 (англ. Snail family transcriptional repressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 264 амінокислот, а молекулярна маса — 29 083[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPRSFLVRKPSDPNRKPNYSELQDSNPEFTFQQPYDQAHLLAAIPPPEIL
NPTASLPMLIWDSVLAPQAQPIAWASLRLQESPRVAELTSLSDEDSGKGS
QPPSPPSPAPSSFSSTSVSSLEAEAYAAFPGLGQVPKQLAQLSEAKDLQA
RKAFNCKYCNKEYLSLGALKMHIRSHTLPCVCGTCGKAFSRPWLLQGHVR
THTGEKPFSCPHCSRAFADRSNLRAHLQTHSDVKKYQCQACARTFSRMSL
LHKHQESGCSGCPR

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Twigg S.R., Wilkie A.O.M. (1999). Characterisation of the human snail (SNAI1) gene and exclusion as a major disease gene in craniosynostosis. Hum. Genet. 105: 320—326. PMID 10543399 DOI:10.1007/s004399900143
  • Paznekas W.A., Okajima K., Schertzer M., Wood S., Jabs E.W. (1999). Genomic organization, expression, and chromosome location of the human SNAIL gene (SNAI1) and a related processed pseudogene (SNAI1P). Genomics. 62: 42—49. PMID 10585766 DOI:10.1006/geno.1999.6010
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Yook J.I., Li X.Y., Ota I., Fearon E.R., Weiss S.J. (2005). Wnt-dependent regulation of the E-cadherin repressor snail. J. Biol. Chem. 280: 11740—11748. PMID 15647282 DOI:10.1074/jbc.M413878200
  • Mingot J.M., Vega S., Maestro B., Sanz J.M., Nieto M.A. (2009). Characterization of Snail nuclear import pathways as representatives of C2H2 zinc finger transcription factors. J. Cell Sci. 122: 1452—1460. PMID 19386897 DOI:10.1242/jcs.041749
  • Lim S.O., Kim H., Jung G. (2010). p53 inhibits tumor cell invasion via the degradation of snail protein in hepatocellular carcinoma. FEBS Lett. 584: 2231—2236. PMID 20385133 DOI:10.1016/j.febslet.2010.04.006

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11128 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, O95863 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»