SZT2

Ідентифікатори

Символи

SZT2, C1orf84, EIEE18, KIAA0467, SZT2A, SZT2B, seizure threshold 2 homolog (mouse), KICSTOR complex subunit, SZT2 subunit KICSTOR complex, SZT2 subunit of KICSTOR complex, DEE18, KICS1

Зовнішні ІД

OMIM: 615463 MGI: 3033336 HomoloGene: 49413 GeneCards: SZT2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція
Клітинна компонента	• GATOR2 complex • KICSTOR complex • GATOR1 complex • пероксисома • лізосома • lysosomal membrane • мембрана
Біологічний процес	• pigmentation • corpus callosum morphogenesis • central nervous system development • regulation of superoxide dismutase activity • post-embryonic development • cellular response to glucose starvation • protein localization to lysosome • negative regulation of TORC1 signaling • response to nutrient levels • cellular response to amino acid starvation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23334


230676

Ensembl


ENSG00000198198


ENSMUSG00000033253

UniProt


Q5T011


A2A9C3

RefSeq (мРНК)


NM_001012960 NM_001012961 NM_015284 NM_182518 NM_001365999


NM_198170

RefSeq (білок)


NP_056099 NP_001352928


NP_937813

Локус (UCSC)

Хр. 1: 43.39 – 43.45 Mb

Хр. 4: 118.22 – 118.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SZT2 (англ. SZT2, KICSTOR complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 432 амінокислот, а молекулярна маса — 378 029^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASERPEPEV	EEAGQVFLLM	KKDYRISRNV	RLAWFLSHLH	QTVQATPQEM
LLQSEQELEV	LSVLPPGWQP	DEPVVPRPFL	LVPSTRVTFL	AWQYRFVIEL
DLSPSTGIVD	DSTGEILFDE	VFHALSRCLG	GLLRPFRVPG	SCIDFQPEIY
VTIQAYSSII	GLQSHQVLVQ	GCLLDPSQRE	VFLQQIYEQL	CLFEDKVATM
LQQQYDPQSQ	AEDQSPDSGD	LLGRKVGVSM	VTADLGLVSM	IRQGILALQL
LPSNSSAGII	VITDGVTSVP	DVAVCETLLN	QLRSGTVACS	FVQVGGVYSY
DCSFGHVPNV	ELMKFIAMAT	FGSYLSTCPE	PEPGNLGLTV	YHRAFLLYSF
LRSGEALNPE	YYCGSQHRLF	NEHLVSASSN	PALALRRKKH	TEKEVPADLV
STVSVRLREG	YSVREVTLAK	GGSQLEVKLV	LLWKHNMRIE	YVAMAPWPLE
PEGPRVTRVE	VTMEGGYDIL	HDVSCALRQP	IRSLYRTHVI	RRFWNTLQSI
NQTDQMLAHL	QSFSSVPEHF	TLPDSTKSGV	PLFYIPPGST	TPVLSLQPSG
SDSSHAQFAA	YWKPVLSMDA	NSWQRWLHMH	RLVLILEHDT	PIPKHLHTPG
SNGRYSTIQC	RISHSSLTSL	LRDWSSFVLV	EGYSYVKLLS	SAPDQPPNSF
YMVRIISKAP	CMVLRLGFPI	GTPAPARHKI	VSGLREEILR	LRFPHRVQSK
EPTPKVKRKG	LGGAGGGSSP	SKSPPVLGPQ	QALSDRPCLV	VLHKPLDKLL
IRYEKLPLDY	RAPFLLTLEP	PGPLPLVSGR	SASSSLASLS	RYLYHQRWLW
SVPSGLAPAL	PLSAIAQLLS	ILTEVRLSEG	FHFACSGEGI	INMVLELPIQ
NEPPGQAAAE	EKHTCVVQYI	LFPPHSTSTK	DSFSTDDDND	VEVEALEGDS
ELNLVTEVWV	EPQYGRVGPG	PGIWKHLQDL	TYSEIPQALH	PRDAACIGSM
LSFEYLIQLC	QSKEWGPLPP	EPRVSDGLDQ	GGDTCVHEIP	FHFDLMGLLP
QCQQLQMFFL	LLAREPEGVP	FAEGSCPAND	MVLCLLHSCL	GQELSDREIP
LTPVDQAAFL	SEVLRRTCHV	PGAEGPLLGV	HGIPKEQAVG	STQATGDSAF
TSLSVGLPET	LKPLISAQPP	QWRCYARLVN	PQHVFLTFLP	ATFSDVQRLA
ACGLEGPPQE	ETKPKFGDWS	GAPSLKDLGG	TGIKATKSHV	PVLSVTLASD
NAQNQGELSP	PFRRDLQAYA	GRQASQTESA	DGPRTRCPVY	IYSCSLEALR
EQMVGMQPPQ	APRDLIFRTQ	FLDHPSPSSA	WMEPRYKEAA	NHCALLQEHA
