TTC3

Ідентифікатори

Символи

TTC3, DCRR1, RNF105, TPRDIII, tetratricopeptide repeat domain 3

Зовнішні ІД

OMIM: 602259 MGI: 1276539 HomoloGene: 2487 GeneCards: TTC3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein K48-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7267


22129

Ensembl


ENSG00000182670


ENSMUSG00000040785

UniProt


P53804


O88196

RefSeq (мРНК)

NM_001001894 NM_003316 NM_001320703 NM_001320704 NM_001330681
NM_001330682 NM_001330683 NM_001353936 NM_001353937 NM_001353938


NM_009441

RefSeq (білок)

NP_001001894 NP_001307632 NP_001307633 NP_001317610 NP_001317611
NP_001317612 NP_003307 NP_001340865 NP_001340866 NP_001340867

XP_011249721.1 XP_011249722.1 XP_011249724.1 XP_011249725.1 XP_011249730.1
XP_011249731.1 XP_011249732.1 XP_011249733.1

Локус (UCSC)

Хр. 21: 37.07 – 37.2 Mb

Хр. 16: 94.37 – 94.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TTC3 (англ. Tetratricopeptide repeat domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 025 амінокислот, а молекулярна маса — 229 869^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDNFAEGDFT	VADYALLEDC	PHVDDCVFAA	EFMSNDYVRV	TQLYCDGVGV
QYKDYIQSER	NLEFDICSIW	CSKPISVLQD	YCDAIKINIF	WPLLFQHQNS
SVISRLHPCV	DANNSRASEI	NLKKLQHLEL	MEDIVDLAKK	VANDSFLIGG
LLRIGCKIEN	KILAMEEALN	WIKYAGDVTI	LTKLGSIDNC	WPMLSIFFTE
YKYHITKIVM	EDCNLLEELK	TQSCMDCIEE	GELMKMKGNE	EFSKERFDIA
IIYYTRAIEY	RPENYLLYGN	RALCFLRTGQ	FRNALGDGKR	ATILKNTWPK
GHYRYCDALS	MLGEYDWALQ	ANIKAQKLCK	NDPEGIKDLI	QQHVKLQKQI
EDLQGRTANK	DPIKAFYENR	AYTPRSLSAP	IFTTSLNFVE	KERDFRKINH
EMANGGNQNL	KVADEALKVD	DCDCHPEFSP	PSSQPPKHKG	KQKSRNNESE
KFSSSSPLTL	PADLKNILEK	QFSKSSRAAH	QDFANIMKML	RSLIQDGYMA
LLEQRCRSAA	QAFTELLNGL	DPQKIKQLNL	AMINYVLVVY	GLAISLLGIG
QPEELSEAEN	QFKRIIEHYP	SEGLDCLAYC	GIGKVYLKKN	RFLEALNHFE
KARTLIYRLP	GVLTWPTSNV	IIEESQPQKI	KMLLEKFVEE	CKFPPVPDAI
CCYQKCHGYS	KIQIYITDPD	FKGFIRISCC	QYCKIEFHMN	CWKKLKTTTF
NDKIDKDFLQ	GICLTPDCEG	VISKIIIFSS	GGEVKCEFEH	KVIKEKVPPR
PILKQKCSSL	EKLRLKEDKK	LKRKIQKKEA	KKLAQERMEE	DLRESNPPKN
EEQKETVDNV	QRCQFLDDRI	LQCIKQYADK	IKSGIQNTAM	LLKELLSWKV
LSTEDYTTCF	SSRNFLNEAV	DYVIRHLIQE	NNRVKTRIFL	HVLSELKEVE
PKLAAWIQKL	NSFGLDATGT	FFSRYGASLK	LLDFSIMTFL	WNEKYGHKLD
SIEGKQLDYF	SEPASLKEAR	CLIWLLEEHR	DKFPALHSAL	DEFFDIMDSR
CTVLRKQDSG	EAPFSSTKVK	NKSKKKKPKD	SKPMLVGSGT	TSVTSNNEII
TSSEDHSNRN	SDSAGPFAVP	DHLRQDVEEF	EALYDQHSNE	YVVRNKKLWD
MNPKQKCSTL	YDYFSQFLEE	HGPLDMSNKM	FSAEYEFFPE	ETRQILEKAG
GLKPFLLGCP	RFVVIDNCIA	LKKVASRLKK	KRKKKNIKTK	VEEISKAGEY
VRVKLQLNPA	AREFKPDVKS	KPVSDSSSAP	AFENVKPKPV	SANSPKPACE
DVKAKPVSDN	SSRQVSEDGQ	PKGVSSNSPK	PGSEDANYKR	VSCNSPKPVL
EDVKPTYWAQ	SHLVTGYCTY	LPFQRFDITQ	TPPAYINVLP	GLPQYTSIYT
PLASLSPEYQ	LPRSVPVVPS	FVANDRADKN	AAAYFEGHHL	NAENVAGHQI
ASETQILEGS	LGISVKSHCS	TGDAHTVLSE	SNRNDEHCGN	SNNKCEVIPE
STSAVTNIPH	VQMVAIQVSW	NIIHQEVNTE	PYNPFEERQG	EISRIEKEHQ
VLQDQLQEVY	ENYEQIKLKG	LEETRDLEEK	LKRHLEENKI	SKTELDWFLQ
DLEREIKKWQ	QEKKEIQERL	KSLKKKIKKV	SNASEMYTQK	NDGKEKEHEL
HLDQSLEISN	TLTNEKMKIE	EYIKKGKEDY	EESHQRAVAA	EVSVLENWKE
SEVYKLQIME	SQAEAFLKKL	GLISRDPAAY	PDMESDIRSW	ELFLSNVTKE
IEKAKSQFEE	QIKAIKNGSR	LSELSKVQIS	ELSFPACNTV	HPELLPESSG
DDGQGLVTSA	SDVTGNHAAL	HRDPSVFSAG	DSPGEAPSAL	LPGPPPGQPE
ATQLTGPKRA	GQAALSERSP	VADRKQPVPP	GRAARSSQSP	KKPFNSIIEH
LSVVFPCYNS	TELAGFIKKV	RSKNKNSLSG	LSIDEIVQRV	TEHILDEQKK
KKPNPGKDKR	TYEPSSATPV	TRSSQGSPSV	VVAPSPKTKG	QKAEDVPVRI
ALGASSCEIC	HEVFKSKNVR	VLKCGHKYHK	GCFKQWLKGQ	SACPACQGRD
LLTEESPSGR	GWPSQNQELP	SCSSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Tsukahara F., Hattori M., Muraki T., Sakaki Y. (1996). Identification and cloning of a novel cDNA belonging to tetratricopeptide repeat gene family from Down syndrome-critical region 21q22.2. J. Biochem. 120: 820—827. PMID 8947847 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021485
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12393 (англ.) . Архів оригіналу за 10 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P53804 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.