TRAF3 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/53/Protein_TRAF3_PDB_1flk.png/250px-Protein_TRAF3_PDB_1flk.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1FLK, 1FLL, 1KZZ, 1L0A, 1RF3, 1ZMS, 2ECY, 2GKW | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TRAF3, CAP-1, CAP1, CD40bp, CRAF1, IIAE5, LAP1, TNF receptor associated factor 3, RNF118 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601896 MGI: 108041 HomoloGene: 7981 GeneCards: TRAF3 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
шизофренія[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • protein phosphatase binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мітохондрія • cytoplasmic side of plasma membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex |
---|
Біологічний процес | • regulation of apoptotic process • Toll signaling pathway • процес імунної системи • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • regulation of proteolysis • GO:0097285 апоптоз • toll-like receptor signaling pathway • GO:0032657 regulation of cytokine production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of interferon-beta production • вроджений імунітет • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of defense response to virus • protein deubiquitination |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2a/PBB_GE_TRAF3_208315_x_at_fs.png/250px-PBB_GE_TRAF3_208315_x_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001199427 NM_003300 NM_145725 NM_145726 NM_001385142
| NM_001385143 |
| | NM_001048206 NM_001286122 NM_011632 NM_001364364 |
|
---|
RefSeq (білок) | | NP_001186356 NP_003291 NP_663777 NP_663778 |
| | NP_001273051 NP_035762 NP_001351293 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 14: 102.78 – 102.91 Mb | Хр. 12: 111.13 – 111.23 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TRAF3 (англ. TNF receptor associated factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 568 амінокислот, а молекулярна маса — 64 490[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MESSKKMDSP | | GALQTNPPLK | | LHTDRSAGTP | | VFVPEQGGYK | | EKFVKTVEDK |
YKCEKCHLVL | | CSPKQTECGH | | RFCESCMAAL | | LSSSSPKCTA | | CQESIVKDKV |
FKDNCCKREI | | LALQIYCRNE | | SRGCAEQLML | | GHLLVHLKND | | CHFEELPCVR |
PDCKEKVLRK | | DLRDHVEKAC | | KYREATCSHC | | KSQVPMIALQ | | KHEDTDCPCV |
VVSCPHKCSV | | QTLLRSELSA | | HLSECVNAPS | | TCSFKRYGCV | | FQGTNQQIKA |
HEASSAVQHV | | NLLKEWSNSL | | EKKVSLLQNE | | SVEKNKSIQS | | LHNQICSFEI |
EIERQKEMLR | | NNESKILHLQ | | RVIDSQAEKL | | KELDKEIRPF | | RQNWEEADSM |
KSSVESLQNR | | VTELESVDKS | | AGQVARNTGL | | LESQLSRHDQ | | MLSVHDIRLA |
DMDLRFQVLE | | TASYNGVLIW | | KIRDYKRRKQ | | EAVMGKTLSL | | YSQPFYTGYF |
GYKMCARVYL | | NGDGMGKGTH | | LSLFFVIMRG | | EYDALLPWPF | | KQKVTLMLMD |
QGSSRRHLGD | | AFKPDPNSSS | | FKKPTGEMNI | | ASGCPVFVAQ | | TVLENGTYIK |
DDTIFIKVIV | | DTSDLPDP |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, ендосомах.
Література
- Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 DOI:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Boucher L.-M., Marengere L.E., Lu Y., Thukral S., Mak T.W. (1997). Binding sites of cytoplasmic effectors TRAF1, 2, and 3 on CD30 and other members of the TNF receptor superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 592—600. PMID 9168896 DOI:10.1006/bbrc.1997.6509
- Song H.Y., Regnier C.H., Kirschning C.J., Goeddel D.V., Rothe M. (1997). Tumor necrosis factor (TNF)-mediated kinase cascades: bifurcation of nuclear factor-kappaB and c-jun N-terminal kinase (JNK/SAPK) pathways at TNF receptor-associated factor 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9792—9796. PMID 9275204 DOI:10.1073/pnas.94.18.9792
- Kawamata S., Hori T., Imura A., Takaori-Kondo A., Uchiyama T. (1998). Activation of OX40 signal transduction pathways leads to tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 2- and TRAF5-mediated NF-kappaB activation. J. Biol. Chem. 273: 5808—5814. PMID 9488716 DOI:10.1074/jbc.273.10.5808
- Arch R.H., Thompson C.B. (1998). 4-1BB and Ox40 are members of a tumor necrosis factor (TNF)-nerve growth factor receptor subfamily that bind TNF receptor-associated factors and activate nuclear factor kappaB. Mol. Cell. Biol. 18: 558—565. PMID 9418902 DOI:10.1128/MCB.18.1.558
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRAF3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12033 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13114 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |