SOCS4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SOCS4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2IZV

Ідентифікатори

Символи

SOCS4, SOCS7, suppressor of cytokine signaling 4

Зовнішні ІД

OMIM: 616337 MGI: 1914546 HomoloGene: 15442 GeneCards: SOCS4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • regulation of growth • negative regulation of signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


122809


67296

Ensembl


ENSG00000180008


ENSMUSG00000048379

UniProt


Q8WXH5


Q91ZA6

RefSeq (мРНК)


NM_080867 NM_199421


NM_080843

RefSeq (білок)


NP_543143 NP_955453


NP_543119

Локус (UCSC)

Хр. 14: 55.03 – 55.05 Mb

Хр. 14: 47.51 – 47.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SOCS4 (англ. Suppressor of cytokine signaling 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 50 623^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAENNENISK	NVDVRPKTSR	SRSADRKDGY	VWSGKKLSWS	KKSESYSDAE
TVNGIEKTEV	SLRNQERKHS	CSSIELDLDH	SCGHRFLGRS	LKQKLQDAVG
QCFPIKNCSS	RHSSGLPSKR	KIHISELMLD	KCPFPPRSDL	AFRWHFIKRH
TAPINSKSDE	WVSTDLSQTE	LRDGQLKRRN	MEENINCFSH	TNVQPCVITT
DNALCREGPM	TGSVMNLVSN	NSIEDSDMDS	DDEILTLCTS	SRKRNKPKWD
LDDEILQLET	PPKYHTQIDY	VHCLVPDLLQ	INNNPCYWGV	MDKYAAEALL
EGKPEGTFLL	RDSAQEDYLF	SVSFRRYSRS	LHARIEQWNH	NFSFDAHDPC
VFHSPDITGL	LEHYKDPSAC	MFFEPLLSTP	LIRTFPFSLQ	HICRTVICNC
TTYDGIDALP	IPSSMKLYLK	EYHYKSKVRV	LRIDAPEQQC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до інгібіторів передачі внутрішньоклітинних сигналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, регуляція росту.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bullock A.N., Rodriguez M.C., Debreczeni J.E., Songyang Z., Knapp S. (2007). Structure of the SOCS4-ElonginB/C complex reveals a distinct SOCS box interface and the molecular basis for SOCS-dependent EGFR degradation. Structure. 15: 1493—1504. PMID 17997974 DOI:10.1016/j.str.2007.09.016

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19392 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8WXH5 (англ.) . Архів оригіналу за 13 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.