QRCYVRGLFR	SLQQAQSVTS	QDLLTAVDAC	EELLQEIDIT	PFLLALCGHT
WGLPHAPPSP	GPLSPGPFSS	SMEEGAEPRE	RAILASESSI	ETEDLSEPEF
QSTRVPGIPD	PGPEISLTDV	CQLRGEAHGA	LHSVIQEKFL	EISRLHFRTV
PSNPHYFFYC	PPSSRREDEG	PRDTVDRKIS	DLEFSEAELM	GEEGDTSACC
VVTESDPELE	VEYRESRESD	LGPAGLDSAS	LSDVDTVNPD	EDSFSILGGD
SPTGPESFLH	DLPPLFLHLT	CSVRLRGQHS	SVPVCSLPTC	LGQVLSSLEG
PPVGGRVPLR	DLSVTLDVFM	LTLPLEVELP	TASDPQHHRS	TSESSASFPR
SPGQPSSLRS	DDGLGPPLPP	PEEERHPGLS	NLATPHRLAI	ETTMNEIRWL
LEDEMVGALR	RGGIPQSPAL	HRAAAHIHSS	PGRSTCLRQT	LPLSFVFGPE
RSLTQFKEEF	RRLHLPGHVL	LEDPDSGFFF	VAAGQQPGGS	HGEPSSAAWA
WHSHEDRAEG	IEGETLTASP	QAPGSPEDSE	GVPLISLPRV	PQGGSQPGPS
RGLSLMSSQG	SVDSDHLGYD	GGSSGSDSEG	PNDTLGEKAP	FTLRTPPGPA
PPQPSLSGLP	GPCLPDFWLI	VRVLQDRVEV	YAHARSLIRE	DGGPGTECRH
LQQLLVRRVG	EICREVNQRL	LLQDLHDSHV	CNSLLVAESE	EDLWRSETPF
HSRQRAPLPS	DDYAADESCA	PRGYLAATMQ	FVPGHFSCDV	VWGTVIRVHS
RLKMGPSMGV	SRAIQALRSV	LNAFSVVNRK	NMFVYQERAT	KAVYYLRLLE
TSCSDRPWKG	DALPPSLALS	RSQEPIYSEE	ASGPRSPLDM	VSSRSSDAAR
PVGQVDRHIQ	LLVHGVGQAG	PEITDELVRV	LCRRLDEATL	DVITVMLVRN
CKLTPADVEF	IQPPGSLPSE	VLHLALPTSC	RPWLPALAWY	LRQNLLIFLH
SPKYTDSNSR	NHFQHPLPPQ	GGLPDLDIYL	YNKPGGQGTG	GKGVACITLA
FVDEGGAPLS	LALWPPSSPG	PPDPLREEEF	EQLTQVIRCP	VVVDSSSAQN
GAPRLRLDVW	EKGNISIVQL	EEKLRGAARQ	ALADAIIELQ	LLPASLCTED
TPTGSLRNGS	LETKSSAGRA	STFPPAPVPG	EPVTPPSKAG	RRSFWDMLSK
TECGDLGSPK	TTDDIVLDRP	EDTRGRRRHK	TESVRTPGGA	ERAPGSDSGA
QRQKRRTTQL	EEGEVGTLHP	VFARVAQRWM	EFMVQIGCAS	VSRSSAHMVS
RFLLPSILSE	FTALVTSMAG	DTSVRIFEQH	LGSEPEIFGP	CSPGQLGPSP
RPAAERHLLL	LGRNFLQWRR	PTQQAAKAMQ	RFEPGGDGSS	GRNAPRQRLL
LLEVVDKKLQ	LLTYNWAPDL	GAALGRALVR	LVQWQNARAH	LIFCLLSQKL
GLFHHYGQLD	FPVRDEKEPN	PFLLPTMEVE	TLIRSASPPL	SREQGRLSGS
SRGGGPLPLD	TFPFDEALRD	ITAARPSSVL	GPVPRPPDPV	TYHGQQFLEI
KMAERRELER	QMKMENLFVT	WQQRSTPATM	PISAGELETL	KQSSRLVHYC
ATAMLFDPAA	WLHGPPETSG	PPDGQRRHRP	ESGSGSREAP	TSCESLDVSP
PGAREEPWLK	ELSLAFLQQY	VQYLQSIGFV	LVPLRPPSPA	RSTSRPRAMA
ILGTEGRGSF	SCPKTKTDGS	PKSTSSPVTT	YHLQRALPGG	IILMELAFQG
CYFCVKQFAL	ECSRIPMGQA	VNSQLSMLFT	EECDKVRDLM	HVHSFSYDFH
LRLVHQHVLG	AHLVLRHGYH	LTTFLRHFLA	HHPDGPHFGR	NHIYQGTLEL
PTPLIAAHQL	YNYVADHASS	YHMKPLRMAR	PGGPEHNEYA	LVSAWHSSGS
YLDSEGLRHQ	DDFDVSLLVC	HCAAPFEEQG	EAERHVLRLQ	FFVVLTSQRE
LFPRLTADMR	RFRKPPRLPP	EPEAPGSSAG	SPGEASGLIL	APGPAPLFPP
LAAEVGMARA	RLAQLVRLAG	GHCRRDTLWK	RLFLLEPPGP	DRLRLGGRLA
LAELEELLEA	VHAKSIGDID	PQLDCFLSMT	VSWYQSLIKV	LLSRFPQSCR
HFQSPDLGTQ	YLVVLNQKFT	DCFVLVFLDS	HLGKTSLTVV	FREPFPVQPQ
DSESPPAQLV	STYHHLESVI	NTACFTLWTR	LL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі, пероксисомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Peng M., Yin N., Li M.O. (2017). SZT2 dictates GATOR control of mTORC1 signalling. Nature. 543: 433—437. PMID 28199315 DOI:10.1038/nature21378

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29040 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5T011 (англ.) . Архів оригіналу за 8 березня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.