SNX1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2I4K, 4FZS | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX1, HsT17379, VPS5, sorting nexin 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601272 MGI: 1928395 HomoloGene: 99716 GeneCards: SNX1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • insulin receptor binding • leptin receptor binding • epidermal growth factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • identical protein binding • protein heterodimerization activity • transferrin receptor binding • lipid binding • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • cell projection • early endosome membrane • мембрана • retromer, tubulation complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • retromer complex • early endosome • endosome membrane • lamellipodium • extrinsic component of membrane • везикула • лізосома • ендосома • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle organization • early endosome to Golgi transport • receptor internalization • endosomal transport • retrograde transport, endosome to Golgi • protein transport • intracellular protein transport • lamellipodium morphogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001242933 NM_003099 NM_148955 NM_152826 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001229862 NP_003090 NP_683758 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 64.09 – 64.15 Mb | Хр. 9: 66 – 66.03 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX1 (англ. Sorting nexin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 070[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MASGGGGCSA | | SERLPPPFPG | | LEPESEGAAG | | GSEPEAGDSD | | TEGEDIFTGA |
AVVSKHQSPK | | ITTSLLPINN | | GSKENGIHEE | | QDQEPQDLFA | | DATVELSLDS |
TQNNQKKVLA | | KTLISLPPQE | | ATNSSKPQPT | | YEELEEEEQE | | DQFDLTVGIT |
DPEKIGDGMN | | AYVAYKVTTQ | | TSLPLFRSKQ | | FAVKRRFSDF | | LGLYEKLSEK |
HSQNGFIVPP | | PPEKSLIGMT | | KVKVGKEDSS | | SAEFLEKRRA | | ALERYLQRIV |
NHPTMLQDPD | | VREFLEKEEL | | PRAVGTQTLS | | GAGLLKMFNK | | ATDAVSKMTI |
KMNESDIWFE | | EKLQEVECEE | | QRLRKLHAVV | | ETLVNHRKEL | | ALNTAQFAKS |
LAMLGSSEDN | | TALSRALSQL | | AEVEEKIEQL | | HQEQANNDFF | | LLAELLSDYI |
RLLAIVRAAF | | DQRMKTWQRW | | QDAQATLQKK | | REAEARLLWA | | NKPDKLQQAK |
DEILEWESRV | | TQYERDFERI | | STVVRKEVIR | | FEKEKSKDFK | | NHVIKYLETL |
LYSQQQLAKY | | WEAFLPEAKA | | IS |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- Kurten R.C., Cadena D.L., Gill G.N. (1996). Enhanced degradation of EGF receptors by a sorting nexin, SNX1. Science. 272: 1008—1010. PMID 8638121 DOI:10.1126/science.272.5264.1008
- Haft C.R., de la Luz Sierra M., Barr V.A., Haft D.H., Taylor S.I. (1998). Identification of a family of sorting nexin molecules and characterization of their association with receptors. Mol. Cell. Biol. 18: 7278—7287. PMID 9819414 DOI:10.1128/MCB.18.12.7278
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Gullapalli A., Wolfe B.L., Griffin C.T., Magnuson T., Trejo J. (2006). An essential role for SNX1 in lysosomal sorting of protease-activated receptor-1: evidence for retromer-, Hrs-, and Tsg101-independent functions of sorting nexins. Mol. Biol. Cell. 17: 1228—1238. PMID 16407403 DOI:10.1091/mbc.E05-09-0899
- Bujny M.V., Popoff V., Johannes L., Cullen P.J. (2007). The retromer component sorting nexin-1 is required for efficient retrograde transport of Shiga toxin from early endosome to the trans Golgi network. J. Cell Sci. 120: 2010—2021. PMID 17550970 DOI:10.1242/jcs.003111
- Rojas R., Kametaka S., Haft C.R., Bonifacino J.S. (2007). Interchangeable but essential functions of SNX1 and SNX2 in the association of retromer with endosomes and the trafficking of mannose 6-phosphate receptors. Mol. Cell. Biol. 27: 1112—1124. PMID 17101778 DOI:10.1128/MCB.00156-06
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11172 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13596 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |