SNX13 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SNX13, RGS-PX1, sorting nexin 13 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606589 MGI: 2661416 HomoloGene: 41011 GeneCards: SNX13 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • ендосома • early endosome • early endosome membrane • мембрана |
---|
Біологічний процес | • protein transport • negative regulation of signal transduction • intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | NP_055947 NP_001337791 NP_001337792 NP_001337793 NP_001337795
| NP_001337796 NP_001337797 NP_001337799 |
| |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 12: 35.1 – 35.2 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SNX13 (англ. Sorting nexin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 968 амінокислот, а молекулярна маса — 112 189[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLTEASLSIW | | GWGSLGIVLF | | LITFGPFVIF | | YLTFYILCFV | | GGGLVVTLLF |
GKTNSEKYLE | | QCEHSFLPPT | | SPGVPKCLEE | | MKREARTIKI | | DRRLTGANII |
DEPLQQVIQF | | SLRDYVQYWY | | YTLSDDESFL | | LEIRQTLQNA | | LIQFATRSKE |
IDWQPYFTTR | | IVDDFGTHLR | | VFRKAQQKIT | | EKDDQVKGTA | | EDLVDTFFEV |
EVEMEKEVCR | | DLVCTSPKDE | | EGFLRDLCEV | | LLYLLLPPGD | | FQNKIMRYFV |
REILARGILL | | PLINQLSDPD | | YINQYVIWMI | | RDSNCNYEAF | | MNIIKLSDNI |
GELEAVRDKA | | AEELQYLRSL | | DTAGDDINTI | | KNQINSLLFV | | KKVCDSRIQR |
LQSGKEINTV | | KLAANFGKLC | | TVPLDSILVD | | NVALQFFMDY | | MQQTGGQAHL |
FFWMTVEGYR | | VTAQQQLEVL | | LSRQRDGKHQ | | TNQTKGLLRA | | AAVGIYEQYL |
SEKASPRVTV | | DDYLVAKLAD | | TLNHEDPTPE | | IFDDIQRKVY | | ELMLRDERFY |
PSFRQNALYV | | RMLAELDMLK | | DPSFRGSDDG | | DGESFNGSPT | | GSINLSLDDL |
SNVSSDDSVQ | | LHAYISDTVY | | ADYDPYAVAG | | VCNDHGKTYA | | LYAITVHRRN |
LNSEEMWKTY | | RRYSDFHDFH | | MRITEQFESL | | SSILKLPGKK | | TFNNMDRDFL |
EKRKKDLNAY | | LQLLLAPEMM | | KASPALAHYV | | YDFLENKAYS | | KGKGDFARKM |
DTFVNPLRNS | | MRNVSNAVKS | | LPDSLAEGMT | | KMSDNMGKMS | | ERLGQDIKQS |
FFKVPPLIPK | | TDSDPEHRRV | | SAQLDDNVDD | | NIPLRVMLLL | | MDEVFDLKER |
NQWLRRNIKN | | LLQQLIRATY | | GDTINRKIVD | | HVDWMTSPEQ | | VADSVKRFRD |
AFWPNGILAE | | AVPCRDKSIR | | MRTRVAGKTK | | LLAIMPDELK | | HIIGAETTRK |
GILRVFEMFQ | | HNQLNRRMVY | | VFLEGFLETL | | FPQYKFRELF | | NKLHSRSKQM |
QKYKQKLQTT | | QAPSLQKR |
Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, ендосомах.
Література
- Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21335 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y5W8 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |