SYCP1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SYCP1, CT8, HOM-TES-14, SCP-1, SCP1, synaptonemal complex protein 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 602162 MGI: 105931 HomoloGene: 2389 GeneCards: SYCP1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • double-stranded DNA binding |
---|
Клітинна компонента | • condensed nuclear chromosome • central element • male germ cell nucleus • хромосома • transverse filament • клітинне ядро • synaptonemal complex • центромера |
---|
Біологічний процес | • lateral element assembly • Сперматогенез • GO:0007126 мейоз • GO:0035093 sperm DNA condensation • regulation of protein localization • meiotic DNA repair synthesis • chiasma assembly • поділ клітини • клітинний цикл • synaptonemal complex assembly • homologous chromosome pairing at meiosis • reciprocal meiotic recombination • protein homotetramerization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/PBB_GE_SYCP1_206740_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_SYCP1_206740_x_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bf/PBB_GE_SYCP1_216917_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_SYCP1_216917_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001282541 NM_001282542 NM_003176 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001269470 NP_001269471 NP_003167 NP_001269470.1 NP_003167.2 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 114.85 – 115 Mb | Хр. 3: 102.73 – 102.84 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SYCP1 (англ. Synaptonemal complex protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 976 амінокислот, а молекулярна маса — 114 192[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEKQKPFALF | | VPPRSSSSQV | | SAVKPQTLGG | | DSTFFKSFNK | | CTEDDFEFPF |
AKTNLSKNGE | | NIDSDPALQK | | VNFLPVLEQV | | GNSDCHYQEG | | LKDSDLENSE |
GLSRVYSKLY | | KEAEKIKKWK | | VSTEAELRQK | | ESKLQENRKI | | IEAQRKAIQE |
LQFGNEKVSL | | KLEEGIQENK | | DLIKENNATR | | HLCNLLKETC | | ARSAEKTKKY |
EYEREETRQV | | YMDLNNNIEK | | MITAFEELRV | | QAENSRLEMH | | FKLKEDYEKI |
QHLEQEYKKE | | INDKEKQVSL | | LLIQITEKEN | | KMKDLTFLLE | | ESRDKVNQLE |
EKTKLQSENL | | KQSIEKQHHL | | TKELEDIKVS | | LQRSVSTQKA | | LEEDLQIATK |
TICQLTEEKE | | TQMEESNKAR | | AAHSFVVTEF | | ETTVCSLEEL | | LRTEQQRLEK |
NEDQLKILTM | | ELQKKSSELE | | EMTKLTNNKE | | VELEELKKVL | | GEKETLLYEN |
KQFEKIAEEL | | KGTEQELIGL | | LQAREKEVHD | | LEIQLTAITT | | SEQYYSKEVK |
DLKTELENEK | | LKNTELTSHC | | NKLSLENKEL | | TQETSDMTLE | | LKNQQEDINN |
NKKQEERMLK | | QIENLQETET | | QLRNELEYVR | | EELKQKRDEV | | KCKLDKSEEN |
CNNLRKQVEN | | KNKYIEELQQ | | ENKALKKKGT | | AESKQLNVYE | | IKVNKLELEL |
ESAKQKFGEI | | TDTYQKEIED | | KKISEENLLE | | EVEKAKVIAD | | EAVKLQKEID |
KRCQHKIAEM | | VALMEKHKHQ | | YDKIIEERDS | | ELGLYKSKEQ | | EQSSLRASLE |
IELSNLKAEL | | LSVKKQLEIE | | REEKEKLKRE | | AKENTATLKE | | KKDKKTQTFL |
LETPEIYWKL | | DSKAVPSQTV | | SRNFTSVDHG | | ISKDKRDYLW | | TSAKNTLSTP |
LPKAYTVKTP | | TKPKLQQREN | | LNIPIEESKK | | KRKMAFEFDI | | NSDSSETTDL |
LSMVSEEETL | | KTLYRNNNPP | | ASHLCVKTPK | | KAPSSLTTPG | | STLKFGAIRK |
MREDRWAVIA | | KMDRKKKLKE | | AEKLFV |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мейоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.
Література
- Meuwissen R.L.J., Meerts I., Hoovers J.M.N., Leschot N.J., Heyting C. (1997). Human synaptonemal complex protein 1 (SCP1): isolation and characterization of the cDNA and chromosomal localization of the gene. Genomics. 39: 377—384. PMID 9119375 DOI:10.1006/geno.1996.4373
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Park H.H. (2015). X-ray crystallographic studies of the middle part of the human synaptonemal complex protein 1 coiled-coil domain. Acta Crystallogr. F. 71: 1131—1134. PMID 26323297 DOI:10.1107/S2053230X15012728
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11487 (англ.) . Архів оригіналу за 12 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q15431 (англ.) . Архів оригіналу за 20 лютого 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |