TPR

Ідентифікатори

Символи

TPR, translocated promoter region, nuclear basket protein

Зовнішні ІД

OMIM: 189940 MGI: 1922066 HomoloGene: 37753 GeneCards: TPR

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity • tubulin binding • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore • heat shock protein binding • mRNA binding • protein homodimerization activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • dynein complex binding • protein-membrane adaptor activity • mitogen-activated protein kinase binding • RNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ядерна мембрана • nuclear envelope • nuclear periphery • мембрана • цитоскелет • клітинне ядро • кінетохор • nuclear inclusion body • центромера • веретено поділу • нуклеоплазма • хромосома • mitotic spindle • extrinsic component of membrane • ядерна пора • cytoplasmic dynein complex • nuclear pore nuclear basket • host cell
Біологічний процес	• positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint • nuclear pore complex assembly • protein import into nucleus • RNA export from nucleus • клітинний цикл • mRNA transport • regulation of protein stability • regulation of protein export from nucleus • viral transcription • RNA import into nucleus • protein sumoylation • positive regulation of protein export from nucleus • mitotic nuclear membrane disassembly • protein export from nucleus • regulation of protein import into nucleus • protein transport • positive regulation of protein import into nucleus • GO:0022415 viral process • negative regulation of RNA export from nucleus • nuclear pore organization • mRNA export from nucleus in response to heat stress • positive regulation of intracellular protein transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of mitotic sister chromatid separation • mitotic spindle assembly checkpoint signaling • response to epidermal growth factor • cellular response to interferon-alpha • negative regulation of translational initiation • regulation of mRNA export from nucleus • positive regulation of heterochromatin assembly • regulation of mitotic spindle assembly • поділ клітини • regulation of cellular response to heat • nuclear matrix organization • GO:0046795 intracellular transport of virus • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • cellular response to heat • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • regulation of glycolytic process • GO:0015915 транспорт • regulation of protein localization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7175


108989

Ensembl


ENSG00000047410


ENSMUSG00000006005

UniProt


P12270 Q5SWX9


F6ZDS4

RefSeq (мРНК)


NM_003292


NM_133780

RefSeq (білок)


NP_003283


NP_598541

Локус (UCSC)

