TMTC4 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

TMTC4

Ідентифікатори

Символи

TMTC4, transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, transmembrane O-mannosyltransferase targeting cadherins 4

Зовнішні ІД

OMIM: 618203 MGI: 1921050 HomoloGene: 32796 GeneCards: TMTC4

Онтологія гена
Молекулярна функція	• mannosyltransferase activity • dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• мембрана • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум
Біологічний процес	• protein O-linked mannosylation • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84899


70551

Ensembl


ENSG00000125247


ENSMUSG00000041594

UniProt


Q5T4D3


Q8BG19

RefSeq (мРНК)

NM_001079669 NM_001286453 NM_032813 NM_001350571 NM_001350572
NM_001350574 NM_001350576 NM_001350577


NM_028651 NM_001360598 NM_001360599

RefSeq (білок)

NP_001073137 NP_001273382 NP_116202 NP_001337500 NP_001337501
NP_001337503 NP_001337505 NP_001337506


NP_082927 NP_001347527 NP_001347528

Локус (UCSC)

Хр. 13: 100.6 – 100.68 Mb

Хр. 14: 122.92 – 122.98 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TMTC4 (англ. Transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 741 амінокислот, а молекулярна маса — 82 991^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVLDTDLDH	ILPSSVLPPF	WAKLVVGSVA	IVCFARSYDG	DFVFDDSEAI
VNNKDLQAET	PLGDLWHHDF	WGSRLSSNTS	HKSYRPLTVL	TFRINYYLSG
GFHPVGFHVV	NILLHSGISV	LMVDVFSVLF	GGLQYTSKGR	RLHLAPRASL
LAALLFAVHP	VHTECVAGVV	GRADLLCALF	FLLSFLGYCK	AFRESNKEGA
HSSTFWVLLS	IFLGAVAMLC	KEQGITVLGL	NAVFDILVIG	KFNVLEIVQK
VLHKDKSLEN	LGMLRNGGLL	FRMTLLTSGG	AGMLYVRWRI	MGTGPPAFTE
VDNPASFADS	MLVRAVNYNY	YYSLNAWLLL	CPWWLCFDWS	MGCIPLIKSI
SDWRVIALAA	LWFCLIGLIC	QALCSEDGHK	RRILTLGLGF	LVIPFLPASN
LFFRVGFVVA	ERVLYLPSVG	YCVLLTFGFG	ALSKHTKKKK	LIAAVVLGIL
FINTLRCVLR	SGEWRSEEQL	FRSALSVCPL	NAKVHYNIGK	NLADKGNQTA
AIRYYREAVR	LNPKYVHAMN	NLGNILKERN	ELQEAEELLS	LAVQIQPDFA
AAWMNLGIVQ	NSLKRFEAAE	QSYRTAIKHR	RKYPDCYYNL	GRLYADLNRH
VDALNAWRNA	TVLKPEHSLA	WNNMIILLDN	TGNLAQAEAV	GREALELIPN
DHSLMFSLAN	VLGKSQKYKE	SEALFLKAIK	ANPNAASYHG	NLAVLYHRWG
HLDLAKKHYE	ISLQLDPTAS	GTKENYGLLR	RKLELMQKKA	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25904 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5T4D3 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.