SYN2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SYN2

Ідентифікатори

Символи

SYN2, SYNII, Synapsin 2, synapsin II

Зовнішні ІД

OMIM: 600755 MGI: 103020 HomoloGene: 49348 GeneCards: SYN2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ATP binding
Клітинна компонента	• міжклітинні контакти • синапс • synaptic vesicle membrane • Синаптичні бульбашки • клітинна мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • SNARE complex • myelin sheath • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• GO:0010554 neurotransmitter secretion • chemical synaptic transmission • synaptic vesicle clustering • synaptic vesicle cycle • calcium-ion regulated exocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6854


20965

Ensembl


ENSG00000157152


ENSMUSG00000009394

UniProt


Q92777


Q64332

RefSeq (мРНК)


NM_003178 NM_133625


NM_001111015 NM_013681 NM_001326560

RefSeq (білок)


NP_003169 NP_598328


NP_001104485 NP_001313489 NP_038709

Локус (UCSC)

Хр. 3: 12 – 12.19 Mb

Хр. 6: 115.11 – 115.26 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SYN2 (англ. Synapsin II) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 62 847^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMNFLRRRLS	DSSFIANLPN	GYMTDLQRPE	PQQAPTPPPP	GPGAASASAA
PPTASPGPER	TPPAASAPAP	PPARTPSVGS	SLFSSLSQAV	KQTAASAGLV
DAPGAAPAAA	RKAKVLLVVD	EPHADWAKCF	RGKKVLGDYD	IKVEQAEFSE
LNLVAHADGT	YAVDMQVLRN	GTKVVRSFRP	DFVLIRQHAF	GMAENEDFRH
LIIGMQYAGL	PSINSLESIY	NFCDKPWVFA	QLVAIYKTLG	GEKFPLIEQT
YYPNHKEMLT	LPTFPVVVKI	GHAHSGMGKV	KVENHYDFQD	IASVVALTQT
YATAEPFIDS	KYDIRVQKIG	NNYKAYMRTS	ISGNWKTNTG	SAMLEQIAMS
DRYKLWVDTC	SEMFGGLDIC	AVKAVHGKDG	KDYIFEVMDC	SMPLIGEHQV
EDRQLITELV	ISKMNQLLSR	TPALSPQRPL	TTQQPQSGTL	KDPDSSKTPP
QRPPPQGGPG	QPQGMQPPGK	VLPPRRLPPG	PSLPPSSSSS	SSSSSSAPQR
PGGPTTHGDA	PSSSSSLAEA	QPPLAAPPQK	PQPHPQLNKS	QSLTNAFSFS
ESSFFRSSAN	EDEAKAETIR	SLRKSFASLF	SD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних контактах, синапсах.

Література

Xie Y. (1996). Cloning and sequencing analysis of a human synapsin IIb-encoding brain cDNA. Gene. 173: 289—290. PMID 8964517 DOI:10.1016/0378-1119(96)00234-X
Porton B., Kao H.-T., Greengard P. (1999). Cloning of cDNAs encoding human synapsins IIa and IIb. DNA Seq. 10: 49—54. PMID 10565545 DOI:10.3109/10425179909033936

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11495 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q92777 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.