TDRKH : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TDRKH

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DIQ, 3FDR, 5J39

Ідентифікатори

Символи

TDRKH, TDRD2, tudor and KH domain containing

Зовнішні ІД

OMIM: 609501 MGI: 1919884 HomoloGene: 4999 GeneCards: TDRKH

Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • pi-body • мітохондрія • piP-body
Біологічний процес	• male meiotic nuclear division • запліднення • диференціація клітин • DNA methylation involved in gamete generation • Сперматогенез • Сайленсинг генів • piRNA metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11022


72634

Ensembl


ENSG00000182134


ENSMUSG00000041912

UniProt


Q9Y2W6


Q80VL1

RefSeq (мРНК)


NM_001083963 NM_001083964 NM_001083965 NM_006862


NM_028307 NM_001357711 NM_001357712 NM_001357713 NM_001357714

RefSeq (білок)


NP_001077432 NP_001077433 NP_001077434 NP_006853


NP_082583 NP_001344640 NP_001344641 NP_001344642 NP_001344643

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.77 – 151.79 Mb

Хр. 3: 94.32 – 94.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TDRKH (англ. Tudor and KH domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 561 амінокислот, а молекулярна маса — 62 046^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTERTSWTS	LSTIQKIALG	LGIPASATVA	YILYRRYRES	REERLTFVGE
DDIEIEMRVP	QEAVKLIIGR	QGANIKQLRK	QTGARIDVDT	EDVGDERVLL
ISGFPVQVCK	AKAAIHQILT	ENTPVSEQLS	VPQRSVGRII	GRGGETIRSI
CKASGAKITC	DKESEGTLLL	SRLIKISGTQ	KEVAAAKHLI	LEKVSEDEEL
RKRIAHSAET	RVPRKQPISV	RREDMTEPGG	AGEPALWKNT	SSSMEPTAPL
VTPPPKGGGD	MAVVVSKEGS	WEKPSDDSFQ	KSEAQAIPEM	PMFEIPSPDF
SFHADEYLEV	YVSASEHPNH	FWIQIVGSRS	LQLDKLVNEM	TQHYENSVPE
DLTVHVGDIV	AAPLPTNGSW	YRARVLGTLE	NGNLDLYFVD	FGDNGDCPLK
DLRALRSDFL	SLPFQAIECS	LARIAPSGDQ	WEEEALDEFD	RLTHCADWKP
LVAKISSYVQ	TGISTWPKIY	LYDTSNGKKL	DIGLELVHKG	YAIELPEDIE
ENRAVPDMLK	DMATETDASL	STLLTETKKS	SGEITHTLSC	LSLSEAASMS
GDDNLEDDYL	L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11713 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2W6 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.