TRAF3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1FLK, 1FLL, 1KZZ, 1L0A, 1RF3, 1ZMS, 2ECY, 2GKW

Ідентифікатори

Символи

TRAF3, CAP-1, CAP1, CD40bp, CRAF1, IIAE5, LAP1, TNF receptor associated factor 3, RNF118

Зовнішні ІД

OMIM: 601896 MGI: 108041 HomoloGene: 7981 GeneCards: TRAF3

Пов'язані генетичні захворювання

шизофренія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • protein phosphatase binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мітохондрія • cytoplasmic side of plasma membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • Toll signaling pathway • процес імунної системи • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • regulation of proteolysis • GO:0097285 апоптоз • toll-like receptor signaling pathway • GO:0032657 regulation of cytokine production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of interferon-beta production • вроджений імунітет • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of defense response to virus • protein deubiquitination
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7187


22031

Ensembl


ENSG00000131323


ENSMUSG00000021277

UniProt


Q13114


Q60803

RefSeq (мРНК)

NM_001199427 NM_003300 NM_145725 NM_145726 NM_001385142
NM_001385143


NM_001048206 NM_001286122 NM_011632 NM_001364364

RefSeq (білок)


NP_001186356 NP_003291 NP_663777 NP_663778


NP_001273051 NP_035762 NP_001351293

Локус (UCSC)

Хр. 14: 102.78 – 102.91 Mb

Хр. 12: 111.13 – 111.23 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAF3 (англ. TNF receptor associated factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 568 амінокислот, а молекулярна маса — 64 490^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESSKKMDSP	GALQTNPPLK	LHTDRSAGTP	VFVPEQGGYK	EKFVKTVEDK
YKCEKCHLVL	CSPKQTECGH	RFCESCMAAL	LSSSSPKCTA	CQESIVKDKV
FKDNCCKREI	LALQIYCRNE	SRGCAEQLML	GHLLVHLKND	CHFEELPCVR
PDCKEKVLRK	DLRDHVEKAC	KYREATCSHC	KSQVPMIALQ	KHEDTDCPCV
VVSCPHKCSV	QTLLRSELSA	HLSECVNAPS	TCSFKRYGCV	FQGTNQQIKA
HEASSAVQHV	NLLKEWSNSL	EKKVSLLQNE	SVEKNKSIQS	LHNQICSFEI
EIERQKEMLR	NNESKILHLQ	RVIDSQAEKL	KELDKEIRPF	RQNWEEADSM
KSSVESLQNR	VTELESVDKS	AGQVARNTGL	LESQLSRHDQ	MLSVHDIRLA
DMDLRFQVLE	TASYNGVLIW	KIRDYKRRKQ	EAVMGKTLSL	YSQPFYTGYF
GYKMCARVYL	NGDGMGKGTH	LSLFFVIMRG	EYDALLPWPF	KQKVTLMLMD
QGSSRRHLGD	AFKPDPNSSS	FKKPTGEMNI	ASGCPVFVAQ	TVLENGTYIK
DDTIFIKVIV	DTSDLPDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, ендосомах.

Література

Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Boucher L.-M., Marengere L.E., Lu Y., Thukral S., Mak T.W. (1997). Binding sites of cytoplasmic effectors TRAF1, 2, and 3 on CD30 and other members of the TNF receptor superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 592—600. PMID 9168896 DOI:10.1006/bbrc.1997.6509
Song H.Y., Regnier C.H., Kirschning C.J., Goeddel D.V., Rothe M. (1997). Tumor necrosis factor (TNF)-mediated kinase cascades: bifurcation of nuclear factor-kappaB and c-jun N-terminal kinase (JNK/SAPK) pathways at TNF receptor-associated factor 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9792—9796. PMID 9275204 DOI:10.1073/pnas.94.18.9792
Kawamata S., Hori T., Imura A., Takaori-Kondo A., Uchiyama T. (1998). Activation of OX40 signal transduction pathways leads to tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 2- and TRAF5-mediated NF-kappaB activation. J. Biol. Chem. 273: 5808—5814. PMID 9488716 DOI:10.1074/jbc.273.10.5808
Arch R.H., Thompson C.B. (1998). 4-1BB and Ox40 are members of a tumor necrosis factor (TNF)-nerve growth factor receptor subfamily that bind TNF receptor-associated factors and activate nuclear factor kappaB. Mol. Cell. Biol. 18: 558—565. PMID 9418902 DOI:10.1128/MCB.18.1.558

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRAF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12033 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13114 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.