TRAF6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1LB4, 1LB5, 1LB6, 2ECI, 2JMD, 3HCS, 3HCT, 3HCU, 4Z8M

Ідентифікатори

Символи

TRAF6, MGC:3310, RNF85, TNF receptor associated factor 6

Зовнішні ІД

OMIM: 602355 MGI: 108072 HomoloGene: 3395 GeneCards: TRAF6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein N-terminus binding • histone deacetylase binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thioesterase binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • protein kinase binding • protein kinase B binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • identical protein binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • lipid droplet • perinuclear region of cytoplasm • cytoplasmic side of plasma membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • cell cortex • endosome membrane • CD40 receptor complex • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to interleukin-1 • toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • odontogenesis of dentin-containing tooth • animal organ morphogenesis • T-helper 1 type immune response • toll-like receptor 9 signaling pathway • regulation of apoptotic process • осифікація • cytokine-mediated signaling pathway • osteoclast differentiation • positive regulation of osteoclast differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • кісткова резорбція • JNK cascade • membrane protein intracellular domain proteolysis • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of T cell proliferation • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • protein autoubiquitination • процес імунної системи • positive regulation of JUN kinase activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-2 production • positive regulation of T cell cytokine production • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • розвиток клітин • protein K63-linked ubiquitination • myeloid dendritic cell differentiation • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • neural tube closure • bone remodeling • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • cellular response to lipopolysaccharide • T cell receptor signaling pathway • activation of protein kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • cellular response to DNA damage stimulus • protein deubiquitination • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to cytokine stimulus • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7189


22034

Ensembl


ENSG00000175104


ENSMUSG00000027164

UniProt


Q9Y4K3


P70196

RefSeq (мРНК)


NM_145803 NM_004620


NM_009424 NM_001303273

RefSeq (білок)


NP_004611 NP_665802


NP_001290202 NP_033450

Локус (UCSC)

Хр. 11: 36.48 – 36.51 Mb

Хр. 2: 101.51 – 101.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAF6 (англ. TNF receptor associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 59 573^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLLNCENSC	GSSQSESDCC	VAMASSCSAV	TKDDSVGGTA	STGNLSSSFM
EEIQGYDVEF	DPPLESKYEC	PICLMALREA	VQTPCGHRFC	KACIIKSIRD
AGHKCPVDNE	ILLENQLFPD	NFAKREILSL	MVKCPNEGCL	HKMELRHLED
HQAHCEFALM	DCPQCQRPFQ	KFHINIHILK	DCPRRQVSCD	NCAASMAFED
KEIHDQNCPL	ANVICEYCNT	ILIREQMPNH	YDLDCPTAPI	PCTFSTFGCH
EKMQRNHLAR	HLQENTQSHM	RMLAQAVHSL	SVIPDSGYIS	EVRNFQETIH
QLEGRLVRQD	HQIRELTAKM	ETQSMYVSEL	KRTIRTLEDK	VAEIEAQQCN
GIYIWKIGNF	GMHLKCQEEE	KPVVIHSPGF	YTGKPGYKLC	MRLHLQLPTA
QRCANYISLF	VHTMQGEYDS	HLPWPFQGTI	RLTILDQSEA	PVRQNHEEIM
DAKPELLAFQ	RPTIPRNPKG	FGYVTFMHLE	ALRQRTFIKD	DTLLVRCEVS
TRFDMGSLRR	EGFQPRSTDA	GV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, пошкодження ДНК, убіквітинування білків, остеогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ліпідних краплях.

Література

Cao Z., Xiong J., Takeuchi M., Kurama T., Goeddel D.V. (1996). TRAF6 is a signal transducer for interleukin-1. Nature. 383: 443—446. PMID 8837778 DOI:10.1038/383443a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Malinin N.L., Boldin M.P., Kovalenko A.V., Wallach D. (1997). MAP3K-related kinase involved in NF-kappaB induction by TNF, CD95 and IL-1. Nature. 385: 540—544. PMID 9020361 DOI:10.1038/385540a0
Muzio M., Ni J., Feng P., Dixit V.M. (1997). IRAK (Pelle) family member IRAK-2 and MyD88 as proximal mediators of IL-1 signaling. Science. 278: 1612—1615. PMID 9374458 DOI:10.1126/science.278.5343.1612
McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6. J. Biol. Chem. 274: 2597—2600. PMID 9915784 DOI:10.1074/jbc.274.5.2597

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12036 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4K3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.