SNRPN

Ідентифікатори

Символи

SNRPN, HCERN3, PWCR, RT-LI, SM-D, SMN, SNRNP-N, SNURF-sm-N, Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N

Зовнішні ІД

OMIM: 182279 MGI: 98347 HomoloGene: 68297 GeneCards: SNRPN

Пов'язані генетичні захворювання

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • U5 snRNP • catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • spliceosomal complex • U4 snRNP • small nuclear ribonucleoprotein complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • U1 snRNP • U2 snRNP
Біологічний процес	• Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • response to hormone
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6638


20646

Ensembl


ENSG00000128739


н/д

UniProt


P63162


P63163

RefSeq (мРНК)

NM_001349454 NM_001349455 NM_001349456 NM_001349457 NM_001349458
NM_001349459 NM_001349460 NM_001349461 NM_001349462 NM_001349463 NM_001349464 NM_001349465 NM_003097 NM_022805 NM_022806 NM_022807 NM_022808 NM_001378249 NM_001378251 NM_001378252 NM_001378253 NM_001378254 NM_001378255 NM_001378256 NM_001378257


NM_001082961 NM_001082962 NM_013670

RefSeq (білок)

NP_003088 NP_073716 NP_073717 NP_073718 NP_073719
NP_001336383 NP_001336384 NP_001336385 NP_001336386 NP_001336387 NP_001336388 NP_001336389 NP_001336390 NP_001336391 NP_001336392 NP_001336393 NP_001336394 NP_001365178 NP_001365180 NP_001365181 NP_001365182 NP_001365183 NP_001365184 NP_001365185 NP_001365186

NP_001076430 NP_001076431 NP_038698 NP_001336619 NP_001336620
NP_001336621 NP_001336622 NP_001336623 NP_001336624

Локус (UCSC)

Хр. 15: 24.82 – 24.98 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNRPN (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 24 614^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVGKSSKML	QHIDYRMRCI	LQDGRIFIGT	FKAFDKHMNL	ILCDCDEFRK
IKPKNAKQPE	REEKRVLGLV	LLRGENLVSM	TVEGPPPKDT	GIARVPLAGA
AGGPGVGRAA	GRGVPAGVPI	PQAPAGLAGP	VRGVGGPSQQ	VMTPQGRGTV
AAAAVAATAS	IAGAPTQYPP	GRGTPPPPVG	RATPPPGIMA	PPPGMRPPMG
PPIGLPPARG	TPIGMPPPGM	RPPPPGIRGP	PPPGMRPPRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Schmauss C., McAllister G., Ohosone Y., Hardin J.A., Lerner M.R. (1989). A comparison of snRNP-associated Sm-autoantigens: human N, rat N and human B/B'. Nucleic Acids Res. 17: 1733—1743. PMID 2522186 DOI:10.1093/nar/17.4.1733
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Esposito F., Fiore F., Cimino F., Russo T. (1993). Isolation and structural characterization of the rat gene encoding the brain specific snRNP-associated polypeptide 'N'. Biochem. Biophys. Res. Commun. 195: 317—326. PMID 8363612 DOI:10.1006/bbrc.1993.2047
Sharpe N.G., Williams D.G., Howarth D.N., Coles B., Latchman D.S. (1989). Isolation of cDNA clones encoding the human Sm B/B' auto-immune antigen and specifically reacting with human anti-Sm auto-immune sera. FEBS Lett. 250: 585—590. PMID 2753153 DOI:10.1016/0014-5793(89)80801-4
Gray T.A., Saitoh S., Nicholls R.D. (1999). An imprinted, mammalian bicistronic transcript encodes two independent proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 5616—5621. PMID 10318933 DOI:10.1073/pnas.96.10.5616
Cote J., Richard S. (2005). Tudor domains bind symmetrical dimethylated arginines. J. Biol. Chem. 280: 28476—28483. PMID 15955813 DOI:10.1074/jbc.M414328200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNRPN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11164 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P63162 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.