VAMP1

Ідентифікатори

Символи

VAMP1, SPAX1, SYB1, VAMP-1, vesicle associated membrane protein 1, CMS25

Зовнішні ІД

OMIM: 185880 MGI: 1313276 HomoloGene: 40678 GeneCards: VAMP1

Пов'язані генетичні захворювання

spastic ataxia 1^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin binding
Клітинна компонента	• synaptic vesicle membrane • синапс • integral component of membrane • мітохондрія • tertiary granule membrane • azurophil granule membrane • міжклітинні контакти • integral component of plasma membrane • neuron projection • мембрана • cell surface • specific granule membrane • мітохондріальна зовнішня мембрана • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • гіалоплазма • SNARE complex • integral component of synaptic vesicle membrane • neuromuscular junction • presynapse • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• SNARE complex assembly • vesicle fusion • vesicle-mediated transport • екзоцитоз • synaptic vesicle priming • regulation of synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6843


22317

Ensembl


ENSG00000139190


ENSMUSG00000030337

UniProt


P23763


Q62442

RefSeq (мРНК)


NM_001297438 NM_014231 NM_016830 NM_199245


NM_001080557 NM_009496

RefSeq (білок)


NP_001284367 NP_055046 NP_058439 NP_954740


NP_001074026 NP_033522

Локус (UCSC)

Хр. 12: 6.46 – 6.47 Mb

Хр. 6: 125.19 – 125.22 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

VAMP1 (англ. Vesicle associated membrane protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 118 амінокислот, а молекулярна маса — 12 902^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAPAQPPAE	GTEGTAPGGG	PPGPPPNMTS	NRRLQQTQAQ	VEEVVDIIRV
NVDKVLERDQ	KLSELDDRAD	ALQAGASQFE	SSAAKLKRKY	WWKNCKMMIM
LGAICAIIVV	VIVIYFFT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, зовнішній мембрані мітохондрій, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Isenmann S., Khew-Goodall Y., Gamble J., Vadas M., Wattenberg B.W. (1998). A splice-isoform of vesicle-associated membrane protein-1 (VAMP-1) contains a mitochondrial targeting signal. Mol. Biol. Cell. 9: 1649—1660. PMID 9658161 DOI:10.1091/mbc.9.7.1649
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Archer B.T. III, Oezcelik T., Jahn R., Francke U., Suedhof T.C. (1990). Structures and chromosomal localizations of two human genes encoding synaptobrevins 1 and 2. J. Biol. Chem. 265: 17267—17273. PMID 1976629

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з VAMP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12642 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P23763 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.