SNX27

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4HAS

Ідентифікатори

Символи

SNX27, MRT1, MY014, sorting nexin family member 27, sorting nexin 27

Зовнішні ІД

OMIM: 611541 MGI: 1923992 HomoloGene: 12797 GeneCards: SNX27

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatidylinositol-3-phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • lipid binding
Клітинна компонента	• early endosome membrane • мембрана • нуклеоплазма • retromer complex • early endosome • immunological synapse • WASH complex • цитоплазма • ендосома • гіалоплазма
Біологічний процес	• establishment of natural killer cell polarity • endosome to lysosome transport • endosomal transport • protein transport • intracellular protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


81609


76742

Ensembl


ENSG00000143376


ENSMUSG00000028136

UniProt


Q96L92


Q3UHD6

RefSeq (мРНК)


NM_030918 NM_001330723


NM_001082484 NM_029721

RefSeq (білок)


NP_001317652 NP_112180


NP_001075953 NP_083997

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.61 – 151.7 Mb

Хр. 3: 94.4 – 94.49 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNX27 (англ. Sorting nexin family member 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 541 амінокислот, а молекулярна маса — 61 265^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADEDGEGIH	PSAPHRNGGG	GGGGGSGLHC	AGNGGGGGGG	PRVVRIVKSE
SGYGFNVRGQ	VSEGGQLRSI	NGELYAPLQH	VSAVLPGGAA	DRAGVRKGDR
ILEVNHVNVE	GATHKQVVDL	IRAGEKELIL	TVLSVPPHEA	DNLDPSDDSL
GQSFYDYTEK	QAVPISVPRY	KHVEQNGEKF	VVYNVYMAGR	QLCSKRYREF
AILHQNLKRE	FANFTFPRLP	GKWPFSLSEQ	QLDARRRGLE	EYLEKVCSIR
VIGESDIMQE	FLSESDENYN	GVSDVELRVA	LPDGTTVTVR	VKKNSTTDQV
YQAIAAKVGM	DSTTVNYFAL	FEVISHSFVR	KLAPNEFPHK	LYIQNYTSAV
PGTCLTIRKW	LFTTEEEILL	NDNDLAVTYF	FHQAVDDVKK	GYIKAEEKSY
QLQKLYEQRK	MVMYLNMLRT	CEGYNEIIFP	HCACDSRRKG	HVITAISITH
FKLHACTEEG	QLENQVIAFE	WDEMQRWDTD	EEGMAFCFEY	ARGEKKPRWV
KIFTPYFNYM	HECFERVFCE	LKWRKENIFQ	MARSQQRDVA	T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
MacNeil A.J., Pohajdak B. (2007). Polarization of endosomal SNX27 in migrating and tumor-engaged natural killer cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 361: 146—150. PMID 17644068 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.06.183
MacNeil A.J., Mansour M., Pohajdak B. (2007). Sorting nexin 27 interacts with the Cytohesin associated scaffolding protein (CASP) in lymphocytes. Biochem. Biophys. Res. Commun. 359: 848—853. PMID 17577583 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.05.162
Cai L., Loo L.S., Atlashkin V., Hanson B.J., Hong W. (2011). Deficiency of sorting nexin 27 (SNX27) leads to growth retardation and elevated levels of N-methyl-D-aspartate receptor 2C (NR2C). Mol. Cell. Biol. 31: 1734—1747. PMID 21300787 DOI:10.1128/MCB.01044-10

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20073 (англ.) . Архів оригіналу за 18 жовтня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96L92 (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.