SNRPF |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNRPF, SMF, Sm-F, snRNP-F, Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603541 MGI: 1917128 HomoloGene: 130366 GeneCards: SNRPF |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • U4 snRNP • SMN-Sm protein complex • pICln-Sm protein complex • клітинне ядро • U7 snRNP • catalytic step 2 spliceosome • U1 snRNP • цитоплазма • sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex • нуклеоплазма • small nuclear ribonucleoprotein complex • U12-type spliceosomal complex • methylosome • гіалоплазма • spliceosomal complex • U2-type catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • U2-type precatalytic spliceosome |
---|
Біологічний процес | • termination of RNA polymerase II transcription • histone mRNA metabolic process • mRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • import into nucleus • spliceosomal snRNP assembly |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/8e/PBB_GE_SNRPF_203832_at_fs.png/250px-PBB_GE_SNRPF_203832_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 12: 95.86 – 95.9 Mb | Хр. 10: 93.42 – 93.43 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNRPF (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 86 амінокислот, а молекулярна маса — 9 725[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLPLNPKPF | | LNGLTGKPVM | | VKLKWGMEYK | | GYLVSVDGYM | | NMQLANTEEY |
IDGALSGHLG | | EVLIRCNNVL | | YIRGVEEEEE | | DGEMRE |
Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
- Pomeranz Krummel D.A., Oubridge C., Leung A.K., Li J., Nagai K. (2009). Crystal structure of human spliceosomal U1 snRNP at 5.5 A resolution. Nature. 458: 475—480. PMID 19325628 DOI:10.1038/nature07851
- Leung A.K., Nagai K., Li J. (2011). Structure of the spliceosomal U4 snRNP core domain and its implication for snRNP biogenesis. Nature. 473: 536—539. PMID 21516107 DOI:10.1038/nature09956
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11162 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P62306 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |