SURF6 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SURF6

Ідентифікатори

Символи

SURF6, RRP14, surfeit 6

Зовнішні ІД

OMIM: 185642 MGI: 98447 HomoloGene: 133981 GeneCards: SURF6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • granular component • cytosolic large ribosomal subunit
Біологічний процес	• ribosome biogenesis • ribosomal large subunit biogenesis • ribosomal small subunit biogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6838


20935

Ensembl


ENSG00000148296 ENSG00000281309


ENSMUSG00000036160

UniProt


O75683


P70279

RefSeq (мРНК)


NM_001278942 NM_006753


NM_009298

RefSeq (білок)


NP_001265871 NP_006744


NP_033324

Локус (UCSC)

Хр. 9: 133.33 – 133.34 Mb

Хр. 2: 26.78 – 26.79 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SURF6 (англ. Surfeit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 41 450^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASLLAKDAY	LQSLAKKICS	HSAPEQQART	RAGKTQGSET	AGPPKKKRKK
TQKKFRKREE	KAAEHKAKSL	GEKSPAASGA	RRPEAAKEEA	AWASSSAGNP
ADGLATEPES	VFALDVLRQR	LHEKIQEARG	QGSAKELSPA	ALEKRRRRKQ
ERDRKKRKRK	ELRAKEKARK	AEEATEAQEV	VEATPEGACT	EPREPPGLIF
NKVEVSEDEP	ASKAQRRKEK	RQRVKGNLTP	LTGRNYRQLL	ERLQARQSRL
DELRGQDEGK	AQELEAKMKW	TNLLYKAEGV	KIRDDERLLQ	EALKRKEKRR
AQRQRRWEKR	TAGVVEKMQQ	RQDRRRQNLR	RKKAARAERR	LLRARKKGRI
LPQDLERAGL	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Magoulas C., Fried M. (2000). Isolation and genomic analysis of the human surf-6 gene: a member of the Surfeit locus. Gene. 243: 115—123. PMID 10675619 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00551-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11478 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75683 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.