TROVE2

Ідентифікатори

Символи

RO60, RORNP, SSA2, TROVE domain family member 2, Ro60, Y RNA binding protein, TROVE2

Зовнішні ІД

OMIM: 600063 MGI: 106652 HomoloGene: 3383 GeneCards: RO60

Онтологія гена
Молекулярна функція	• U2 snRNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• immune system development • transcription by RNA polymerase III • smoothened signaling pathway • response to UV • cilium assembly • cell projection organization • регуляція експресії генів • cellular response to interferon-alpha
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6738


20822

Ensembl


ENSG00000116747


ENSMUSG00000018199

UniProt


P10155


O08848

RefSeq (мРНК)

NM_001042369 NM_001042370 NM_001173524 NM_001173525 NM_004600
NM_001331020


NM_013835

RefSeq (білок)

NP_001035828 NP_001035829 NP_001166995 NP_001166996 NP_001317949
NP_004591


NP_038863

Локус (UCSC)

Хр. 1: 193.06 – 193.09 Mb

Хр. 1: 143.63 – 143.65 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TROVE2 (англ. TROVE domain family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 60 671^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEESVNQMQP	LNEKQIANSQ	DGYVWQVTDM	NRLHRFLCFG	SEGGTYYIKE
QKLGLENAEA	LIRLIEDGRG	CEVIQEIKSF	SQEGRTTKQE	PMLFALAICS
QCSDISTKQA	AFKAVSEVCR	IPTHLFTFIQ	FKKDLKESMK	CGMWGRALRK
AIADWYNEKG	GMALALAVTK	YKQRNGWSHK	DLLRLSHLKP	SSEGLAIVTK
YITKGWKEVH	ELYKEKALSV	ETEKLLKYLE	AVEKVKRTRD	ELEVIHLIEE
HRLVREHLLT	NHLKSKEVWK	ALLQEMPLTA	LLRNLGKMTA	NSVLEPGNSE
VSLVCEKLCN	EKLLKKARIH	PFHILIALET	YKTGHGLRGK	LKWRPDEEIL
KALDAAFYKT	FKTVEPTGKR	FLLAVDVSAS	MNQRVLGSIL	NASTVAAAMC
MVVTRTEKDS	YVVAFSDEMV	PCPVTTDMTL	QQVLMAMSQI	PAGGTDCSLP
MIWAQKTNTP	ADVFIVFTDN	ETFAGGVHPA	IALREYRKKM	DIPAKLIVCG
MTSNGFTIAD	PDDRGMLDMC	GFDTGALDVI	RNFTLDMI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біогенез та деградація війок, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Deutscher S.L., Harley J.B., Keene J.D. (1988). Molecular analysis of the 60-kDa human Ro ribonucleoprotein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 9479—9483. PMID 3200833 DOI:10.1073/pnas.85.24.9479
Ben-Chetrit E., Gandy B.J., Tan E.M., Sulivan K.F. (1989). Isolation and characterization of a cDNA clone encoding the 60-kD component of the human SS-A/Ro ribonucleoprotein autoantigen. J. Clin. Invest. 83: 1284—1292. PMID 2649513 DOI:10.1172/JCI114013
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang D., Buyon J.P., Zhu W., Chan E.K.L. (1999). Defining a novel 75-kDa phosphoprotein associated with SS-A/Ro and identification of distinct human autoantibodies. J. Clin. Invest. 104: 1265—1275. PMID 10545525 DOI:10.1172/JCI8003
Bouffard P., Barbar E., Briere F., Boire G. (2000). Interaction cloning and characterization of RoBPI, a novel protein binding to human Ro ribonucleoproteins. RNA. 6: 66—78. PMID 10668799 DOI:10.1017/S1355838200990277
Hogg J.R., Collins K. (2007). Human Y5 RNA specializes a Ro ribonucleoprotein for 5S ribosomal RNA quality control. Genes Dev. 21: 3067—3072. PMID 18056422 DOI:10.1101/gad.1603907

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11313 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P10155 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.