Хр. 1: 186.31 – 186.38 Mb

Хр. 1: 150.27 – 150.33 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TPR (англ. Translocated promoter region, nuclear basket protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 363 амінокислот, а молекулярна маса — 267 293^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAVLQQVLE	RTELNKLPKS	VQNKLEKFLA	DQQSEIDGLK	GRHEKFKVES
EQQYFEIEKR	LSHSQERLVN	ETRECQSLRL	ELEKLNNQLK	ALTEKNKELE
IAQDRNIAIQ	SQFTRTKEEL	EAEKRDLIRT	NERLSQELEY	LTEDVKRLNE
KLKESNTTKG	ELQLKLDELQ	ASDVSVKYRE	KRLEQEKELL	HSQNTWLNTE
LKTKTDELLA	LGREKGNEIL	ELKCNLENKK	EEVSRLEEQM	NGLKTSNEHL
QKHVEDLLTK	LKEAKEQQAS	MEEKFHNELN	AHIKLSNLYK	SAADDSEAKS
NELTRAVEEL	HKLLKEAGEA	NKAIQDHLLE	VEQSKDQMEK	EMLEKIGRLE
KELENANDLL	SATKRKGAIL	SEEELAAMSP	TAAAVAKIVK	PGMKLTELYN
AYVETQDQLL	LEKLENKRIN	KYLDEIVKEV	EAKAPILKRQ	REEYERAQKA
VASLSVKLEQ	AMKEIQRLQE	DTDKANKQSS	VLERDNRRME	IQVKDLSQQI
RVLLMELEEA	RGNHVIRDEE	VSSADISSSS	EVISQHLVSY	RNIEELQQQN
QRLLVALREL	GETREREEQE	TTSSKITELQ	LKLESALTEL	EQLRKSRQHQ
MQLVDSIVRQ	RDMYRILLSQ	TTGVAIPLHA	SSLDDVSLAS	TPKRPSTSQT
VSTPAPVPVI	ESTEAIEAKA	ALKQLQEIFE	NYKKEKAENE	KIQNEQLEKL
QEQVTDLRSQ	NTKISTQLDF	ASKRYEMLQD	NVEGYRREIT	SLHERNQKLT
ATTQKQEQII	NTMTQDLRGA	NEKLAVAEVR	AENLKKEKEM	LKLSEVRLSQ
QRESLLAEQR	GQNLLLTNLQ	TIQGILERSE	TETKQRLSSQ	IEKLEHEISH
LKKKLENEVE	QRHTLTRNLD	VQLLDTKRQL	DTETNLHLNT	KELLKNAQKE
IATLKQHLSN	MEVQVASQSS	QRTGKGQPSN	KEDVDDLVSQ	LRQTEEQVND
LKERLKTSTS	NVEQYQAMVT	SLEESLNKEK	QVTEEVRKNI	EVRLKESAEF
QTQLEKKLME	VEKEKQELQD	DKRRAIESME	QQLSELKKTL	SSVQNEVQEA
LQRASTALSN	EQQARRDCQE	QAKIAVEAQN	KYERELMLHA	ADVEALQAAK
EQVSKMASVR	QHLEETTQKA	ESQLLECKAS	WEERERMLKD	EVSKCVCRCE
DLEKQNRLLH	DQIEKLSDKV	VASVKEGVQG	PLNVSLSEEG	KSQEQILEIL
RFIRREKEIA	ETRFEVAQVE	SLRYRQRVEL	LERELQELQD	SLNAEREKVQ
VTAKTMAQHE	ELMKKTETMN	VVMETNKMLR	EEKERLEQDL	QQMQAKVRKL
ELDILPLQEA	NAELSEKSGM	LQAEKKLLEE	DVKRWKARNQ	HLVSQQKDPD
TEEYRKLLSE	KEVHTKRIQQ	LTEEIGRLKA	EIARSNASLT	NNQNLIQSLK
EDLNKVRTEK	ETIQKDLDAK	IIDIQEKVKT	ITQVKKIGRR	YKTQYEELKA
QQDKVMETSA	QSSGDHQEQH	VSVQEMQELK	ETLNQAETKS	KSLESQVENL
QKTLSEKETE	ARNLQEQTVQ	LQSELSRLRQ	DLQDRTTQEE	QLRQQITEKE
EKTRKAIVAA	KSKIAHLAGV	KDQLTKENEE	LKQRNGALDQ	QKDELDVRIT
ALKSQYEGRI	SRLERELREH	QERHLEQRDE	PQEPSNKVPE	QQRQITLKTT
PASGERGIAS	TSDPPTANIK	PTPVVSTPSK	VTAAAMAGNK	STPRASIRPM
VTPATVTNPT	TTPTATVMPT	TQVESQEAMQ	SEGPVEHVPV	FGSTSGSVRS
TSPNVQPSIS	QPILTVQQQT	QATAFVQPTQ	QSHPQIEPAN	QELSSNIVEV
VQSSPVERPS	TSTAVFGTVS	ATPSSSLPKR	TREEEEDSTI	EASDQVSDDT
VEMPLPKKLK	SVTPVGTEEE	VMAEESTDGE	VETQVYNQDS	QDSIGEGVTQ
GDYTPMEDSE	ETSQSLQIDL	GPLQSDQQTT	TSSQDGQGKG	DDVIVIDSDD
EEEDDDENDG	EHEDYEEDEE	DDDDDEDDTG	MGDEGEDSNE	GTGSADGNDG
YEADDAEGGD	GTDPGTETEE	SMGGGEGNHR	AADSQNSGEG	NTGAAESSFS
QEVSREQQPS	SASERQAPRA	PQSPRRPPHP	LPPRLTIHAP	PQELGPPVQR
IQMTRRQSVG	RGLQLTPGIG	GMQQHFFDDE	DRTVPSTPTL	VVPHRTDGFA
EAIHSPQVAG	VPRFRFGPPE	DMPQTSSSHS	DLGQLASQGG	LGMYETPLFL
AHEEESGGRS	VPTTPLQVAA	PVTVFTESTT	SDASEHASQS	VPMVTTSTGT
LSTTNETATG	DDGDEVFVEA	ESEGISSEAG	LEIDSQQEEE	PVQASDESDL
PSTSQDPPSS	SSVDTSSSQP	KPFRRVRLQT	TLRQGVRGRQ	FNRQRGVSHA
MGGRGGINRG	NIN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, транспорт мРНК, транслокація. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, хромосомах, комплексі ядерної пори, центромерах, кінетохорі.

Література

Cordes V.C., Reidenbach S., Rackwitz H.R., Franke W.W. (1997). Identification of protein p270/Tpr as a constitutive component of the nuclear pore complex-attached intranuclear filaments. J. Cell Biol. 136: 515—529. PMID 9024684 DOI:10.1083/jcb.136.3.515
Soman N.R., Wogan G.N., Rhim J.S. (1990). TPR-MET oncogenic rearrangement: detection by polymerase chain reaction amplification of the transcript and expression in human tumor cell lines. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 738—742. PMID 2300559 DOI:10.1073/pnas.87.2.738
Cordes V.C., Hase M.E., Muller L. (1998). Molecular segments of protein Tpr that confer nuclear targeting and association with the nuclear pore complex. Exp. Cell Res. 245: 43—56. PMID 9828100 DOI:10.1006/excr.1998.4246
Hase M.E., Kuznetsov N.V., Cordes V.C. (2001). Amino acid substitutions of coiled-coil protein Tpr abrogate anchorage to the nuclear pore complex but not parallel, in-register homodimerization. Mol. Biol. Cell. 12: 2433—2452. PMID 11514627 DOI:10.1091/mbc.12.8.2433
Shibata S., Matsuoka Y., Yoneda Y. (2002). Nucleocytoplasmic transport of proteins and poly(A)+ RNA in reconstituted Tpr-less nuclei in living mammalian cells. Genes Cells. 7: 421—434. PMID 11952838 DOI:10.1046/j.1365-2443.2002.00525.x
Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export. J. Cell Biol. 156: 617—630. PMID 11839768 DOI:10.1083/jcb.200106046

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12017 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P12270 (англ.) . Архів оригіналу за 1 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.