TCF15

Ідентифікатори

Символи

TCF15, EC2, PARAXIS, bHLHa40, transcription factor 15 (basic helix-loop-helix), transcription factor 15

Зовнішні ІД

OMIM: 601010 MGI: 104664 HomoloGene: 37943 GeneCards: TCF15

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• somitogenesis • respiratory system process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • muscle organ morphogenesis • харчова поведінка • neuromuscular process controlling posture • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • skeletal system morphogenesis • muscle organ development • ear development • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • establishment of epithelial cell apical/basal polarity • regulation of extracellular matrix organization • post-anal tail morphogenesis • регуляція експресії генів • mesoderm development • anterior/posterior pattern specification • skin development • paraxial mesoderm development • mesenchymal to epithelial transition • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6939


21407

Ensembl


ENSG00000125878


ENSMUSG00000068079

UniProt


Q12870


Q60756

RefSeq (мРНК)


NM_004609


NM_009328

RefSeq (білок)


NP_004600


NP_033354

Локус (UCSC)

Хр. 20: 0.6 – 0.61 Mb

Хр. 2: 151.99 – 151.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TCF15 (англ. Transcription factor 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 199 амінокислот, а молекулярна маса — 20 816^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFALLRPVG	AHVLYPDVRL	LSEDEENRSE	SDASDQSFGC	CEGPEAARRG
PGPGGGRRAG	GGGGAGPVVV	VRQRQAANAR	ERDRTQSVNT	AFTALRTLIP
TEPVDRKLSK	IETVRLASSY	IAHLANVLLL	GDSADDGQPC	FRAAGSAKGA
VPAAADGGRQ	PRSICTFCLS	NQRKGGGRRD	LGGSCLKVRG	VAPLRGPRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Quertermous E.E., Hidai H., Blanar M.A., Quertermous T. (1994). Cloning and characterization of a basic helix-loop-helix protein expressed in early mesoderm and the developing somites. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 7066—7070. PMID 8041747 DOI:10.1073/pnas.91.15.7066

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11627 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q12870 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.