SNX5

SNX5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1SYS

Ідентифікатори
Символи SNX5, sorting nexin 5
Зовнішні ІД OMIM: 605937 MGI: 1916428 HomoloGene: 40944 GeneCards: SNX5
Онтологія гена
Молекулярна функція

• dynactin binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• phosphatidylinositol binding
• protein heterodimerization activity
• lipid binding
• cadherin binding
• phosphatidylinositol-5-phosphate binding
• D1 dopamine receptor binding
• phosphatidylinositol-4-phosphate binding
• phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• ендосома
• cell projection
• early endosome membrane
• retromer, tubulation complex
• мембрана
• ruffle
• extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane
• клітинна мембрана
• extrinsic component of endosome membrane
• tubular endosome
• retromer complex
• early endosome
• phagocytic cup
• cytoplasmic vesicle membrane
• macropinocytic cup
• GO:0016023 cytoplasmic vesicle
• гіалоплазма
• brush border
• внутрішньоклітинний

Біологічний процес

• ендоцитоз
• vesicle organization
• retrograde transport, endosome to Golgi
• protein transport
• Піноцитоз
• intracellular protein transport
• regulation of macroautophagy
• epidermal growth factor catabolic process
• positive regulation of renal sodium excretion
• negative regulation of blood pressure

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
27131
69178
Ensembl
ENSG00000089006
ENSMUSG00000027423
UniProt
Q9Y5X3
Q5QPE4
Q9D8U8
RefSeq (мРНК)
NM_152227
NM_001282454
NM_014426
NM_001199188
NM_024225
RefSeq (білок)
NP_001269383
NP_055241
NP_689413
NP_001186117
NP_077187
Локус (UCSC) Хр. 20: 17.94 – 17.97 Mb Хр. 2: 144.09 – 144.11 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SNX5 (англ. Sorting nexin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 46 816[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAVPELLQQQEEDRSKLRSVSVDLNVDPSLQIDIPDALSERDKVKFTVH
TKTTLPTFQSPEFSVTRQHEDFVWLHDTLIETTDYAGLIIPPAPTKPDFD
GPREKMQKLGEGEGSMTKEEFAKMKQELEAEYLAVFKKTVSSHEVFLQRL
SSHPVLSKDRNFHVFLEYDQDLSVRRKNTKEMFGGFFKSVVKSADEVLFT
GVKEVDDFFEQEKNFLINYYNRIKDSCVKADKMTRSHKNVADDYIHTAAC
LHSLALEEPTVIKKYLLKVAELFEKLRKVEGRVSSDEDLKLTELLRYYML
NIEAAKDLLYRRTKALIDYENSNKALDKARLKSKDVKLAEAHQQECCQKF
EQLSESAKEELINFKRKRVAAFRKNLIEMSELEIKHARNNVSLLQSCIDL
FKNN

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

  • Teasdale R.D., Loci D., Houghton F., Karlsson L., Gleeson P.A. (2001). A large family of endosome-localized proteins related to sorting nexin 1. Biochem. J. 358: 7—16. PMID 11485546 DOI:10.1042/0264-6021:3580007
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lim J.P., Wang J.T., Kerr M.C., Teasdale R.D., Gleeson P.A. (2008). A role for SNX5 in the regulation of macropinocytosis. BMC Cell Biol. 9: 58—58. PMID 18854019 DOI:10.1186/1471-2121-9-58
  • Sun Y., Hedman A.C., Tan X., Schill N.J., Anderson R.A. (2013). Endosomal type Igamma PIP 5-kinase controls EGF receptor lysosomal sorting. Dev. Cell. 25: 144—155. PMID 23602387 DOI:10.1016/j.devcel.2013.03.010
  • Schill N.J., Hedman A.C., Choi S., Anderson R.A. (2014). Isoform 5 of PIPKIgamma regulates the endosomal trafficking and degradation of E-cadherin. J. Cell Sci. 127: 2189—2203. PMID 24610942 DOI:10.1242/jcs.132423

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14969 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q9Y5X3 (англ.) . Архів оригіналу за 14 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.