USP6NL

Ідентифікатори

Символи

USP6NL, RNTRE, TRE2NL, USP6NL-IT1, USP6 N-terminal like

Зовнішні ІД

OMIM: 605405 MGI: 2138893 HomoloGene: 6879 GeneCards: USP6NL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • система ендомембран • trans-Golgi network membrane
Біологічний процес	• regulation of cilium assembly • retrograde transport, plasma membrane to Golgi • regulation of Golgi organization • Golgi organization • plasma membrane to endosome transport • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • regulation of vesicle fusion • intracellular protein transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9712


98910

Ensembl


ENSG00000148429


ENSMUSG00000039046

UniProt


Q92738


Q80XC3

RefSeq (мРНК)


NM_001080491 NM_014688 NM_001391959 NM_001391960 NM_001391961


NM_001080548 NM_181399

RefSeq (білок)


NP_001073960 NP_055503


NP_001074017 NP_852064

Локус (UCSC)

Хр. 10: 11.46 – 11.61 Mb

Хр. 2: 6.33 – 6.45 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

USP6NL (англ. USP6 N-terminal like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 94 104^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNSDQDVALK	LAQERAEIVA	KYDRGREGAE	IEPWEDADYL	VYKVTDRFGF
LHEEELPDHN	VAVERQKHLE	IERTTKWLKM	LKGWEKYKNT	EKFHRRIYKG
IPLQLRGEVW	ALLLEIPKMK	EETRDLYSKL	KHRARGCSPD	IRQIDLDVNR
TFRDHIMFRD	RYGVKQQSLF	HVLAAYSIYN	TEVGYCQGMS	QITALLLMYM
NEEDAFWALV	KLFSGPKHAM	HGFFVQGFPK	LLRFQEHHEK	ILNKFLSKLK
QHLDSQEIYT	SFYTMKWFFQ	CFLDRTPFTL	NLRIWDIYIF	EGERVLTAMS
YTILKLHKKH	LMKLSMEELV	EFFQETLAKD	FFFEDDFVIE	QLQISMTELK
RAKLDLPEPG	KEDEYPKKPL	GQLPPELQSW	GVHHLSNGQR	SVGRPSPLAS
GRRESGAPHR	RHEHSPHPQS	RTGTPERAQP	PRRKSVEEES	KKLKDEADFQ
RKLPSGPQDS	SRQYNHAAAN	QNSNATSNIR	KEFVPKWNKP	SDVSATERTA
KYTMEGKGRA	AHPALAVTVP	GPAEVRVSNV	RPKMKALDAE	DGKRGSTASQ
YDNVPGPELD	SGASVEEALE	RAYSQSPRHA	LYPPSPRKHA	EPSSSPSKVS
NKFTFKVQPP	SHARYPSQLD	GEARGLAHPP	SYSNPPVYHG	NSPKHFPTAN
SSFASPQFSP	GTQLNPSRRP	HGSTLSVSAS	PEKSYSRPSP	LVLPSSRIEV
LPVDTGAGGY	SGNSGSPKNG	KLIIPPVDYL	PDNRTWSEVS	YTYRPETQGQ
SWTRDASRGN	LPKYSAFQLA	PFQDHGLPAV	SVDSPVRYKA	SPAAEDASPS
GYPYSGPPPP	AYHYRNRDGL	SIQESVLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. (1996). Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery. Genome Res. 6: 791—806. PMID 8889548 DOI:10.1101/gr.6.9.791

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16858 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q92738 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.