SMURF1 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2LAZ, 2LB0, 2LB1, 2LTX, 3PYC | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | SMURF1, SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605568 MGI: 1923038 HomoloGene: 10712 GeneCards: SMURF1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • R-SMAD binding • I-SMAD binding • activin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phospholipid binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • аксон • neuronal cell body • мітохондрія • екзосома |
---|
Біологічний процес | • диференціація клітин • engulfment of target by autophagosome • ectoderm development • protein polyubiquitination • BMP signaling pathway • receptor catabolic process • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • negative regulation of ossification • protein localization to cell surface • protein targeting to vacuole involved in autophagy • positive regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • protein export from nucleus • positive regulation of dendrite extension • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • parkin-mediated stimulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization • substrate localization to autophagosome • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of BMP signaling pathway • protein localization to plasma membrane • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000284126 ENSG00000198742 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001199847 NM_020429 NM_181349 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186776 NP_065162 NP_851994 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 99.03 – 99.14 Mb | Хр. 5: 144.81 – 144.9 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SMURF1 (англ. SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 86 114[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSNPGTRRNG | | SSIKIRLTVL | | CAKNLAKKDF | | FRLPDPFAKI | | VVDGSGQCHS |
TDTVKNTLDP | | KWNQHYDLYV | | GKTDSITISV | | WNHKKIHKKQ | | GAGFLGCVRL |
LSNAISRLKD | | TGYQRLDLCK | | LNPSDTDAVR | | GQIVVSLQTR | | DRIGTGGSVV |
DCRGLLENEG | | TVYEDSGPGR | | PLSCFMEEPA | | PYTDSTGAAA | | GGGNCRFVES |
PSQDQRLQAQ | | RLRNPDVRGS | | LQTPQNRPHG | | HQSPELPEGY | | EQRTTVQGQV |
YFLHTQTGVS | | TWHDPRIPSP | | SGTIPGGDAA | | FLYEFLLQGH | | TSEPRDLNSV |
NCDELGPLPP | | GWEVRSTVSG | | RIYFVDHNNR | | TTQFTDPRLH | | HIMNHQCQLK |
EPSQPLPLPS | | EGSLEDEELP | | AQRYERDLVQ | | KLKVLRHELS | | LQQPQAGHCR |
IEVSREEIFE | | ESYRQIMKMR | | PKDLKKRLMV | | KFRGEEGLDY | | GGVAREWLYL |
LCHEMLNPYY | | GLFQYSTDNI | | YMLQINPDSS | | INPDHLSYFH | | FVGRIMGLAV |
FHGHYINGGF | | TVPFYKQLLG | | KPIQLSDLES | | VDPELHKSLV | | WILENDITPV |
LDHTFCVEHN | | AFGRILQHEL | | KPNGRNVPVT | | EENKKEYVRL | | YVNWRFMRGI |
EAQFLALQKG | | FNELIPQHLL | | KPFDQKELEL | | IIGGLDKIDL | | NDWKSNTRLK |
HCVADSNIVR | | WFWQAVETFD | | EERRARLLQF | | VTGSTRVPLQ | | GFKALQGSTG |
AAGPRLFTIH | | LIDANTDNLP | | KAHTCFNRID | | IPPYESYEKL | | YEKLLTAVEE |
TCGFAVE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhu H., Kavsak P., Abdollah S., Wrana J.L., Thomsen G.H. (1999). A SMAD ubiquitin ligase targets the BMP pathway and affects embryonic pattern formation. Nature. 400: 687—693. PMID 10458166 DOI:10.1038/23293
- Wang Y., Tong X., Ye X. (2012). Ndfip1 negatively regulates RIG-I-dependent immune signaling by enhancing E3 ligase Smurf1-mediated MAVS degradation. J. Immunol. 189: 5304—5313. PMID 23087404 DOI:10.4049/jimmunol.1201445
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16807 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9HCE7 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |