TAF12 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF12, TAF2J, TAFII20, TATA-box binding protein associated factor 12 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 600773 MGI: 1913714 HomoloGene: 68477 GeneCards: TAF12 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • TBP-class protein binding • histone acetyltransferase activity |
---|
Клітинна компонента | • transcription factor TFTC complex • transcription factor TFIID complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • SAGA complex • SLIK (SAGA-like) complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • DNA-templated transcription, initiation • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator • RNA polymerase II preinitiation complex assembly • histone H3 acetylation • positive regulation of nucleic acid-templated transcription |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 28.59 – 28.65 Mb | Хр. 4: 132 – 132.02 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF12 (англ. TATA-box binding protein associated factor 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 17 924[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNQFGPSALI | | NLSNFSSIKP | | EPASTPPQGS | | MANSTAVVKI | | PGTPGAGGRL |
SPENNQVLTK | | KKLQDLVREV | | DPNEQLDEDV | | EEMLLQIADD | | FIESVVTAAC |
QLARHRKSST | | LEVKDVQLHL | | ERQWNMWIPG | | FGSEEIRPYK | | KACTTEAHKQ |
RMALIRKTTK | | K |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.
Література
- Hoffmann A., Roeder R.G. (1996). Cloning and characterization of human TAF20/15. Multiple interactions suggest a central role in TFIID complex formation. J. Biol. Chem. 271: 18194—18202. PMID 8663456 DOI:10.1074/jbc.271.30.18194
- Choi B., Bando M., Hasegawa S., Horikoshi M. (1996). Isolation and characterization of a cDNA encoding a novel human transcription factor TFIID subunit containing similarities with histones H2B and H3. Gene. 169: 263—267. PMID 8647459 DOI:10.1016/0378-1119(95)00838-1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11545 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q16514 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|