TNFRSF11B

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3URF

Ідентифікатори

Символи

TNFRSF11B, OCIF, OPG, PDB5, TR1, tumor necrosis factor receptor superfamily member 11b, TNF receptor superfamily member 11b

Зовнішні ІД

OMIM: 602643 MGI: 109587 HomoloGene: 1912 GeneCards: TNFRSF11B

Пов'язані генетичні захворювання

juvenile Paget disease^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • tumor necrosis factor-activated receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • skeletal system development • negative regulation of odontogenesis of dentin-containing tooth • response to nutrient • extracellular matrix organization • response to magnesium ion • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • response to arsenic-containing substance • response to estrogen • response to lipopolysaccharide • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • response to inorganic substance • apoptotic signaling pathway • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of bone resorption • GO:0097285 апоптоз • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4982


18383

Ensembl


ENSG00000164761


ENSMUSG00000063727

UniProt


O00300


O08712

RefSeq (мРНК)


NM_002546


NM_008764

RefSeq (білок)


NP_002537


NP_032790

Локус (UCSC)

Хр. 8: 118.92 – 118.95 Mb

Хр. 15: 54.11 – 54.14 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TNFRSF11B (англ. TNF receptor superfamily member 11b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот, а молекулярна маса — 46 026^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNNLLCCALV	FLDISIKWTT	QETFPPKYLH	YDEETSHQLL	CDKCPPGTYL
KQHCTAKWKT	VCAPCPDHYY	TDSWHTSDEC	LYCSPVCKEL	QYVKQECNRT
HNRVCECKEG	RYLEIEFCLK	HRSCPPGFGV	VQAGTPERNT	VCKRCPDGFF
SNETSSKAPC	RKHTNCSVFG	LLLTQKGNAT	HDNICSGNSE	STQKCGIDVT
LCEEAFFRFA	VPTKFTPNWL	SVLVDNLPGT	KVNAESVERI	KRQHSSQEQT
FQLLKLWKHQ	NKDQDIVKKI	IQDIDLCENS	VQRHIGHANL	TFEQLRSLME
SLPGKKVGAE	DIEKTIKACK	PSDQILKLLS	LWRIKNGDQD	TLKGLMHALK
HSKTYHFPKT	VTQSLKKTIR	FLHSFTMYKL	YQKLFLEMIG	NQVQSVKISC
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як апоптоз. Секретований назовні.

Література

Morinaga T., Nakagawa N., Yasuda H., Tsuda E., Higashio K. (1998). Cloning and characterization of the gene encoding human osteoprotegerin/osteoclastogenesis-inhibitory factor. Eur. J. Biochem. 254: 685—691. PMID 9688283 DOI:10.1046/j.1432-1327.1998.2540685.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Hofbauer L.C., Neubauer A., Heufelder A.E. (2001). Receptor activator of nuclear factor-kappaB ligand and osteoprotegerin: potential implications for the pathogenesis and treatment of malignant bone diseases. Cancer. 92: 460—470. PMID 11505389 DOI:10.1002/1097-0142(20010801)92:3<460::AID-CNCR1344>3.0.CO;2-D
He Z.-Y., Yang G.-Z., Zhang W.-J., Wu X.-F. (1999). Cloning and expression of a novel mutated osteoprogerin/osteoclastogenesis inhibitory factor gene. Sheng Wu Hua Xue Yu Sheng Wu Wu Li Xue Bao. 31: 680—684. PMID 12110935

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TNFRSF11B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11909 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, O00300 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.