TINAGL1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TINAGL1

Ідентифікатори

Символи

TINAGL1, ARG1, LCN7, LIECG3, TINAGRP, tubulointerstitial nephritis antigen like 1

Зовнішні ІД

OMIM: 616064 MGI: 2137617 HomoloGene: 41472 GeneCards: TINAGL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• scavenger receptor activity • polysaccharide binding • cysteine-type endopeptidase activity • laminin binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type peptidase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • лізосома • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix
Біологічний процес	• endosomal transport • адгезія клітин • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • протеоліз • ендоцитоз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64129


94242

Ensembl


ENSG00000142910


ENSMUSG00000028776

UniProt


Q9GZM7


Q99JR5

RefSeq (мРНК)


NM_001204414 NM_001204415 NM_022164


NM_001168333 NM_023476

RefSeq (білок)


NP_001191343 NP_001191344 NP_071447


NP_001161805 NP_075965

Локус (UCSC)

Хр. 1: 31.58 – 31.59 Mb

Хр. 4: 130.06 – 130.07 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TINAGL1 (англ. Tubulointerstitial nephritis antigen like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 387^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWRCPLGLLL	LLPLAGHLAL	GAQQGRGRRE	LAPGLHLRGI	RDAGGRYCQE
QDLCCRGRAD	DCALPYLGAI	CYCDLFCNRT	VSDCCPDFWD	FCLGVPPPFP
PIQGCMHGGR	IYPVLGTYWD	NCNRCTCQEN	RQWQCDQEPC	LVDPDMIKAI
NQGNYGWQAG	NHSAFWGMTL	DEGIRYRLGT	IRPSSSVMNM	HEIYTVLNPG
EVLPTAFEAS	EKWPNLIHEP	LDQGNCAGSW	AFSTAAVASD	RVSIHSLGHM
TPVLSPQNLL	SCDTHQQQGC	RGGRLDGAWW	FLRRRGVVSD	HCYPFSGRER
DEAGPAPPCM	MHSRAMGRGK	RQATAHCPNS	YVNNNDIYQV	TPVYRLGSND
KEIMKELMEN	GPVQALMEVH	EDFFLYKGGI	YSHTPVSLGR	PERYRRHGTH
SVKITGWGEE	TLPDGRTLKY	WTAANSWGPA	WGERGHFRIV	RGVNECDIES
FVLGVWGRVG	MEDMGHH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19168 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9GZM7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.