SNRPD2 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/90/Protein_SNRPD2_PDB_1b34.png/250px-Protein_SNRPD2_PDB_1b34.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1B34, 3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNRPD2, SMD2, SNRPD1, Sm-D2, Small nuclear ribonucleoprotein D2, small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601061 MGI: 98345 HomoloGene: 3381 GeneCards: SNRPD2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • U1 snRNP binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • нуклеоплазма • methylosome • precatalytic spliceosome • small nuclear ribonucleoprotein complex • pICln-Sm protein complex • spliceosomal complex • U4 snRNP • екзосома • клітинне ядро • U1 snRNP • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome |
---|
Біологічний процес | • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • spliceosomal complex assembly • Сплайсинг РНК • import into nucleus |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_004597 NM_177542 NM_001369751 NM_001369752 NM_001384647 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_004588 NP_808210 NP_001356680 NP_001356681 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 45.69 – 45.69 Mb | Хр. 7: 18.88 – 18.89 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNRPD2 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 118 амінокислот, а молекулярна маса — 13 527[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLLNKPKSE | | MTPEELQKRE | | EEEFNTGPLS | | VLTQSVKNNT | | QVLINCRNNK |
KLLGRVKAFD | | RHCNMVLENV | | KEMWTEVPKS | | GKGKKKSKPV | | NKDRYISKMF |
LRGDSVIVVL | | RNPLIAGK |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Lehmeier T., Raker V., Hermann H., Luehrmann R. (1994). cDNA cloning of the Sm proteins D2 and D3 from human small nuclear ribonucleoproteins: evidence for a direct D1-D2 interaction. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 12317—12321. PMID 7527560 DOI:10.1073/pnas.91.25.12317
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Pomeranz Krummel D.A., Oubridge C., Leung A.K., Li J., Nagai K. (2009). Crystal structure of human spliceosomal U1 snRNP at 5.5 A resolution. Nature. 458: 475—480. PMID 19325628 DOI:10.1038/nature07851
- Leung A.K., Nagai K., Li J. (2011). Structure of the spliceosomal U4 snRNP core domain and its implication for snRNP biogenesis. Nature. 473: 536—539. PMID 21516107 DOI:10.1038/nature09956
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11159 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P62316 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |